Map Locations of contig_1575265 (6907 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_1575265

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_17007 2 3042 bp MLOC_17007.1 Available Available LOC_Os12g41230.3, FRAME:+1, EVALUE:3e-124, 13112.m04299 protein tesmin/TSO1-like CXC domain containing protein, expressed





CDS Structure of MLOC_17007






Contig Sequence (6907 bp)

>contig_1575265 6907 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCTATAAATATGTATCCCCAACCCCTCAGGTTGGCATGGCATTGTGTGAGAAATAAACCA
ACGAAAATTGTCCCAACTCTCCTAGTGTCATCCACAACTATCAATGCTCAGGCTGAAAGG
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CTAGTAATTACATCCACACCTGTGGAGACAGAGTCCTTGTTGAGTTTCACATCCATGTTC
ATCTGTATAATTAATTTATATGTTTTTGAGTCTATGTAACTGTAACCGAGGTCAAATCAT
TGTGCCTTAGATGTACTTATGGTTAGAATCCTTTAAGATTTATATGTAAGAACTCTGGGT
ATTTTGGACCTTCGAGTATGTGTTTGCCAATGAACTTGAGGGAACATCTGATTACACTAG
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CTTGAAGGTAGGGTATAACAACCTACCCCCAAGGTCCCTGACGATAGGGTTACACGCCTG
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GGCGGTAGGGTCATACATCTACTGCCAGCCCCTGCGGCGGTAGGCAAGGGACCTTGGCGG
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AAGTTTTTAAATGGGATTAGATCTGGCTTAACTTTAGAGAAAAGGTCAAACCAGTGAATT
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CAGTCGATGTCTCTGCTTTGCCTTCAGCCGGCCCGGCACCGAGCCAGCTCACTGCGGCTT
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GCCCAACGCCGTGACAAATCGCCGAACACCTAGCGGGCATGGTAGGCGCGCAGCCGCCCG
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CGCGGCAAGCCCTCTCTTTCTCGTGTGGGGGGGAGATGACCTTTCTAGCAACGGATGTCC
TTTCTAGCAAGGGGGGGGGGCATGGACTATCAGCCTATCATCTCGGCGCTAGATGTCCAT
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AACTTTTTCACAACTCAGGTGCGGGAGGATTCAATCCTCAACAAATCTGTCTGGGCATGG
CCGTGGCGGCGGCCAATGATGTCTACTACGCAACTTTCTCCTTGTAGACGTTATTGGGCC
TCCAAGTGCAGAGGTTTGTAGGGCAGTAGCAATTTTCCCTCCAGTGGGTTACCTAAGGTT
TATCAAT