Contig Data
morexGenes
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Map Locations of contig_1575945 (4427 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_1575945

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_17206 2 2737 bp MLOC_17206.2 Available Available LOC_Os07g45010.1, FRAME:+1, EVALUE:4e-118, 13107.m04740 protein hypothetical protein
MLOC_17207 1 160 bp None Available Available None





CDS Structure of MLOC_17206






CDS Structure of MLOC_17207






Contig Sequence (4427 bp)

>contig_1575945 4427 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TTTTCTTGGAAAATAAAATTGTGGCAGTATCGTATTGTCTTACACAATACATACTTCTGC
TTTTTTACACGACGGAGGTCAACGTTATTAATGGTCATGGCTACCAGCGTGATGCCTTCT
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TTGCTTTGTTTACTCAATACTACACTGTAAAATGTCAACACGGCACAATACAAAGAGATG
GTGTGTAAAACCCCCCTCTTTTTTGCCATGCAGAGGTTGTCCTTGCATGAGTACTTGTGT
CAGCCTTTTAAAATAAAGGTGGGAGAGAGTGCAGAGAGGACAAAATTTATGTTTTAACCC
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TGTTTGGACCCTGGCCCACACGAGCTTAGATGGCGCTGACATGGCGAAGCGGAAACGCAA
AGTTTCTTGGCGATTTGGGGAAATGCGATGCATCTTGGCGTTTGGTCCTTGGACATCCAG
ATTTTCTGATTGCTGAGTTGCAACCATCGCTGCATGTTGTATGCCTCTTGTATCAGCAAA
ATTGACAAAAATGACCCCTGAGGCGAAAGAACTTACGGATTGACCCCGCGGGGAAATAAT
TCACCGGCCTGACCCTTTTGTGTGGCGTCCGACACCTAGGCGCCACA