Contig Data
morexGenes
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Map Locations of contig_1576274 (1990 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_1576274

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_17311 1 829 bp MLOC_17311.1 Available Available LOC_Os01g40980.1, FRAME:+1, EVALUE:1e-79, 13101.m04199 protein helicase, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_17311






Contig Sequence (1990 bp)

>contig_1576274 1990 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CATCATTCCGGATTCGGTCCTTCCTTGTGTGGCCACACATCCATCTCAACATGTGCATCT
TCGCCACACCTACCTGTTGCACATGTCGACTTTTAGTCTGACAACACTCAGCACCATACA
ACATTGCGGGTCGAAGGGCCGTCCTATAGAACTTGTCTTTTAGCTTTTGTGGCACCCTCT
TGTCACAGAGAATGCGAGAAGCTTGACGCCACTTCATCCATCCGGCTTTAATTCGATGGT
TCATACAATTGAGAATAAATAAAATATGAAAATACTTTTCGTGATGGATCCAACAATACA
AATTTGGTACGATAGATATTGATATTTTTTTCTAAAAACTTGGTCAAACATGCACATGTT
TGACTTTAAAAAAACTTAATACACCTTATATTTCGGAATGGAGGGAGTGTATATTGTATT
TGGGCTGTGCATGTTTGACTTTTGAAAAAACTTAATACACTTTATTTATATTTTATATAT
ACCATTTAAGAATTGAAAAAAATGCAGATAGTGTTACACCGCCTGCAGACAAATGTCTGC
CGCAGAAGATTGTATCTGACTCGGTATGTCTATATCCTTTGCATTCACATTGATAATCAG
TATTCTGTTTAGTACTTCCGGTTTATAGATGGTATTCTATCTCTTGCTAGCCTGCCACAG
CAGTAAATGGGCACCGGGGAACTACAGTATCATTGAATGCAACCACCAGAAAAAACAACT
ATATGAAGTTTACCCAGATCACTCCTGCCAATCGCACCACCCTTCCTATGAAACATGGCT
GTTCCACATCTTCACAGCACGTATCCTCAAGGGGCCAAATTTCTCAGGATTCTCAGGTTG
TTGATTTGATCGATAATGCGGCCATGCATGGACAATTGAAGGAACATGCCTTAAAGTCTA
TGAGACTTAAGAAGGCTAAAATAGCAGATGTCTCTTCACAATTGAAACATAATGTTGAGT
CGAGAGCTTTGACTGGAAACCAAGGTCAACAATCTACACCTCCATCGAAAAGAAGTACCA
TTGAACAAGCATGTGAAAAGAATGAGGCTATTCAAGAAAGATGTGGTGGCCCGGAATCTA
CTACTGGACCGGCCTTCTTGAAGTTGGTATGCTGCTTGCGCTTGCTCTCTGTAATTTGAT
TTTGTCTTGCGCTTTGCGGAGTAAGTGCTATCTTGTTAGTATGTTTATTGTTGCACTCAT
GTATGTGATAATAATCCTTAACTTTGAATATTTTTACTAGGCTCGAGAAAAGCTCAGTAC
TGCAGAGTATGGAGAGTTTGTTGAATTTATGAAGGCCTTAAAATTGAAAACCATGCACAT
CAAAGACTCACTTGAAGCAATAGCGAAACTGTTTTCTTCTCCAGGGCGACTCACACTTCT
TGAAGGGTAAAACTGCATGTGTTGTAATCTTCATTATTTATTGTGCTCAGGACTTAACAG
ACAATTAACTATTAAACCTTTGATATATCTTGTTCTCATCTGCTTACAGGTTCAGGGTCT
TTGTTTCTAAGAATCATCTTCCATTATATGAGCAGCTTGTTAAAAAATATACCATGGCTA
ATACATAATGACATCATCTGTTGCACATATTTAAAGGCATGTTCCGCTCCACTCTTTTAT
TGTGATGTTATTTATTAAATGATAGTTGCAGTGTACCTTACCCTGACTATTTGCCAACAT
AATACTTTATTATTCGTGATACTATCTCTGTTGCCAATAGATCTCGCCTTGGAATGTGCA
GTCAAACTTTTAAAACACTGACCACTAAAACAAACTAAACCTTGCCAACATAATACTACC
CCCGTCCTAAAATATAAGATGGAGGTAGTACTTTATTATTCGTGATATTTGTTAGGAAGT
ATTAGTATTGGTCTAGGAATCCTTATTAGTCTATGTTTACTTTCCTTGCATCTCAAGTCT
TGTGTAATATATATATATATATATGCCCCTTGGGCCTTCAATAAAAATAAGTTGCTTTCC
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