Map Locations of contig_1576347 (3275 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_1576347

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_17332 1 2448 bp None Available Available LOC_Os02g18450.1, FRAME:-2, EVALUE:1e-28, 13102.m02069 protein GTP-binding protein typA/bipA, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_17332






Contig Sequence (3275 bp)

>contig_1576347 3275 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
AAGGCTTGAGAGTGAAGGAGACGTGGAGGAGGGGGCAGGAGGAGGGGAGGAGGGGGGGGT
GGCTGGGGGGGGTGGCGGGGGGGGGGCCCGCGGCGGGGCCCCTCACTGGAGCTCGCCCGG
GCTTCGCCGGCGGCGGCGGCAAGACGAGAAGGGAAAGGGAGAGGACCCGGCGGCGGCGCT
TGAGGAATTGCCCCACGACTCGCTAGAGGAGTGCGACACGAGGTCTAATTAGGGAAAATA
CTACCATTTGATTTAGTGTTATACTTCTTCAAATGTAATGTTATTGCATACGCTTTGCAT
TTGAGGAGGGTTGTTAAGGAGTAGTAGTAAGTTTAGGTCCCCTCGCGTATTCATATTAGT
CCAGATGTCCTTGCTTGTATGCCCAGTCATTTGTACTATATATTTGCACCTTGGGATATG
CAATACATCCAAGTTGCTCATCTAACACATTGCTGTTTCCCCCCGTTTCGGCTCGAGGAC
GTGCTGTTATGCGTGGAGCCACAACGAGGACATTGGTGTTTCCCCTCGTTTCAGTTGGAG
GGCCCGAGCCCTGGCCACACCACCCCATGATCCAGCTCAAAGTGGTTAGGATTCCTATAC
TACTATAAGCTATTTCATTAGGTTCAGATTCGTATTAGGTGCAGAGTCCAGATTAGAATC
CGTTTCAGAGTCATTGTATTTCCTCTAAGTCGTCTTCACAGCCCAAGGTATTCCACTGGT
ACAGTGACGATGATAGGCTACGGATAATCCATTCTGGAAGGGCGCGCTGGACACGTCGAA
TGTTCATGGAAGTGTTTATGACGGCTGCATGGAGCATATGGAAGGAACGTAATGATAAAA
TTTTCAGGAGGATCCAGCCATCGTATCAGTGCTGGCACGAGAGGTTCAAGACAGATTTTG
GCCTCCTGGTTCATGAGTTAAACCTCCTCTCGTAGGGTTTATTACCCACTTTGTAAACAC
ATTTGCCTAAAAACCCTTAGCCTAGAACTCTTGTAATACTAGCTTCATAGTGTGCCTGCC
TCCACAAACTACCTTTCAAGTGTCCCAAAAAAGGCACTGTGGAGGGCAGGTTGGTGTGAG
GATGGCCTGGATGTAACTACATGCACTGAGTGCTGAAATTAATATAAAGTGTCAAGAGGA
GCCTTTCCTACTGTCTTGACCTTTCAAAAAAGAAGGCAACCCCCCTATATAATGGGCTTC
TCCCACGATCAATAAAGCATGAGAATTCAGAGTATTTACTTTCTATTAGGGCTAGGGTGA
TTAAAGTTTGTTCCAAGTTCTTTCTAGAAAATAATATTATCAAAGCATTGAATGCTTATG
AAATTTCACCTGTAGTTTCCTTGTTCGAACGAACATTTGTTGCAGCCTTTTTCTTGCACA
CATTAAGTGCTAAATCACCTGGTCGCTGATGGATACCAACTATCTGGCCTTTGTAAATAT
CCTGCCCTGGTTTGACAAATAGTATACCTCTTTCTTGTGCATTAACACAAGCATAAGAAG
TAGTACTTCCACCTTCGAATGCCACCTGGATCATTCCCACTATGTTAGATGTTGAAGAAA
ACTGTAAGCCAAACTAGGTAAATAAGTTCGGCACAATAGGTAGGCAGATAAGTTTGTAAA
CAGTCTGTTAGTAAAATTAGTTGGCGTTCCCTACAAGAATTATGTTTAAGATATAGCTGA
TGGGTTTGACATTTCCTAATTTTCAGTTTCTGGAAGGACCAAACGAAAAAATGACACGTG
TAATTAACCATGCAATTTCTAGAGCATGTTTGGCCTATGCAGAGACATGTTGTATTGGAG
ATAGGTTTCTAATGCTCCGGTTTATGTTATGCATAAAATTTGAAATGATACGCTATAGGA
TTTCAAAGTTGTCAGTGCAAACTCTGTAGTCTAATTTTACTATGTATATACTTGCTAAAA
TGAAACGTCTTTCATACAAGATACAATATATACAGATCTTGTGCGATTCACAGATTTATT
CTTAGGGTTCCTTAGCTCCAGCCAGTGAAGGCGGGCTCGTGTGTGCATGTCGCATGTCAT
GTGGATGTTCATGTGTACGTCATCTCTGTAATAAAAAAGGGCAACCCGGTGCACGTAGCT
CCCGCTTAGGGTTTAGGGAAGCGTCCGACCACTTGTAGGCCTTTTGTATGTAGACTTTCC
CTACATTTCTGCAAGAGGTTGTTTCCTGCGTGACCTCATGGTCATAAGGCAACAGCTTTA
CCGCTGCACCAAGGCCAGCCTGTTGTACGCCATCTCTGTAATAGCACAAAACAAATTCAT
AGTCTACGTGAAACACCTTCAATTCTATGTCAGCGTGTTACCTTTAGTATTGCATAATGT
AGTAGTCTATTGGCAGATTTTCAATTGTATTGATCTTCAAATTAGGACGCTGCTATCTGA
ATTATCATTCCACGCCATACAGAATTATCATTCCATTTTATACAGAATTGTTATTCCAAG
TCATAAGGAGTTATCATTCTTTATCACTCATCCATGCATTGAATCAAACTAAATTCCTGT
GATAATCTTTTTCATTAACCAAGTGAAACCAAATCGTCAATATTGGCCTATGTGTGAAAG
CACAACTTCTTCCTAGGTGGTTTTGGTAATTAATAACAACATATATGTTATTGGACTAAT
GATTCTATCTAGTATATTTCAGAAAAAGTTCAATGACGAATTGGCTAAGGATTGTGACGA
GAACCCCTAGATGCAAGGAACATCTATTGGCAATAAGCTTGAAGACTCTAAATTTTATAT
TTTGTGAGAAATCACTTTCGAGTCCATAAAAAAACCAATACGATTAAAAGGGGATGAGGT
GACTATGATGATCTGGTTGCTTAAGTGCTTAGAGATTAGCCACCCAAATACTCATTAAAT
TCTCCCACGGATATTCTGTCCAAACCACAAAGTCAAATTCGGTGCCATCAAGTTTTCCAT
TTCAGCCCCACCGAGTAATACCCTAGAAAGATCCCATGCCAAACCCTAGAGTCTCGGTAC
CACCAAGTCCAGTTTCGGTCTGACCGAAAAACAGTGACCAACTCCCGGTTAGCCATTTGC
TAAAATCGGAATTTTCGAGTTTTGCAAATCGGTGCCACCGAGTTTGCTAACTGCCTAGGC
CGGCCAAAATCGGACCCTCCGTGATTCATATATCGGTCTCACCGAAACGCCAAAAGTTGT
CACATTTTGCACTAGTCGGCGCAACCGAGTTTTTACTTCGCTTTCACCGAGTTGGGCAAT
AATGTTGTTACGGTTAGATTTTTGGAGATGCCTAT