Map Locations of contig_157597 (8554 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_157597

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_17211 20 4147 bp MLOC_17211.14 Available Available LOC_Os01g49180.1, FRAME:+1, EVALUE:0.0, 13101.m05113 protein ATP dependent DNA ligase family protein, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_17211






Contig Sequence (8554 bp)

>contig_157597 8554 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CGTTCGCTGTCCCCCCCCCCGCCGCCCGCCCCCGCCGCCGCCACGCCGCCCAAACCCTAA
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TTCTTTTCTTCTGCAAATGATTTTGTTTGAGGGTTTGAGCTTTGACATGGCTTGTCTACA
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TAAGTATCTTAGGGAAAATTATATTACTGTCATCTGTCGTGATTTAGTAGAAAAAAATAC
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AGTTTCCCCCCCCCCTCTTATTCTTACAAGAACTTCTATACCCGTGGAGAAAACATGGAT
TCTTCACTATCTACTTTCATGCATCTTCACTATATAATGATTTGATATTTTACACTTTCT
GAACCAAGAATTCTACCTTCCTTCTCCTTTGAGCAGAGCCTTTCAACTGAAGTTACTGAG
GCATACAATGTCATTCCTAATATGGTGAGTAATCGTTAATGAACTTATTTCATTTGGTAT
ATGATGGCACAGGCTCTCGTATTTCCTAGCTGTTGATTACATTATTATTGTTAAATGTGC
TGAGTATCTAACTTACATTGCTAGAAAAGCTATACCCTTTCCAGAAGAGCTCTGGTGGGT
TTGTCTGGAGAACAATTTTTAACCTTCATCATAGCGCATTAATAATGTAATAGAAAATTG
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ATGTGGTGCCTATAATTAACGGCATTGCCTTCTTTTGCAATAGAATGGCCACATAGAAAC
GAACTCTGTGGCATTTGTTTCTGCCAATGTTCAGGATATCGGTAACTGGTACCATATCTG
TCAGGGGCTGATAAGGGATTAATCGGTGAATCGGCCATTTAACTGAATATATCGGTAACC
CATTTATAGGTAGGTTAACTAGGGCCATATCTATATATCTGAGGTTACATAGCAGCATGC
ATTGTACTGAATGTCTAAATATGAAATCCTAGGCTACAATAGCAACAAGGAAGAGTGTTA
CCTTGATGTTCTGATCATGTCTAGATCTACATATAAGAGCAGCAGCAGCAACAACAACAG
TACTACTTGTACATCAAGGAGAGCAGCACAGCAACAGTACTACTTGTACATCACATAAGA
GAACAGCACAGCAGCAGCAGTACATCAGCATTTACAGAACAACACATCATTTTTTTTCGA
GAAAACGCAGTGAGATACGTGCGTTTCTTTGTATTGAAAAGGAAGAGTTTATATTACAAT
CCTCCTAGGAGGGGCAATGCTGGGAATTGAAAAGCCTATGACTAGTGTACATCCCAGGTC
TGTGGGTAGATGATACGGAGACCGGTCGCTCCTGCCTTGGTCCAGAGGGACGCCTCTTCC
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