Map Locations of contig_1578205 (2596 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_1578205

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_17826 1 1587 bp AK364118 Available Available None





CDS Structure of MLOC_17826






Contig Sequence (2596 bp)

>contig_1578205 2596 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
ACACGTGGATGTAGTCGTAATCCAAGTCGCAGTCCCTCCCGCGATCTCATCACGATCCGT
CTCACGATCCCATCACGATCCATCCCGATCAAGTGTCGAACGAACGGCGCCTCCGCGTTC
NNNACACGTACAGCTCGATGACGATTTTTTTAAAATAGTTTAATGTTTATCCACAATTTT
GACCTGATTTATATTTTTTGCTGAGAGCTGCTCAGATGTCAAATGATCTGAAAATTGAAG
TGGACCTCATGCAAGAACTTATCTACCATGGGAAAAAATAAAAGTTTTTAAAAGAAATTA
GTACTTGTTTTGAAAAAAAAATCTAACCGGATGCAGATGAGCATGGGCACTGAAACGCTG
CAGTCACGCCTTTAGAGATACCTTTACTGCTCCATTCCAAAATAAGAAGTATATTGAAAA
TATCAAAGTCGAATTGTATAAACATTGGTCAAGCTTATAGAATCTTTTTCATCTAAAATA
CCAAATCAATACAATTATATTCATTGTGGATATATTTTCATAGAACATATATTAAATGAT
GAGTTTTCGCTCTGGCTTGACAAAGGCTGATATGAAAAGCCCAAGCCCGGGTCGGCCCGG
CCTGAAACACATGAAAAATGGCTTTTTCAATTACAATAACCATTTTTCGGATATAAAAAC
AATTTATATTACACCTAGTTGCTGAATAGAACAGGAGATTTTGGTCAACCTACTAAATGG
CGAGGTCAAACTATTGCTTCGGATGTCAGCCTCCTGATCTTCCCCGGGACTGAGGTCATG
TTTGGAGGGTGTTTTTTGGAGTGTTTAAGCTTCGTGGCTTTTAAATAAATCAGGCCTCGA
AGCCTGTTTCCGAAAATAGAAAAGAAATGGAGGGTGGCGTTTACACTTTCACGGCACAAA
TGTCCACAGTCAATACCATCCCATGTGGGCAAATATTTCTTTTTATCATGAACGAACCGA
CAGGCAGCAACATATTGCAGGGTCCAAAGCAATGGGTCCAAAGCAATCTCCTACCAAACT
TTATAAAAAATGATGCACTCCAGTTATGTGATAGTACAATACAACAGAGGACCCTGTTCC
TCACTCGGTCCATTTCCCACCGTATTCATAGGATACAATAGCAACACCATGTGGTGTTCT
GTGTAATAATCTGGTAATGACAAGGGATGGTGACTTCCTATAAGAAACTATCTCCTGCAA
CAACAATGCGTGCACACGACCGGGACGGAATAAAACACTACGCATGCTTATTGGATTAGC
ACCGGAGAGCGATGTAAATGTATGTCGAACAAGTAACATCAACATAAGGCTCTGTGCACA
CTGCTCCATTTGGTCAAGCCTTGGATGTCTTCTGATTTGGTTTGAAAACGTTTTTGATCA
GCGACTCCTTGATTGACAGAAGTTCTGGGAACTCCGTTTTCAATTTAACAGTGTCAAGTT
CATTGTTGCTCCTCGGTGCTACTATGACCTTGGCTTGCTCCTCCAAGTTGAAGTTCTTCC
AGGAGAAGTTTGGATCGATGTAATCCCTGTACATCTCCAGTATCTCATTGTGGCTCACCA
CACCAGGATTAGTGAAGTTCCAGATTCCGGTGAGGTTTCTCTTCGCCATCTCAATTGAGA
TGGGAAGAAGTTCATCCAATATTGTCATTGAATTTGGGATATCCACAACCTTATCATACC
GGGTGATCTTTGTGATGAAATTGCGAGGATTGGACAAATCAGATGAAATAGGCATCCTTA
CACGAAGGGTGCACACGTTTTCGTAATTCTTCAGCAGTTCCTCAACCTATTGAAGGTAAA
TGTTAGCTTCACCCTGAAATACTTCTTCTAATAACATAATCCCTCACCTAAAACGTCTTA
TAAAAGTTTACAGAGGGATTAATTAAAAGTAGCAAACTATCATGAAAATAATGGTAATGA
GCACAGATACGGATACGGACAATGGCACAATTAACCGGGTATTATTTTCACCAAAATCTG
CTCTCTGAGATTAAACCAGGTATTCTTTTGAGTCATAGATCTGCCTATTTGAGCTTTTGC
CTATGTAGAAACTTTTCGTTAAAATAAATACCTATGATCATTTCAGTATTCAATGGATAG
TAAGTTGAGCATTTTAAAGTCCAATGCTAACTTCTTTGGAAGTAAGACCTATTGGACAGG
CTTATTTCTCAATCATGATCATTAATTAAGGATGAATTTGGTTATGTAGAAATGTAGAAT
ATGAACAGGCTTTTCATGTTACAGTTGATGCCAAATAAGAAAAGTAGGATGGCTGGCTAA
TGCTATAGTCATATATTGGACAGTTATCACTCTTTGAAAATCTGCATCTACTATATGTCA
TTACAATTTTGTCAAATTTTAAATACGTTTTTTAAGGGTTTTGTTATTTGTATGAAGATT
GAGAAATAAGGTACATTCGGGTAGACTTCAGGATTCGTGCATCAGCAAAAGATAAAACTC
CGATTTTAAGCTACTAAGTCTAACTGGTGCAATTTAATTGTTTTGAACTAATTGTTATGC
ACCAAAGAACTAGCCACAGACAGGGGTGCGTGGAAGCTTGCTANNNNNGTGCCAGAACCA
TGAGTTGGTCGCGAGA