| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
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No map location |  |
Predicted Genes from contig_158102
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
|---|
| MLOC_18559 |
5 |
5932 bp |
MLOC_18559.1 |
Available |
Available |
LOC_Os03g46950.1, FRAME:+3, EVALUE:0.0, 13103.m05055 protein DNA binding protein, putative, expressed |
| MLOC_18560 |
1 |
1601 bp |
MLOC_18560.1 |
Available |
Available |
LOC_Os06g09270.1, FRAME:-1, EVALUE:2e-102, 13106.m00991 protein hypro1, putative, expressed |
CDS Structure of MLOC_18559
CDS Structure of MLOC_18560
Contig Sequence (13099 bp)
>contig_158102 13099 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GGTGCGGTGCGATATCTGTGCGGCGCGGATCGCCGCTCCGCGCGAGACGGACGGCTCGAT
CTGTCCCACCACGGCGGATCGCAGCGGGCTAGGGTTTGACGAATGTCACGGCGGTAGATG
GGCCGCGCGGGCGGTGGAGATGGATGGCTGGACCTTTACGCGTGGGCCTGACTAGGCCTG
AGGCCCATGAGTGGGGCATTACGGGGTCGCGAGTCGGTCCGCCACCCGATTTGGATCGTT
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TCGCCGTCGTCCGCCTCCGCCGCGCCCCTCCCCCCCCTCGGGGCTGCCGGCGGCGCCGGG
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GTATCTATCCCAGAACATCAATGTCCCTTCCTCTTTGTCATCAGCAACTGGTGCTGCTGT
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GTCCATCCTTGATGTCTCGCCACTTCCTTTGGCCCTCGGCTATTTAAGTGATGTTGCAGG
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GTCGAAATTTTATTGTAGTCTCCATTGAGGTTGTACTGTTTTCTTTCCTGTGTTACTGTC
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TTAACTGTGCTGTCCTTTATTTTCTTGGTTATGTAACATTCTTACTCTATCTTCTGCCTG
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TAGTATTTTCATCACTTGTTTGGTGCCCTTGGTGTTGTAACAGACTTCGTCTGAATATCT
GAAAATATGAAGAAATTGAATTCATTAAAGACTCGTTATTAGAAACAAGTGTTGTTTTGA
TTGTATTGGCATGGCAGTGAGAGTTCCCACACTGCTGGGTGCTGACACTACGGCCGGCCT
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TGGCTCTTATATGCTTAATTTCAACAAAGGCTACTGCCCAAAAATCGTTGTGCTTTTGTT
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CTCCAGACCTTATGGGCAAATTCTTGTTTTTCCCAGTGCTTAGTTTAGTCTCTTGACTAA
GTTTTCAGTTGATCAAAATCCTGTTTCTCTTTGTATGCTTTATACTCTTTCAGTAACATA
TTTTTTTGTAGTGTAGATATTTGTGAGACAAAAGAACCGCAGCTCAGCGAAAGCTACGGA
CAATCCAGTCAAGGTAAGTAAAGTGTACATCTTTCCATTTACTGGCACATAAGATGATTA
ATGAATTCTTATAAGCCTTTGTGGTTCAAGAATATTTCTCAAGGTCTTGGCTGATTACGA
TAAGTATGGTGTGCCGGTTCATCCCATCGTCTAGCTTTGAATGTCCTTGCGTTGCCACGG
TACAACAAATTTAGGGCTCCTTCGATTAAAATACTTCCATAGGAATTTAGGGCCCCTTGG
ATTCAAATGATATTCTAAGTTGTGAGGCTCATGAAGAAGCATTGGCATTGTCTGAATCAC
CATTATTTTAAGGTTTTTCTTTTATGTTGATATGCAACATATGTTTTCAAAATTTCTTAC
GTGTCAACAGTAACGGACACAAAAATTCCCTGGAAAACTGTAAAAACCAACTTCTATAAT
ATGGACCATATCACATTTGGTTATTGTAATTAGAAGCAAGCTGAGAAATGATTTCTACCA
GCTCTATTTTTAAAGGGTATGAAAAAATGATGAAATTTATAATACTTTGGTGGGGCTCTA
TGATCTTACCTCTTGTCACTGGAAGTTTCAAAGAGCACCCCTGTGTGTTTTAAAATGGTA
GGTCAATATGTTCCCATGTAGCAAAAACAAACACTGGTTTGAAACTGGGATTACCTGATC
CTCATGCTCTACTGGCTGTTATGGTGATCCCCAATAGGAAGTAGATGTCTTTCCAGAAAT
CAGCTAAGCATATTCTTGTTTGAAATAATGCAGCATGTGCGTCGTATGAAGAATTCTCCA
TTGAGTAGTGAGGAAGTGCAGCGTATCGAAGAGGTGGTTATATCTTGTGTCTGCAGACTA
TCTTCTGTTCCCTGTTCAATTGGTATTTGCTTACGTTTCCCCTCATTCCTACGTTGATAC
AGGGCCTTAAGATATTCAAAAATGACTGGACATCTGTTTGGAAGTTTGTTGTGCCATACA
GAGATCCTGCACTACTCCAGCGTCAGTGGAGAGTTGCCAATGGAATTCAGCGATCTTACA
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TGATCTATTTTGCTTTCGTGACAGGCTGATAATGATGCCTCTGAGGATGTTGAAAATGAT
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TTTGAGCAGCATAAAAGAAATAGTATGCTCCACGGTGTCAACACTGCATATATACCTTTT
AGCTCTTGCGCTTCTGATGGTCCTTCGACTAAAAGGGTGTTTGGTGTGATTTTGGACGAA
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GATTTTCAAATGCATCCTTTGCTTTTTCAGCATCCTCGAGAAGTGCTTCCGTCACATAGC
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GTTCAACTTGAGGAAAGTAATAAGCAGACTACAGATGGCATGGAAGGAGCTCCTGCCAAT
GCTAATACCATCGACTTCCATCCTCTACTGCAAAGATCTGAAGCTGAGATGCATGTGGAA
GTACCAGAAGAGAACTGCCATCCACTTGCTAATCAATCTGACGGTCGTATGAGGGAACCT
CCAGTAGATGACCAGTCAACAGTTAGGGAAGCGTCCTCAAGCGAAAGAGAGATCGATGTT
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GAGGAAATGGATGATTCTGAAGATGAGCAAGCTCAGGGCACAGAACCATGTTCGACTACA
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TGCTATGCTATATGATTAAACGTCAAGCACTGCGCTACTGGTGTTTCATGATGTTTGTCA
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NNNNNNNNNNNNNTTTCACTAAGTGACTACATACGAAGCTAAATGAGTGAATCTACACTC
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GTTTTTCTTCTTCTTGAAGCTCGCTGATAACATATGCATACTTCATTTTGCAGGGAACTT
CAACATCAGTTGCTTGTTCAGAGTTGCAAGAAAACAACGACCAGTGTCAAACCCAACAAG
GATTGAAACAGGTGGCTAAACAGGGCGTGAGATCAAAACGGAAATCGCGTGGGTCTTCTA
GTGCAAGGCCGGTCAGAGCAAAGTCCAAGCCAACGGATGCAAGGAGCACAGGAACTAGAA
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AGGCAGGTCCTGAACACAAGTCGAGTGATCCAAGAAGGTCTAGAAAGAGCCCTGCCCCGA
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TGCATCTACCAGAGGATAATTACCTGCGCTGCTGGGCTGGTTATTCACCTGTGGATATAG
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AAATGGTGAGGATGGTCTACTACATGTATAGCCCCGTCTTTCATAAAATCGGCTAGCTGT
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AGGGATGGTGAGGTCCTTTCTTGGATCGAATTGGCGAGTAGATATTTCACCGGTCTCCAG
GAAGGCCTCAGGTTCATTTCTGTACATCTAGCATGGATGTTCATTGTATTTTTAGTTGTT
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TGAGGCAGTTTAACTCTGGAAATTTACAGGTCTTCCACATATGAATCTATGAGCTCCCCT
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GGATGTCCTCCTTGAGCTGGTGCACGCCAATGGTGTCCTCCAGGAAATCCTTGGCCTGGG
CGCCCTTGTAGTCGTACATCCTGGGGAAGATGTTAACCCTGTTCTTGGCCTTGCCGCCCT
CGTTCAGCCAGTTCCCCATTGTCACGTCCTCCACGCCTGATGCACACGCACGCAGAGGGT
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TTGGCCTTCCTCCTGACCATGTCGGAGTCGGCGATCCACCGGACGAGGTCCCAGGAGAGC
ACGTACCCCATGCCGAGCATGAACGGCGGCGACTCGCGGTCCATGAACGGCAGGCCCACG
CCGTAGTACATGTCCTCCCGCGGCGCACGGCGCAGCGTCTCCACCAGCGCGTCCAGCCGG
AGGTACGTGTCGTCGTCCACCTTCATCACGTAGTCGTACGGCCGCCCCTCGCCTGAGCCG
CCGCCGGCGCCCCCGAGCATGGCCGGCAGGTCCGCGAAGTAGGTGTACGTCTTGCCGTCC
TCGGCGTTCTCGGTGCAGTTGAAGAGCAGCACGTCGCCGTAGGCGCGGCGCTCCAGCGCC
ACGAACGCGGCGTGCTCGGGCGGCATCGGCCGCGCGCAGAGCGCGAACCGGACGTCCACC
CGCGCGGCGCCCCGGAGCGCCGCCGTCTGCTGCAGCGCGTACGCCATCCGGATCAGGTGC
CGCCGGGAGTGCTTCTTGGGCATCGTGTGCACGCCGACCAGGATGCTGAGCTGACCCCCG
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CGGACGTCGGCTCCCGTGAAGCAGCTCGCGACGCTGACCGGGTTGCGCAGGTAGGCGGGG
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CTCATTGGCCAGTACTCTTCGTCACTTTATCATGCACCTACAGTATTGATGAATATATTA
TGGACGCGTCTAGCTAGTAATTGGCTGGTAAGTGGTCCTGGACACATATCCATAAGAAGA
ATGCTTATTTTTTTCACTCAATCTAAAAAGGAAACAAGGTACTCACTTTGTTTGTGGGCC
TCCATGTGTTGTGGGCTAGTGATTCTAGACACACATCCATGAAAAAAATCAATGCCTGCA
TACTCAGCCTAAAAAGGAAACCATGTTTAGAACAAATAGAAAAGCTACAATTTTTGAGCA
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CTGGTTATCATGATTGTCTACCCTTAGATTTTCTACCATGACTAATGGTTACCCTAATAT
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GCCAACTAAGGAACCATGATATGCAACTTTCAGGTTATTGTGGGCAACTAAATATCACCA
AGATAGACAACCTCGTAGCAATGTCGATACATTAATTTTCAAATGCAACTTCAAAATCAT
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GTGCAAGTTTAGTGCCACATGAGTCAAGTTTAAGGGTGAAAATGAATCTTAATTCCATTG
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TGCTACATTCTTCGAAATCTAACAAGAAGTTGGCTTGCACAATAATAAAGTTGTTTCTCA
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GCAATTTTGACACATGGTTTGAAAGGTGTAGATTATTAATATATTTTTTGAAATGTAAGT
AAATGCATGTGATTGTACTCTTAGTGTTCACCGGGTTTTGTCTCGTGTGATGACTTTTCC
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ATCAACTATGCCTCGTCCCTAGCGATTCTCCTCCACGCGATTCTATCAGACAACCCACAC
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CCACTTCACTAGCGAGGAAGAACTCAAAGACCATATGAGATACGGTTAGTGACAATCTAG
GGTTCCTCCATCCTCCCACCGTCGTTGTGGCCGGTGGAGGCCAAGGACCCATGGCGGTGC
CGACGAGCCAAAGGGAAGAGCTAGTTGCATCCTTTCTATAAACCCTAGAAAAATTATTCA
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GAAAATTTTACGCTCACTACATAACTTCTATCTGAAAATTCATGAGCATATTTCTTAAAG
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TGTTTATATATATATGGATAAAATTGATTGAAATATGGATGAAATAATTGAAATTTACTA
GAATGACAGGGAATGTTTTGGAAAATTGTTAAAATATGAATTATTGAAATTTGTCCGGAT
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TAAAATGATACCAAACCCTTTGAAACCTGCGTGAACTTTTTTTGTTTGAAATCTCTGAAT
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AGACACTCTGCCAGCTAGCAGCTTTGTTAGAATTCCTTTTTTGTTTCACTCTCAAAACAA
AACAAAAATTTCCTTTTCTGTCGTGCGTCATTAGCCAGCATTGAATGTTTCATGTTATGA
TGAGCTGGCTGATTCATATATCCTCCAAAAGACAAGTAAGTACCCTTCCTCCGCTCTCAC
TCATAATGCCTATAGATTTTTTTAATGTCAAATTGTACAAACTTTCATCAAGTTTATAGA
GAAAAAACATCTACGCTTAGAATACCAAATGCATATCATTAAATACAACATGAGATATAT
TTTTCATATTGTACATGTTTAATATTGTAGATATAATTATTTTCTTCAGTAATTGGTCAA
AATTTGCTAAGTACTCCCTTCGTCCGGAAATACTTGTCCTAAAAATGTATACAATGTATG
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GGGAGTATGTCATTAAAATAATGTACACGCACTACATTATGAAAAAAAAAATGAGCTAGT
GCTTTCCTTTCTTCTGTTCCTTTTCTTTCCTTTTTTCTACTCGATTCTGTCCTAGTTTTT
TTTGACCGGGCCCAACTCAGTCTACAAATCCATACAGTCTTCAAAAAATGTAGAAGACGA
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GGAGCACATGCACAACGACCTTGCGCTTTGGCACACATATATACACAGATCATGTACTGT
GGAATGGAAGTACTAGTACTACTAGTTGACAGTGCTGCTCTGTCATTTGCCACTGGGAAA
TGTTATTGGTAAACCGTGATTTGACCCTGAAACAGCGGAGATTCTCGGATGCTCTACCGG
TCGGTACGTACGTCATTGTATCGTCCACCGTGCTATACGATCGTTGACAAAGCCTATTAA
ATCGAACACTTGATTGCACACTGTCTTCTAAGTAAATTAATGATCCTACACGCTTGCTTT
TGGGGGATAAACAATCCTACACTGAACCGACCAATGTGTATGTGTGGAGTTCTTTCTTAG
GCTGGTCACAATGGGGAGT
