Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
No map location | No map location | ![](/morexGenes/blast_net_images/contig_1580684_assembly3_WGSMorex_rbca.fasta-Morex_bigstats_maploc.png) |
Predicted Genes from contig_1580684
Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
---|
MLOC_18467 |
1 |
549 bp |
MLOC_18467.1 |
Available |
Available |
LOC_Os10g39410.1, FRAME:+1, EVALUE:8e-20, 13110.m03607 protein Core histone H2A/H2B/H3/H4 domain containing protein, putative, expressed |
CDS Structure of MLOC_18467
Contig Sequence (6207 bp)
>contig_1580684 6207 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TTCCTCGAGAACGTCATCCGCGACGCCGTCACCTACACCGAGCACGCCCGCCGCAAGACC
GTCACCGCCATGGACGTCGTCTACGCGCTCAAGCGCCAGGGCCGCACCCTCTACGGATTC
GGCGGCTGATCTGCTAGCTGCTGCTGCTCCGGCAAGTCCCTGCTAGCTGCCTGTGTTCCG
GTGATATGTGGTTTTCTTCTGAGTTCGTGCGTCGTTGTTCCATCGGTCTGTGTAGTTATC
GAATATGAATGGAATTGAATCAATGTTCCTGTGGTATCATCTTGGCTGCGTCTCTCGATA
TGTTCCTATTTAGTCACTACCAATTTGTGACATCCTGATTCTTCTCGGCAATGAAGTTGG
CGCACTGATTGTGGGGAAGAAAACTGCTCCTGTAATTTGAATGTAAATGGAATGGAATCA
GCGTCGTATTAGTTTGTGCTGAAACGTTCTCTGAATCAAGTTTTCTTTCTTCCCGGAAGT
CATACAGACCTGTGTTCTGAAACTCTCGAGTTGGCACAATTTTAGTTCACTTGGTTATCA
ACTTGCCCATTGGTCAAAAAAAAAAGAGTAACTAACTTGTACTCCCTCTGTAAACTAATA
TAAAAGCATTTAGATCACTATTTTAGTTATCTAAACACTTTTATATTAATTTACAGAGGG
AGTACTAATGCTTTAGAAAAAAAAACACTGTCATCTTGTGCTACTTTGTCAGCTGCTATT
TTGTTACCGGCCGGGACACGCTTGGTGTTCTCCTCTTCTCTGATGAGGTGTGGCCAGGGC
TTCCATGAATTTGTTAACATTTGAGTAAGAAACATGGCATTTGAATTACGAGGGGAATAT
GGACATTTGACCCAGATGGATCACAACATAGTGATGGAGCATATACTGTTTCACTCCAGT
ATTTACTATTTTCTAGCAAATCAAATTCCAAGATAAGTGTCTTCCTGTCACTGGTCAGAA
AAACATCTTGGATCTTAAGTCGAGGAGACAAGCAGATGCTGCTATGTACTCCCTCCGTCC
CAAAATAAGTAACTCAAAAAACGACTCAACTTTGTATTAAAGTTAGTGCAAAGTCGAGTC
GCTTTTAAGTCACTTATTTTGGGACGGAGGGAGTATCTTTTTAATAGATTCACTTATGAA
GCAGTTTCGATACAATGATGCTCATATGGGATGACAAATTGGCAATGAGATAGTTGAGGT
GATTAACTTTATTCACACAAACTGATTTCTTTCCGTACACCTATGTATGGTAAAATGCCT
TCAGAGCCAGGATTGACATTGTGGAATTGCTTGCGCCGGTCAGTTTACTCGAAAGCTCAA
ACTTATGGGAAAAGGTAGACTTGAACACTCCCCACAAACGCGGCTTTCCTAATCCGGACC
GGACGCTTGAACTTGCCGTTGTATATTTAGACGTTTTTATCATTAGCAGAATAAAACATA
TCATTTATAGTGAGATGTTTTGCTAACCCTTCGTTGTGTATCTCCTAGTTTGTTTGGTCA
TGAATGGTAGATGATCCTTTAGCCCAGTCGATGGGGGTGCCAAACTTCCATGAGGGTCAT
GTCTTCTTAACGCAAGACCCACATCAGGGCTATATCTCACTCGCTGCGAGTATAGTTATG
TCTTTCTTGCCTTATGAGATCATGCAAATGGCTCGACCCATTAACAAAGGCAGAGAGCAT
CAACCCTTACATGAGCGGGCGGGTTTGGAGGACTCCGGAGTGCTCCCAGCCTATTTTTGT
TAAGCTTCCAGGCCGTTTTTTTCTTTCTCTTGACCATTTTTTCTACTTGTTTTGAGCTTT
TGTGTGTGTTTCTTTTAGCGGTTTTCTTGGTCTTTTCTTTTTTCTTTTTCTTGTTCGTTT
TTTCTTTGGTTTTCTATGTTGGGTTTCAACGATTTTCCATCAGGTTCCGCTTTTCAATGT
TTCTTTAAGCAGTCTTTTACTCTTTTATTATTTTTTGTCTGTTTCATCACATGTCTACTT
TTTTAATAAACATTTTACATTTTTCATTTACATAAGAAGCGTTTTTTATACATTTTTTAA
ATAGATGATTACCATTTTTCAAATATATGATCAATTTTTACTTTTTTTCATACCTAGTGT
ACATGTTTTTATATATAGATAATACTTTTAGTACATGTTTAACTCTTTTAAATATATGAT
TACATTTTTACAAATGTATGTTTTGATTTCTAAAATTTTCATATACATTGTGCATTTTTC
ATATACATCCACACCATTTTGTATACATGTTTAATATTTTTCATATATAGTATTAGCATT
TCCTCTCAAACACATGTTTTTGAATAGATGTTATATATTTTCCAGATACACGTTAAATCA
TTTTTTCGAATTATATGATTTATTAAACTATTCAGTTTTTTTACGTTGTATAAACACTTA
TAGTGTCACACACATATGTTTTAAAACACGTGAATGTCTTTTTTAGTGCAACCTATATTT
TTCTAATGGTATGATACTACTTTGAGTTGCGTGAACATTATTTAAAATTGTGTAAAGTTT
TTAAAGATGTCATGTACAAGTTTTGAAATGCTTGAACTTTTTTTTAAATTAGCGAAACAA
TTGTTTTGAATCATCATTCTATTTTTTTTCTACATATGTTTTTATGTAGGTTATATCATT
TATTAAAAGAAACAGTTCTTTTTTCTTCAAATACACGTTGGAAAATTTGTTGTAGAGGTT
GAAATTTTTCGAGGTGATTGTTGAACATTTTTCAGTGCTGGCAGATATTTTTCAGATGCA
TATTAAAAATTTAATAAATACATGGTGAATATTTTTGTAGCACATATTAAACATTTGTAA
GTGTTAGAACATATTTTTGATTGGTCTGATACATTTCTTTTGAAAATTATCCAAGAACAT
CTTCTCACGTGAGACCAACGACGGGTCAGAAATAGCTGCCGCGTGAGACCAAGGATAAAT
GTTCAATGTGTGTAAATAATAATTCGAAACCATTGTTAACACACATTGACCTATTTTTCC
CGCAGACCAACTGTTGTCAAGTGTTAAAACATGTTTAACACACATTGAAGATTTTATCAA
TACATGATGAATATTTCAAACATATATTAAAAAAATCAGAAACAAAATTCAATGTGTGTT
AAAATCTGTTCAAAAATATATTCAATATGTGTTGTTGAGTATTAGAACACGTTTAACACA
CATTGAAGATTTTATCAATAGATGATGAATATTTTTTAACACACATTGAACATTGGTCAT
AGAGACGAGACCACGTTACATCCCGGTAGGGTCCGAAATAGCTCTCGCGTGGGACCAACG
ACCGACTTGCCTAAAGATTCTTTTATTTATAGTGGGCTGACCCCTTGGTATTTGGTTCGT
TAGATTCATTTATTTCCTTCTTACAACTATGAGAGATGGAAGGTGCTTCTGAAAGTTGAG
AGACAGTTTCGTTTGTGTGTCTCTCTTTCTCTTTTCGCTCTCCATTTTAATTTTGTTAAT
ATTTCGAAATTATTTAAATAATGTCATATATTTTATCACGCATTACAAATATTAATGTAG
TGTAAAAAACCCCTCATGCAATTTGTATAAAATACTAAAGGGGGCACATGATGGAGGTTG
GAGGAGGACGAGAGCAACGGACACCACCAACATGATAAGAACAACCCCTGTACCGCTGTA
CATGGTGCCCAAGACCACCAAGCGTGCGACTCACCCTGGACATTTGGGTACCCTAACCCG
TTACGCGAACATGAACTGAACCTAATTATCCGAATTGTCAAGTAATTCGCGTAACGAATT
AGGGTTCGATTCTCATTTCTTGGCTATTTGGTTTCTGGGTTAGGATTCGGGTTTGAGTCA
AGAAAACCCGAAATACCTATACTATCCGAATTATTCATACTATCCAAATTATTCATCATA
TTATTACACTGTCATGTTACCCATACTAGCTAAAATACCCATACTACCTGAAATGCCCGT
ACTATCCAAATTATTCTACCAAAAGTTGATGTGTGCTCCGAATATTTCGGGTTTTTTGGG
TACCCGGATTACCTGAACCAAAAGTTTGAGTAATTTGGGTTCTAGTAAGCAGAAAAAGTT
TCTGTTTCCATTTTGAAGTACCCGAATTACCCATAAACCAAACTACCCGAACCAAAATAA
CCGAAATACCCGAATGCCCAGGGTGACGCGCGACCAGCGAGCGATAAGCCACCATGTGCA
TGCTACATGAGCGACCAACCATCAACTAGAATGAGCACTACCGCCTCTGACATGCCCCTC
CACACATGATTCAAGGACTACAACAATCCAAAGTCGCCCGATACAATGGAGGCTGACTCG
ATGGGAGAATTGATTTTGACGCCTCCATCTCGCACGCCTTCGATCTTATGCCCCCCTCCT
CATTTGGCTTCCTCTCAACTCCCCGACGCGACTTAATTTTTGCTCCATTACCCCCCTACC
ATGTTTACCTCTTGATTTATCTGGTCAGGAAGGAATCTGGACTTAATATATTTGCAAATG
CCAAATCTGACCTTGTCCACTCTTCCTTCCAAAAGGTACGAGACAGAGGGGTTCCGTCCC
TGTACCGACCTAGCAGCTAGAGCAGCTGCGCCGGCCGTCCGTCGCCCTCCTCCGCGGTGT
CCCCCCATGGAGGATAATGTACATGGATACTACTCAGTTAGCAGATTCAGGGCAGTATAT
GAAGGTGTAATTGAGCCCCTTACAAACAAGAATCAGTGGCCACATGTGCATACATGCTTC
GTGTTGCGTCCACCAATTCCAACAGGCAAGAAAAAAGATGCTGGAAGAACAAGAAACAGA
TGATAAAGAGTTGGTGGGAAGGTGGATCGAGGAAGGGATCCTCGAACAAATGCAAAAATG
CGGGGAGGTAGGACATAGAGAAGCTGGATGTCCTAAAATTGGAACAAAGAAAAGGTACAA
ACTAGTACTTGTTTTTTTTTTCTATTTATAATACCATGGTTCTAATTGCTTTTTTGTAGG
AGAAAAAGGGGGGAAAGGAATCCATGTCCATGGTTTGATGTTTCGGTTAGCAATGTCGTT
CCATCTACACCAACCAAGAGCAAGAATGATGCCACTTGTAGCAGTCCTGGAGCTGTCACA
AGAAGCCAAGCTGCAACTCAAGCTAGTCCTGGACATGTCACAAGGAGCCAAGCTGCTACT
CCACCATCAAAATCTCCAGCAAAAGGAAAGAAGAAGAAAATGACTCCTAAGAGGAAGAAA
TTAAGCGACCTGTGAACTTGTGAGTGGTTGAGATGAACTCGTGTGTGAGTGGAGACTCAA
CGGTATATGAGGTGCAAACTCACTTTTATTTGCTCTGTATGTGAGGTAGAGACTTACTTC
TATTTGTTATGTATGTGAGGTAGAGACTCACTTATTTTGTTGTCATGAAGTCATGTAGAA
CATGGTTGAACTTATTATTTATGTTATCATTGAATGGATGTGAGACTATTATTTTGAGTT
TGTTTGAGTTAAAAGCTATTGATTGTTGCAAAAAAAATTGTACAGAGTTGTGTCCTTCAA
ATTGAAGGGTATTTTGGAAGTTAATTGCATGGACATACCACATTTGCACAACATGTAATG
AGTCCGTACCACCATCTCTGCAAGTCGCAATTCAGTACCACTACTCGTCCTAATTGTTAC
AAAATGGACTGACAGCCGTATAAGCATGTATTGACCATGTATCTGACATGCCGGGCCCAC
CTATCAAGCGTCACGCTGGCCAATCGGTGTGTGCTGGTGCACTGACTGGGACGAGGCTGC
GCGGTCGGCCTTAACCGGCTCGGTCGAACCAAGTCGTCCCCCCGACGAACCCTATCTAGA
GTTCTTCCCTCCTTTCCCCTCTCCTCTCCCCTATCCTCTCTCCCTGCGGATCTCAGACGA
TGGTCGCAACGACCCCGGCGACGGCGGTGTCATGGGCGGCTACGATGACCTTCCTAGGCT
CGTGAGCGATGACCACGTGGGGCTAAACGACTCCAGTTCGTCCTATGACACCAGCGATGA
GGAAGGGGAGGAGGAGCCCCCTATCCATGGAGCAACGGGTGCGGATAGACGAGATGTGGT
TGGCCAACCCCACCACAAGCCATCAATGGACCAGTGGAGCAGGTTGAGTGATGTAAGTCC
CTCCATTTTTTATTTTGTCATGTTCAAATCAGAGGGCTAGGGTTTGTGTTGTAAAGCACT
GATTTTTTTTATTTTGTCGTGGATTGT