Contig Data
morexGenes
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Map Locations of contig_1580795 (2657 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_1580795

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_18497 1 766 bp AK251245.1 Available Available None
MLOC_18498 1 864 bp MLOC_18498.1 Available Available LOC_Os11g07500.1, FRAME:-1, EVALUE:3e-12, 13111.m00784 protein DSHCT domain containing protein, expressed





CDS Structure of MLOC_18497






CDS Structure of MLOC_18498






Contig Sequence (2657 bp)

>contig_1580795 2657 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GGCTCAAGTCTGTCTGGAGTTCATGATTTCTGTTAGCAATTTTTCCATATAACTTATTTC
AATTGGTCAAATAATATTGTTTCCAGTTTCAGAAACTAGTATTGAAAGTGGTTCCTAATG
CAATTTCAATTTCAAATTGTCTACCGGTTATAAAATTTGCACTGCATACTTGCATCTTTA
CTCTTTGAAGAAACTTGGACCGTAAAAACACCTTGAACTCAATTTCATTGTGATATGAGC
TTAATTGCTAGGCATAAGTAACACTGTAGTACATTTCTGAGCAATACAGATGGTTGAAGT
CGAATGCTTTACACTGTTATGGCATCCGTATGGTCAATACTCAACAGCTGGTATAATATT
GCAATTCTTGATAGGAATTATCTTATACCCAACAGATCAGGAGAGCCAGCCAGCACAAGG
GGATGTATGGAGGGATTTTGCATTGGAGAATATCTAACTGATTATGATCTACAAGGTAAG
AACATTGCTGGTTTATCTTCTTGGCTAGACACTGAACTTTAGGTGAACATATGCTGTCAT
GTGGTTTGTGTAGCAGAGCCCGTGCGCTAGTCTGTCCATGGTCTAACTTTGTATGAACTG
CAGTGCTTCAAGGGGATCAAGATGCTGCTCGAATTCTAGGAGCTGCACGGTGTACTCTGT
CCTCTGCACTCTGTAATGTTTCTTAGATCCAGCGGATGAACTAGTGTAGTGTCTCTGGTT
GAACTGTACTGTGTGTCATGGCAATATGTAAATGCTCCAGATATCGGTAGCATGATGGTA
ATAGGCATCGTCAGAAACTAGATTATGTAGCCTGTTCTTAATTCTGGAGGCGACAATTTG
AGCCATTTGGCTATGGACGGATGTCCTGGTATAGAACATTTGTTTGCTATTATTTCTTAA
ACTGCTTTAGTGCTGTCACCTCTGAAGGTCAGTTCAGCTTGGAATGTTTGAAACATGAAG
GCATTCTTAAATTAAAGGGCTTGGGAGTGGCTGCCAAAATTATTGCTTTTGTAATGGTAC
AAGAGCATCTTCAACGGCCTTTGTATATTGGATTGCTAAAAACTTGTTATAGCAAGAGAG
AGAAGGTTTACAAAGCCAACATGTTTTTTTCTTTGGTAGCCTTTGTATACTGGATTGTTA
TATTTGCACAAAACACACAATGATATGTGTGAACAGTTTGCTAGACACATTACACATTAA
TATACGTACATGTATATGTATATTAGCACAACTCGTGTTCATGTACACATGCAGCACACA
CATACGTATACGTACATAAAAAATCATGTACACGCACACACACAACACACGTTAGTACAC
GGACCTACCTGTCATTGAGACAAAGTGAGGCTTGCTAAAAATTTACAAAGTGACCTTTGG
CTTGGTAAATATGCAAAATGTGGATGAAAATATAGCAAGCTTTGTAAAAAAATTGATGGA
GACCACTTATACAAAAGCTGTTGGAGAAGGTTTTTTGGTTAAGATTTGTAAAATAGCAAG
TGAGTGCAAATATACAAAGACTGTTGAAGATGCTCTAAGGTTTCAGTTTGATCACACACT
TCTTTAACTCACATAAAATTGAACTTAACATTGCAAGCTCCACACATAAGAACCCATAAA
TTCAACAATTCTGCCATAACATTTTTGAAAACTTTGCTGCCCAATTCTCACGTAAAAACA
TGGCAATCTCCAACTACAATGGTCATCATCGCAATATACAACAGCTACTGTTCGAAACAT
AACGCTATGGACTGATATATCACGTTCGTTCAACATTGCAGTCATTTCTCAAGAACACAT
TTCTAAATGCATATAAAAGAACTTCCCAAAGCATCTTCATGGACATGATCTTTCAGTAAC
TAATTAAGGGCCTGTTCGTAACTCGATAACACATGACATGGCAATGTAAAGAGTATTGCT
CGATGACAACGCATCCAAAACCTGCTGACCACATCATCACATAATCACGTAAAAACAAGG
CAGGTATAATAGTACGTTGTAAAAACAACTTACAAAAATGTTGATGTATAACAGATTGCT
TCTAATCTTCTGATGAAACCAGTTGCGGCCTAAGGGTTTACTAAAGTAGAAGGTTACATC
CTATGCTGTGGCAGACGATGGCTACATCTCCATGTCATGTCAAAGACAAATTACAAAACA
GCTACATTTGCTCTGCTAACTTGTTTCAAAAAACATTTGCTCTGCTAACATATACCCCGT
ATGGTACAACAGCGGGAGCTCCACTGATCACAGGTACAATGAGTTGGCAAACATGATGCC
CCGGCGCAAGCTCTCGCTCGCCGCTCCAAACTTCTTCTCAAGGTTAACCTCCCCAACGGC
TTCAGCGGCAGCTTTTAGCTGGTAACAGATTCACACAGTCAGTTGGTTTGAGAAGTAAAA
CAGTGTAAGTCTAATTTTGTTGACCATGTACAGACCTGGGGAACAGGAAAGTTAAGTGGT
GTGGGCATGCAGAAAAGGGCATAGAAGAAAGTGGATGCCAATCACAATTACTATATATGG
AGATAAAAAGGAGAATGGCGTTTTGGCTCCCGGGAGCCATGGAGGCCTTTATTTTTGAAA
AATTCAAATTCAAATTTTTATGGTTCAAAAAATTCTGAAAAAAAAATGCATGTATGTAAG
GATGTAACCGACATGTG