Contig Data
morexGenes
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Map Locations of contig_1580005 (5169 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_1580005

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_18291 2 2771 bp MLOC_18291.1 Available Available LOC_Os01g08700.6, FRAME:+3, EVALUE:0.0, 13101.m00916 protein GIGANTEA, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_18291






Contig Sequence (5169 bp)

>contig_1580005 5169 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
ACTAATAGACTAATAAGGACTCCTAGANTAATACTAATACTTCCTAACAACTACCTTAGT
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CGATTGCTTTTTTCATTCTATGTTTGGGGTCCTTTTTACAAAAGTCAGGGACTGATATGT
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CTATGTCCTTCCGGGCCCTCGCTCTGTTAAAAAAAAGACAAGTCATTTTTTGTTCTCTAC
ACAATGCCTATCTGTAGAGCTTCTCCGCTACAAAGAATCGATACAGCGACACCGATAGAG
TGATACGGGTACGACAATACGGAATATGACAATTTCTAGAAACAACAATACGACGATACG
ACAAGCATATATAAATAATAAGAAAATGATATATAATAAAAACAAACATAATAAAATGTA
TGAGATGAGATCAAAATACCGCTCACTCGTTGCCTAATTGCTTCCATGCCTCCTTATTTC
TCATTTTAAAAATCTCACTATCATCAAGGGGGTAACACGGTCATAGACTGCCCCAACCCA
ATTTGGACTGTAATACCTATTAACATGACAACATAAAATCAACAAACCTTTTAAAGTTAA
GAACTTGAGATTGTCAAATGACAAACATATATAAAGAGCAACCTTGGATTGCACGAGTGG
GCCAAATAA