morexGenes - Barley RNA-seq Database

Contig contig_1579922
Source Contig contig_1579922
Contig Data
|Contig Location|
|Microarray Probes|
|Predicted Genes|
|CDS Structure|
|DNA Sequence|
morexGenes
Links
Map Locations of contig_1579922 (6904 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013	Oregon Wolfe POPSEQ 2013	Morex Genome Release 2012
No map location	No map location
Predicted Genes from contig_1579922

Gene ID	# CDS Predicted	Max CDS Length	Probes in Cluster	FPKM by Treatment	FPKM by Replicate	Top Rice Hit
MLOC_18268	1	670 bp	None	Available	Available	None
MLOC_18267	3	1251 bp	MLOC_18267.2	Available	Available	LOC_Os02g40680.1, FRAME:+1, EVALUE:1e-31, 13102.m04535 protein mis12 protein, expressed
CDS Structure of MLOC_18268

CDS Structure of MLOC_18267

Contig Sequence (6904 bp)

>contig_1579922 6904 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCCCCTCTCCGCTGCAGGAGAACTTACCCCTGGAGGAGGTATTCGAGAACCTGAGATAAA
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NNNTATAGTTCATTAGAGACCCTCAACTTTTGACCGTTTGTTTTTGGTCGTAAAAAGGCC
GCAA