Map Locations of contig_157731 (6815 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_157731

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_17609 1 317 bp None Available Available LOC_Os03g61130.1, FRAME:-3, EVALUE:8e-20, 13103.m06718 protein phosphoesterase family protein, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_17609






Contig Sequence (6815 bp)

>contig_157731 6815 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TATAATCTATCTTCATAATCCAGATTANNNNNNNNTATTGTGGTTCCAAACAGGGCCTTA
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AGATTTTCTTCACCCTGAGTAGGGAGTGAATCAATAGCAAACGTTCTACACAAAAAGTGT
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GGCATACTGCTCGTAGCGCATGAAGTAGGTTGGTGAAGTACCGACACTTTAGCCTTTTAC
GCTCTTTCGGCTCAAAAATTACATTTTCTCTCGCGCCCATGCAAACACATCTTCTACACA
CCTAGTGAGAGGGACTACTATTGATGTTTTAATCAACCTCACATGGGAGGGAATACTATT
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GACACCTTGCTTGTTTTTTCATCAGTATACCCAAGGGGGGAGGGATCGATTTATCACACT
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GTGCCCATTAGGGTAATATTTCAACTTGAGCGCATGTGTGCACATACTATTAGTATTGGG
TATGGTTAGTAAGTGCCACGCCTACCATGCTAGTAGGGTCCGATTAAACAATCTAAAGTC
CATGAATCTAATCCCTCCTTGACATTTGAGCTTGATCAAGTGTTGCCAACCTCTTGAGTG
TATTTTGGCTTGCCTTTTTCTGGAACCAACCAATAGTTCATGAACATTATCTATAGATCA
TCAAAGAGGGGCATGGGGAGCTTTAAAACACCCATCATATAAGTGGTTATGTGTTATGCC
ACCAAACTTATCATCAACTTTTTTTTAGGTTGTCCTAGATTAGCATCACCTCGCACCATA
AACTGCTTAGTAAGCTTGGCATTTAAAGTTTGGTACTTTCATGTGGACACACATCCATAT
GACATTATGATCCCCAAGTATTTTTATTCAAAACTTGCGCTTGTTACTTGAAGATTCATT
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GTTGATAATCTGCAATGTAGCAATCACATAAATATCAATCATGTGTTTGAATCCTTCTAC
TTGTGTCCCACGTGCTTTACAAATAGAAGAGTATCATCATTAAACAATAAATATGGTATA
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TTACATGATTATATTGGTTGCCATAAATAAAAATGGTATGGGGAGAGTGGTCACTTCGAT
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TTTAACTCCCTAAATAATGTCTACCTTCATTATGAACCAATTATCTCCCCTAATAATAAA
GCGCAGAGCGCTTCTGTCGTCCGTCGCTGACAATTTTACAAAAAAACCCTTCTATTTCAG
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CGGTGAGGCCGTCGATGTCGGGGCGGGTGGCGCGCAGCCAGCCGAGGACGTGGTCGAAGC
TGCGTTCTCCGTGACCACCACCACCACCGTCTTGATGGGGGAGTGGATCTCGCGCTTCTT
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CATCAGGGCCAACAGGAGGAGGGCCACGAGGAGGCGCCGCTCTCCGACGGCGGCCATGGC
GTTGGAGCCGGTCACGGCAGCGGCGACGAGGGGGG