Map Locations of contig_1574972 (4289 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_1574972

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_16938 1 1845 bp None Available Available None
MLOC_16937 1 1328 bp AK364984 Available Available None





CDS Structure of MLOC_16938






CDS Structure of MLOC_16937






Contig Sequence (4289 bp)

>contig_1574972 4289 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
ATGCGCTGCTCTCTGACAAAGCCCAACTTCTGACGCTACAGCCAAGTTTGTGCATGGAAG
TAGGATGTGGCAGTGGTTATGTCATCACATCTCTAGCCATCATGCTCAGGCAATTAGGCT
CTGGAACCCAGTACCTAGCAACAGACATCAACCAACATGCCGTGGAGACAACTCAAGCAA
CACTTGAAGCCCATGGTGTTCATGCAGATGTTATTGCTACTGATATCGTGTCAGGTCTCG
AGAAACGTCTGGCTGGCATGGTTGATGTGGTTGTTGTGAACCCTCCTTATGTGCCAACAC
CTGAGGAAGAAATCGGGATGAACGGCATTGCTTCATCTTGGGCTGGAGGGTTGAATGGGC
GCCAAGTGATCGATCGGATTCTCCCTGCTGTACGCGAGCTGCTATCAGAAAAAGGGTGTC
TCTACATGATTGCCCTTGAAGACAACGATCCTTTGGGCATATGCCATTTGATGAACGAGA
AGGGATTCGCATCGCGTGTTCTGCTGAAGAGATGTACTGACGAGGAGAGCCTTTATGTTC
TCAAGTTCTGGCAAGATGCTGCTGCTGGTGCAAATGCTTCTCAGTCCGGTAGATCTCCAC
GCGCCGAGTCGTGGCTTTCGCAGCTGCCTTTCAAATCCTTTTGGCACAAGAACTCTGGCA
GTTCTTGACCTCATCAGTTTGAACCCTCCCATCCATCATCAAATATATCAAAGCAAGGAA
ACCTTTGCGAAATTCATATGGCGGTAATGTGTAGAAGTGTCTGAATGAGGTCTTCTGTCG
AGTTCAGACCTGCCTGTCCTCTGAGAACACGAACCAGACTGACATGGCAAACTTAGCTAT
GATCCAATGAGCAATCCAGCCTATCGTAGTTGAAATATACCAAACTTTCCGTGTCGGTAA
AACAGCTGTCTTATTATGTTGGCATCATGCGTATTAGTGTGTATATGTGCTATAATGAAC
TTTCCTGAATGTGACATACGCTGTTAAATTGTGCCTTCGTTTTGCAGAGAGAAATTCTGC
CCAACTTCTGGGTCTGTGAAAAATTAGCTACTCCCTCCAGTCCATATTAATTGACGCTTC
TTTCGTTATGGATTGGAGGGAGTACAAGAATTTGATGTCTGTTTTGTAGTACGTACGATG
GTATGATTGCTCCTATATGCGCAGGAAGATACATCTGCAACCTGGGTTTGTTCTCAGGGT
CGTGTCCGTTTGTTTTGATATATTTTGTTAACGTAATTAGTGCTCAATTTTATGAGCTTG
GATCCCATGCACTGTCGCGTCTAGAATGCAGCTTCGAACAGATGTAGTGGACTTGGGACG
AGTTAAATCTGCCATAAGCTCTCCTCTTGTGAGTGAGTGCCAATTTTTGATGAGACCATC
CTCTATAAAACTAAGGTCCCTTGTTTAAAAGAGCTCACAATCAATTGAGGTCGTCAATTG
AAATTGGGTCATCTGATTTTGATCGGGTCAACAATTTATCAAAGCTCTCTCATTCAATTC
AATATACTATGCTTCCTAATTTCGGGTCATTCAATTTTGACCGGGTCAAGAATTTCTCAA
GCCCTTTCATTAAAAAAAGTCAATCCACTATATTCCCTAATTTTAGACCACTTTCATTCA
ATTGAGGTATTTAATTTTAGATTTGGTTCATGATTTGAATGGACCAACGATCTTTCAAAT
CAACTAGCAGCAACCGGCCAATAAAACATATCAATTCCGCGCAACCTCCAACCACCTTGA
TAATAACAAGTGTCACCATGTGAATTGTAACATCAATATAAAACATGCAACCACTGACAC
AAAAAAAAAATCCATATAAATATAGGTTGGTTAGCGGATAATACAGAATCACACGAATGA
AATGCCCACTAAATCACCGCATAATAAATAGAAGTAAAGCACACACTCTACCATCTCCCT
CACTTGCCAAACTAAATATTCTATCAGTTCCAAAATATAAGGGTGTTAGTTTTTTAGGAA
GTCAAATTTCTTTAACTTCGACCAAGTTCGGAGCAAAAAAATCGACATTCACAATATTAA
ACGAAAAAATTATGGAAATTCATTTCATGATGAGTCTAAAAAATACCGATTTGATATTAT
GAATTCCGGTATATTTCTCTAGAAATTTGATCAAACTTAAAAGATTTGACTTTTAATAAC
AATAATACACCTTCTATTTTTGAAACAGTGTGATTATTTTTTAGAAACCCAACAACACAA
ACAACGCAGCAAAGCACGCCCAACCCTTCTAGTATTTGCTAAACCTCATCGAAACTTCAG
CAAAGAGCAAATGGCTGAATTACAACAAATTGAGCAAATACACTTGCAACAAAGAAAATA
CAAAACAAAACAAATTATGAAAGAGATCAAGTTAATTTTAGCAGAATTGGAACTTCTCAT
ATTTATAAAATGATAATATAGTACTAATCTGTTACCTAGTAATAAAAAAATAGGTAACAT
TGGTCCGTCGTGCTATTTTGCAGAAAATCCCAGATGTTTCTGGTAATCAACCCACACTCC
AGTTTTAAGTCAGATTTTTTGCTTTCACAGAGAACTCCACTGATGTTCCTGGTAATCGAC
CCACAACCCAGTTTTAAGTCAAATATTTTCTTTTCCATGAAACCCCTAGATATTTGGCTT
AATCAACCCGTAGTACATGTCAAATGATTTTTTTTAAATACCCTATCTTTTAAACCCTAA
CTCCAAATTTAACATATTATATATGAAATTTGATTAGAAAAATGTGTAGAAACTGAATAT
AATGTCATTTTACAAATTAAGATTTTTTTTAAGTGTGTGATCTTCGTGCAAAGTTTCATG
AAGTTTGGTCATTCGAATAGTTCATGGCAAAAAAAACAGTTTTTGGGTATCTGAGAAACT
TTCAAAAATCGCACTGTTCACATCCTTTTTTTCCCGAGCTACTTGAATGTCCAAACTTCA
CAAATTTTTACACGTTCACACACACAGGAGCATCTTGCACTACAGTTTTTTTTGGATTTT
TTTATTTTTACTGTTCGCTGTGTGCATTTGAGCCCGGGTTCCATATTGAATTATCATTTT
TTCCTCACATCTTCTGTTTTTTCATCAAAAACCCACCTCAACTGCACCATCTCTTATTAA
CTTAACAAATAAACTTCTATTTCTTTGATAAGTCGATAAATGATAAGCAAAAGGTATTAA
ATCCTATTTTCCATGCAACCACATTAATATGGGTAGGTATCGTGTTCAACATAGAAGAAT
ATTTAATCCCCAATTGCAACCGCTGGAAATTATCTAATGATACGTCTCCAACATATCGAT
AATTTATGAAATACTTATTCCGTATTTTCTAATGTTTATAATATTTTTATATAGATTTGA
TGCACCTTATATGATTTAATTAGAACTAATCCAGACTGACGCTATTTTCAGCAGAATTAT
CGTGGTGTTGTTTTTATGCAGAAAATAAAAGTCCTTTGAATTGTCCAGAACTTTTTGACG
ATTTTTTCTGGATAATACGAGAAATACCTGAGCGAAGAACAACAGAGAGGGGCCACCTGT
TGGCCACAATCAAATAGGGCGCACCCTGATAGCTTGCGGGCCCCTCGTGGCTCCGGTTAG
CGTGATTCCAATGCCGAAAAATCCTATATATACAAAAACCTTCAGAAATAAACCTAGAAC
TTCCGCTCCGCCCCCGCAAGCCTCCGTACCGAATAAAACTCATCCGGAGCCCGGTTCTAG
CACCCTGTCAGAGGGGGCAATCATCACCGGAGGCTATCTTCATCATTTGGGCGGTCTCCA
TGACGAGGAGGGAGNNNNNNACCCTCGGGGGTGAGGGTATGTACCGATAGCTATGTGTTT
GATCTCTCTCTCTCTCTTTCTCGTGTTCATGAGATGTCATGATCTTGATGTATCANNNNN
TTTGTTAATATAGTTGGATCATACAGTGTTTGTCCCTTGCTATCTTGATGCGATAAATTG
AATCTTCCCTTTGAGATTTTCTTATGTCGGATTGAATATTGGATTTNNNNNNNNNNGATG
TATGTCTTGCATGTGGGTACCCGTGGTGACAATGGGGTGTTCTGTTGATTCACTTGATAT
ATGTTTTGGTACTCGACTTGTGGGTTCCCGAGGTGACAATGAGGTAATCTATGCATATGG
GTTCATACACGTTCTTGTTATACTTCCTTCGATAGAAATCTTGTGGCTACTCTTTGAAGT
TATTTGTGTTGGATTGAATATGATGAATCTGAAATTGGTTGATGCATATCGAATAATTAA
CCCACGGATACTTGAGGTGAAATTGGAGT