Contig Data
morexGenes
Links



Map Locations of contig_1579733 (3680 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location No map location




Predicted Genes from contig_1579733

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_18213 2 440 bp MLOC_18213.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_18213






Contig Sequence (3680 bp)

>contig_1579733 3680 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCGTTTGTGTCCAGGCCTCGTGGCCACTGCCGTCACCATGGATCCTCCCCGAAGCTTGTC
GCACAACCTTGTAGCTAGCGGATCTGTGTGGTTCCAACGACGGCGAGCCTCCGAATCGGT
GGGATTTGCCCGCGAACATCGGAGGAAGGCGGGGGTGCTGCTTTGTTTTGCTTCGGCCGC
CCGGGAGAAAAAATGGGCGATGCAGCTTTCTTCGGCCGGTGGGGAGAAGAAAGGGGCAGC
ATTACTTGCTTCAGCCATCGGGGAGTTGATAGGGGTGGCATGGCTTGTTTCAATCGACGC
AAAACGGACCCCGTAAACGTGTCCCATAAAATATCTGCAGGATGGATTTAAAGGACTAGT
TTTGCCGGAGCGCTTGCGACCCCGTAATTGCTTTTTAAGGTCACCCTTATATGATTTATG
CGGGCCGATCGTTAGTGGGATCTGCTAAAGATGCTCTAAGAAGAGATGATGAGACCGAGC
CATATGAAGGTGCATGTCGGTGCCAATGCTGCAAGATAGAGGCTATTTGTACTTGACTGC
TTCACAATATTAATCTTGTATGTTATAATAAATTCTTTTTTATTATGTAGATGCAAGGCG
TTGTACCCAACACCCAGCCAAGGTTCCAAATTGCATTGGTGGAATTGACAAAAACTGTGT
GAAATGTTGCAATGGCGAAGGCTACCGTTACGGAGTATGTGCACCCACATGCAAATGCTC
TCACTGCGGACCTGGATCATATCTCGATGAAAATGCAAAAATACAGTAAGACTTAAGTTT
GTAACTAGCATGGACCAATAAGAGGATCAAGTATATTACTATTTCGACCCCGATAATGCC
CAAACATCTGGGATTTGTCATTTCCACACTATTATATATATCCCTATCATTTTGAAAAAT
TTCTATAAATCTATGTGGATGGTGCTCCTTGTATATGTTGACTATATGTTTAAACTTGGG
CATAACACAAGATGGGATGGTTAACGGCCTAGAGATATAAAAACTATTTAAAAAGGCCAA
GCCTATGCCCAGCCTCACAAGAGTCCCTAAAATTGAGTAACTAACTAGAGGTTACCCCTT
GCTGGGAGTATGTCAAGTGTCGCATCCAACTGCTGACACATGTCGCGTGTCAGGCTCTCC
CTTTGATTTTTTTTCTGTAAGGGTTTTAGATGGGTTTTTGGCTTTTTCATTTTTGGCCGG
TGTTTTCTATGTTTTGGAGAGAAAAGATCTTGAATTTTCCTTTGGCGGGGAAAACAATTA
GTGCGACAAAAATTTGCTTCTTGTGGAGGCACATATTTGATTCCGCGAGAACCACAATGG
TGCATCTTGAAAAGGAAAAAATGCCATGCTTCCATGAAAAGTACAAATTCACAAATACAA
AAATGAGAAAAACAAATTTGCTTCAGTGAAGGCATTGGTTTTGTTCTGCGAGTGGCACAA
TTATGCTTCTGAAAAAAGAGAAAAATATATTTGCTTCCATACCTGAAGCACAAATTTATT
TCTCGTAGAGGCACATATTTGTTTCTACGAGAGGCATGTGCCTCTCGAAAAGGGGAAAAA
TGACTTCATGAGAAACACAGATTTACTGCTAGCACATTTGCAAGGGAGCTTGTGTTCAAA
TAGGAGAGCACGGATCCTAGTCAGCTCATAGTCTAGCGCTACTCCATCAAACGGGGGTCC
AATGCATTCTATTCGGTCCTAGTAGGTCGGCTCATGTACCCCGGTTCTTCTAATTTTGGG
AAGGTTTTCGAAAGGTTGGTACTATTTTTTCTTTAGTTCTTTCAGTTTTTTTCTCTTTGG
TTTACTGGTTTCCTTTCATTTTTATGTCTTAATTACACTTCTTTGCATTTTTTAAATTTG
TGATTGTTTTCCAAAATTTGAATATATATTAAAATGTGGGACCTTTTAATCTTCATGTAC
ATTTTATTCAAATTTGTGAATTTTTTATTCAGGAACATTTTCAATTTAGGAATATGTCTT
AAATTTGTTCATTTATTAAATTTGTGATGTTTTTAAAATGTGGGACATTTTCTATATTTA
GTAAACTGATGAACAGTTTTAGTTTTTGGAATATTTCAATTTTCATATAATTTAGAAATT
TGGGAATTTTTCTGTTCTAAAATACTTTGTAAAATAGTTTATGAATATTTTTAAATTCAT
AATTTAAAAAATTATGTAATATATCTGAAAACCCGTTTTTCCCAGAAAATATTTCTGTAA
ACCAATTTAGGAAATAAAATCTGACCCTAACATGGTCGAGGCAGCCTCCTATATCTAAGT
ATTAAGAACCGATCAAACGGGCCATCCTAGTATGTAGCGCGCATAACTAACATGCCTGAT
TTATCACTGTCCTGTACATGTGCTAAGCATGTCGTATAAGGGAAAAAAATGACATGGTAA
AGCAATTAAGAAGAAGAGGAGCACCTTGATATCCCAGGAAGAAATAATGTCAAACATATG
ACCCAATTCAAAACACTTAAATAAAGGAAGCTCAGCATATGACTTTTTTGTGATGGTAAT
CTTTATGCGACTATCCGCCATATAAAAGTCAAAGGGTGTCCTAGAAAAAGGCTTCTCGTG
GGGTAAGTACTTTGGCAGCATGTGCATGTGCCGAGATTAACGTTCTCTGATGTTGAAAAC
AACAACTGTTACTTCACTGAATGTGAGAAAAAAGAAAAGAAATGGCCATATTCTTGCTGG
TACTTTTGCAAAATAAAAATAAATTACTGCTACTTTCTTGTCCCTTTTTTATGACATAAT
ACATACGCTGAATGCTCATATACACACAGATACATTCAGTTTTATGAATGCATGTACTAC
ACCCTACCTTTAAGATTACCTCCAAGAGACTAAACCAAAAACATTATCTTGAGATTAACG
AAGTAATCATCTTCTCTCACTAAACGCACATCACTGAAACACCTGAAATAAATTCAAAAA
TATATGATCACCGGTAACAAGTCTAGAACTCGAATCCTGGTGAGCTAAAGATACAACTAT
TCATTTTGCCCTTTTTTGTTGCATGAATAGATATTGAAGACGTTGCATGAGCTAAAGATA
CTTCAGGTAAGGAGCCGTTTTCAGAAGAAAAAAAATGTTACTTCAGGTAGATCTACACAC
GTCCACACGAGCTAGCAACATGTACATACGTGTTGCTTAGTTATAAGTTAGCCGGGCCGC
AAACCAAACTGTGTTTGAATTGTTAGGAAGACAGTGCTATTTCCTGTCCATCAGAGTTAA
AGTCGCAGACTTTGATTTTGGTGCCCCCATTTTTTTGGATTTATTTCAGGCCTTCCGACG
GTGTTCGTTTAGTGGGAAAATATGTTTCTGTCGACTACGAAAGTTTCAGTGACGATTTCG
TCAATCTCAAGATGTTGTGCTGCCTCAGTCTCTCAAAATTACTTATAGGAATAAGATGTG
CATACATACGTTTATAGGGATCAGTATATGCACATATGCGAGCGGCTTTGATTGTTGTTG
TGTTAAAAAAAAGTTAGGAGGGTCGAAAATTCGTATATACTACACTTCACGTTGACATCG
GAATACCCGACTCAATCGCATTGGAAAATCACGAGCAGTCACCATGGGTAACGATATTTC
CATCAACTATATATTGATATATAGATTCCGGAGAATCATATAACTAGAAGTCTACAATTG
TCGACATACCGTAATAACTC