Map Locations of contig_157460 (10028 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_157460

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_16827 2 1228 bp AK363729 Available Available None





CDS Structure of MLOC_16827






Contig Sequence (10028 bp)

>contig_157460 10028 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCCGCGGCGGGGCGGGGGCGCCCCGCGCGGTTTTCCCCCCCCCCCCCCCCCCACCCCCCA
ACACATTGCTTTCTCCTTCTCCAAGTAAACTCAGTTTCCACCGCTCCGCCGCGCCGCCGA
TTCGCCAGCCATGCTGACGGGTGAGTTCCGCGCCACCCTTTCCGGTCCATCTGTTCCTTA
CCGAAGCATCGATCCGATCGCCGCCATTTCCTTTTCCTTTTTGTCTGCCAATCTTGCCTC
CTTTTGAGGGTTTGGGCTTGCGCGGATAGATCTGCCTCCCGGCGTAGGTAAGTCGGGATC
ACCGGTCGGGAAGAATACGGCGGTGGCAGCGCCGGAGATTCGCGGCTAAGGTTGGTTTCG
ATCTCCCTTAGTAGTGGATTCGAGGTGATTATGCTTATGAATTTAGGGTTTAGGTTTAGC
CGCCTAGATTTGGGCCTGCTACTGCATGTCCTAGTCTACTCGTGTTGTTCTCCCCGCATT
TGTACCGATTGGAATACCAAGCCTCAGTTTGGCGTTGTTGTGATTATCCAATATTATATG
TAGTATGAGCTATATTTGAATTCGCCCACAGATCTATTACATCAAAGTAGACGAACACAT
GCGCACAAAATCTTATAGCCAAGAGCCCCTAACGTGCCCTTTATTTCTCTATTTTTTCTG
AAGCTCCACGGTACAATCTTTTGCGGCCTCACGTATTTATACACACAAGGCCACGAACCG
ACAAAGAAACCTAAACCTATACAGACTAGACACAGCTAACCAAACCTACTAGTAATAGGA
CTTTCTCTTTCCTAGTCTGTAGTCTAAGCCGGACTAGTAATTTCCTAGCATGACACAACA
CGTGTCCAACTCAAACGTATAGCTAACACATGTACGATGTCCAAGCCAATTAGCAAACAC
ACTAATTAACCTGCTTAGACTCGAGTGCTAATTCACGCAGGACTTTACCACGAGATTACC
TGACAAGCTATATGATGTGCAGAGGGTGGATGTAGTATAGGGTCATGTCAAGTACTGGAC
CCAAGCTACTTATAGATATGTTAAATGTACTACTTGATTGCCCGTGCGTTGCCTCGGCAT
TTATTGTAAATTGATTGCTTTGTGGGCTCATTGGTCAAGCGCAATACATGTGCAATTCAC
ATCCATATCGTGGAGAGCATTGATGTCATCCTCCCGTGCCCTTCCTCTTTTATAATCACT
ATGCACACTTGAGATGTCCTGCATATGGCCTAGTGTTGAGACAAATATTACCAATCGCTT
CCTTCCACTATACAACGATCACCACACGCCTCTCATGTTTCTTTTCTTCCGGTCATTGCA
AACATAATGCATGAGAAAATTCTTGTGTACACAAAACATAGTACAATTCTATTCCAAAAC
AACAAAAACTGACATTGCACACAAAGAGTAGGGGAAAACAAATACACCACTATTTAACAC
CTTCACCACCCACTTATCACCTCTCTCACCATTTAGGCCCTCACCAATACTACCATCGAA
ATCCTACACACCTACAAGACCCCAAATCCAAAGGCCCTCTCCGAGCGGCAGTGGCGGCTC
TGACACCCCCTCCCAACCGATTGTTAACATCGTCCTGTCCCCATCTGATGCATGCACGTC
TCTCACCCAAGGTGCCTTGCTCCACAAGCGGCGTTCTCCAGCTCAGTCCATCTCCATCTG
TGTCGACACAACTTCCCATCCGAACCCTAAGCAACGGTCGCCGTCATCCTCCATCCCTAC
CTTGCACATCTTGTACATAGTTCTTAGCCGCAATGAGATTGTGAAATGCTGAGAGACACA
CGTGGAGCCATACAACAATGGAGTTAAACGCCGGAAGAGCAAGCACTTCAGGTACTGAAC
ATAACAGAATCTAGTCAGACACTTTCAATTAATCTTGCTCATCTGGTCTGCCCGGTCAAA
TGAGCGATCATGTCCCCTTATTCTAGCGGAGGAACAAAAACAAATCTCATAATATTTCGG
GTGTCAGATTGTGATCCAGGGTTAAAGAGCGTCGTAAGCAGCCCAACTCAACTACCTTGT
GTAACAAATGAAGAAGAGCAACACGAACATTGTCATATGATAACACTACATATATCTTTC
TGAGAGTAAAAATTATCAAACCACCAAAACTTCCATCAACCTTACACGTCATGTCCTCAC
CATGACAAAGGCTCCTCACCATGCCAAGGCGGCAACAAATATTTTGTGATAGCAAGGCTT
AAATAAGAAGAAAAAAGAAGAATAAAAAAATGCGACGGCAAACAAAAAAGAGAGCTCAAG
AATATAAACTCGGTTCATCAATAGGCGTGTTACATAAAAAGAAAACATAATTGCGTCTAA
TATTCGTGTGCAACATAAGAATCTGAATGTAGTTAAAAGAACTTTACAGATACCATTGTT
AGATATTTGACCTCATCTGGAAGACAAGTACATCTCTAGTGCATAAGTTACATTGTGATT
TGCATATGCAGGGAAAGATCGTCCTTATAACATGAATGCATGTTCGGAAATAAATTAACA
ACCACAAAAACTCTTGCGGCCATCATTCAACCGATGGACAAGTGTATGAAAACACAACAC
TTCAGTGTCTGACCTTGTGACTTGTCATCTGAAGATCAAAACCCACTGTACTGTATACAA
GCAGTTCCAGCATGCAAGGCAGCTGGGTGTCATGAGAATCAAACTTGGTATTACAATATG
ATTAAGATAGAGTGCAGAAAAAATATATTTTCACAACAAGATATACTTTGCCATAAGTTG
CAAAATCTGTGCCTTTTGGCTGGTTTATTACACAAAATAATGCCCATGCAACTTCAAAAC
AATTGTTGCTTAGTGATAACAGGCTTACCTACAGAGGCTTGCTAAACTGTATGTTTGTGT
CAATCGATTGTTGTGAGCCCCTGGATTAGAAACTGACGATCAGATCTTCTTCTTACTCCA
AACGATTCACTATCCATCTTCTTCCTCATGCGAGCTCCCTTCGATGCTGGCGAGACCGCG
TGCTCCAGCACTCCATGGCCGACGGCACTACCGTGCATGTCTTTGCCGCTCGTCCTCCCT
TAGCTGCTGCCGATGGACTTGTTGCCGTCGCCCCGGTTCTGCCAGCACTCCTCCATGCAC
CCTAATAGTCAACTTACAACTGTCCTTCACCTGGAATGTCGATGTTGCGTCGTCCACGTC
TTCGTCTCGCTCCTATCCAAGATTTTGATGTTCTCCCCGCAGGTTGCTACACTCGTCCTG
ATGTTGCTGTCTTCGCCTTCAGTGCTGCGCAGAAATCGACTGATATAAAAGCAATGTTTA
GGTGCCTGAGGATCAACATAACCGATTAATTAATCTATTTCCAGAAAAAGAATTGATGAA
ATAACAAAAAACTCGGATCGGCGCTAAGCTCGATAAGAAATGTTACAATATAACTGATGG
AAGTCATCTACAAATATGATTCTGTGATTATTTGTAGCATTAACCATGCATGTGCCTTGG
ATAACCTCAATCCTGATAAAAATATAATAATATGCGGTGCTAATCAACTTATTTACCCAC
ATCTATAATAGCAAATACCTATAGGACTTGTTACTGTTGTTTAGAAAATATCGACGATAA
GAGAATAACACAAGTGTAACTCTAGAATAAAGTGTCACGCGAGGGAGTTTGGGATATGCA
TGCGAAGCAAATCACAACAAATTTAAAGTATCACACGGGAGTTAGGGCTAATCATGCAAT
CAGAAGCCACTTCTCAGGCCTGAGCTGTGGGGGAAACTGCTTCGTGCTCTGCAATTATAC
TACGATGAGACGGTGGCATGGCATCCATCGGGCGTCCGGACAAATTGAGCCGCCCGCCGC
TGGTAATTCCAGCACCAGCTTTGGCGGCATCTACCCCTTCGCCATCGTCTCGACAAGCGC
ACAACCAATTCTCGACTTCTCGTACAGGCGTACACATACCTGATCATCTGGGAAGTTACG
GGAACCACATGAGCTCCGTCCCGAAGGGCATCACCCATGCGCCCCTGCACGTCCGGATCC
CGCCATCGCACCTCGTCCTGGGGCAGCATACCCAACGCATCTGTGTCAGCCTCCCACCAG
GGTGGCTTTTACTCCGCCGCTATCACCTCCTCCATGATTCGGGTCAACTTCTGCCCATGC
TTCCACTCGATAAGGTGCTTTGTGGCCATGATATGGGCCGGTCTCGGCCAATACGACACC
CTTACGCGGCTGAAGAATCGATGGGATCGACCTCCATGTATTTTTTTATCGCTTGGACGA
CGAGGGATGGTGATGGGGAGAGATCTCGAGACGGATGGGCATCATGGAAGAAGTGGACGA
CGTGCGTGCCTTGGTTTCTAACTTCCGTTTTTATTTTTAATGTTTTTTGTGCGGGAGGCA
GATAATTATAGCGTTAACAAAACGACGATCTTTTTTACTGCGTGCGATCAAGGGGTTGAT
CGATAGGTTGAACCATCACGACGACAACGACGACGGTTGATTGCCCTTTAATAGTAGAGA
CTTTTATCTAGTTTCCGAAAGCAGACAACTGAGCTCTATTTGGCACACAGCCCATGTGAT
ACCATTGTGATTTGGGCTGGCGACTGTTAATAAATTTTATATGAAATAAGCAATGTAGTG
CCAATCGCAGTTTATTAGGCATGATGTTTCCACTATGCAGCTTTGTATTCTGTTTCTAAT
GTTAAAAGTATTAGCCTGATGGCGGTAGGGTCACACGGTTTGCTTAATTGATCAGTTTTC
ATTACCGCCTCAGCTTTTGGCTCCCAATTTTCATCTTGTACTGCTGTCACTACCAACATC
AGAACATATATATTGATTGGTGTTCTATGTGATTTTATATGATTTTAGTATTTATTGTTG
GCAATTGTACTTCAAAGTTCATTTTAATGATTTGTTAAAATTATTGGCTGGTGGCGTAAC
ATAAGTGCATTCACGTTGAAACAACTTGTTTTCTTGCCATGACTAATACTTTAGATATGC
TTTCCAGTATGCATAAAATGGCAGAAGCAGGTCTTTCCAGGCATAGAGATTGATACTAGC
CAGCCGCCTGTGGTTTTCAAGACCCAGTTGTACACACTGACTGGTGTACCCCCTGAACGG
CAAAAAATTATGGTGAAGGGTGGAATATTGAAGGTACCATGTTTTGGTGATACAATATCT
AGGATATTAGACCGAATTGATTGTCATTGTGTATGCCATATTTAACGTGTCTGTAACCAC
TGAATGCTCTCCGTACGATTGCAGGATGACACAGATTGGTCTACTTTGGGACTCAAAGAT
GTGAGAAGCTCAACTTATCTTCCATTCGCAGTTTTATTTTACTGGACCCTATTAGTTTAT
TACATTCGACAACACTCCTTACATTGGAGTATCAAAATGCACTACGCAGGGTCAAAAGTT
GATGATGATAGGCACGGCTGATGAAATTGTGAAAGCTCCAGAGAACGGCCCCGTGTTTGT
TGAAGATTTACCAGAAGAAGAGCAAGCGGCTGCACTGGTGTGTATGGCGTTTGTGTTCTA
TGCGTATATCTGATGTTATTAATTACGGCTTGATCTGTACTTTTTGAAGTTAATATTTCC
ACGGTCATCAGACTTAATGGATAATATTGAGCTTGATAACCTAATGAACTATAATAAACT
TTGTCTTTACAACATATGTCTGCACTCTGCAGGTGCTCTTTCTTGTATTAAAAATAGATC
AAACTACCCTCGCAAAAAAGGAAGAAAGAAAAAAAAATAGATCAAATTACGGAGCACAGT
GAATACCTTTACATTTTCTGCTAGCCATGGAGAGACATTAGATGGAACACATGCTCCAAC
TTGTCGATCAGATTGGACACTTCTTACGCTAAATATGAATTTTTCTTTCTTGGATAGCCA
GTTTAATGTAACTAAGTTGCTGATCATAAACCAATAAAAATTATTTTTCTTTGATAGCCA
GTTTAACTTAACTAAGATGTGAACCAATATAACCAGTCAATAGGGAGTGGTACTATATGC
AGCCAAGTATAACTTCTGTAGCTCTGTATGAAATCATTTGTATGTAGAGCAAGATAGGTT
TGTTGTCAAAAGTTGGCATCCAAAATTTGGGAAATGCCCCACGCTGGCTAGCGATTGGTT
GGTTACCAACCTCCCTTCCAGGTTCACAAGAAGTTGCCAAATTTTTGCAACTTTTGATTT
TGCCAAATATTGACATCAAACCAATCAGAATAGTATCTCTTGACTTCAGCGCCAGCATAG
TGGTTTGGTTTTGGGTGTTCTCTATCTATGCTACAAGTAAGGTTGTTTTTGTGATTTCCA
GGGGCACAGTGCTGGTCTCTATAATCTGGGGAATACATGTTACATGAATTCCACCCTGCA
GTGTCTGCATTCTGTTCCAGAGCTCAAGTCAGCACTACTGAGGTTTCATTCCCCACCCAT
CCCTCAAAAGCCTGGTATAACTGACTTTGACTATATATTGTTTGTTCTTGGTGATCTCAT
TGTCTTTTGCTCATGCAGTTATTCAGATAATGCGAGGGGCAATGGGGTGGATCAAGCATC
CCATACTTTGACAGTTGCAACTCGTAATACTTTTGGAGAGCTTGATCAAAGCATCCGACC
AGTTGCACCTCTGCACTTCTTACAGGTCAGAAGTCAATTCTGCCCTCGCATCTCAAGCCA
GTGAAATCCTTACTGAGTTTCTGTGAGCACAGGAATTTCTTATGTTAATAGTCTGTTTAT
GGTATCTTATAAATTAGATTAAGAATACTACTCATTTTGATGGGTTTTTGTATGTATGTG
TCAGGTCAAAACATTTCAATCTTTAGCATTATCATGTGTAAACGTACCATGATTTTATCT
GTAGACGACTTTACAGTGTTATGGTCAAAATCTCCTACTGAAGACCGGAAAACTTCAGAC
AACTACCTACAATTTAAACAGGAGAAATTGGATTTTTTTGGGTTCAGTATGTATTTTGAA
TTTTTATTGTATGAGATGAAAAAAGCAGTATAGTAAAAAATCATACATTTCAAATACAAA
ATTTGCTTTTATATTTTTTTTAAAAATGTGCTAAGTATAGTTTAAGTGTTCATGATCCGA
GTGCATAAGGTAATGTGATTATAGGTGTAGTTGCATTTGGGTTGATGAAAGTTTTTGAGG
GGTCTTTTATTGTTAGAGGGACAACCCGCAATTTCAGTCTGGAACATGAATATTAGAAAT
TTGCAAATTGAAGTCCTTAAAAGAGCCTTTAGAATTTTAGGTAAAAAGGATCCTAGGCAT
TGCTTTGCAGTTTGATTCTTTTTGTCCCTAATGCAAGATTTATGATCCGACGAGTCGTTC
CAACGTTGAGACTCATAGACTAATTGTGACTAGTTTAGACTACTGCTGAACTAGTTGACA
TGGTACTGTAGTACACAACTTACAGGAATCAATTACTAAAACCTAGTATCCAATAAAAAT
TGATGTAGTATACAATGTAAATTGTATATGTTGGAGCATCTATTTGCCCTGCAGATCAGG
CCAGAAAGCATATTTCCATGCTGGGTCCTTGCTCCTAGTTAGCTTCCTCTCAGGATGCTC
CGATGGATAGTAATGCTCATTGGCGTGAGCTGCAGCTGCTGCTGAACACACTACATTGTA
GCTCAGACCTAAGGATCTTGAAATTGAAACAAGCAAAACGGAAATCAGAAAGATGGCAGG
GGAGAAAAATCAAATCTAAGAAGAAGCGAAGGAAAGAGGGGAGAAATTACTTGCAGAAGA
GTGCTTGCTTGCTTGCTGCAGCCTGGCGGAGGTGCAGATCCAGGAGTAGAACCAGCAGAG
GGAGACCGGAGGGGCGGACCCAGGAGAGGAGAAGAACCAACAGCGGGAGAGCGGAGGGGC
GGATCCAGGGGAGAGCAGAATCAGTGGAGGGAGAGCAGAAGGGCGGATCCAGGGAGGAGC
AGAACCAGCGGAGGGAGAGGGTCGCAATGCTCCTTGACACCGTAAGTGGCGGTGTCCGGT
CAGTGGCTGCTGGCAGCGGCCTTGTCCCAGGTCTGGAGCGAGGCTGAAACCTAGCTCTCC
ATGTTCTTCCCTCCATCGGGCTGTGGGCTGGGCCGCAGGCTCACTTATCCCCTCCCAAAT
TTGAGTCCAACTAGTTTCTCGGCCGCTCGACTCGGTGAGGTAGTCTACACGAAAATCCTA
GTCGACGATGACATGTGCCCCCTAGAGCCAAAATGGATATTCGATAGACTAGTTCCTTGA
CTAGTCAAGACTAGTCCTTTGACTTGTAATCCTGGCCCTAAAGTTGAAACTAAAAGGAAC
ATTTGTACCTAAATGAAATTTGTCGCCAGTCAATAGTTATAGATTCACACTAAGAGTTCT
AATTGTGCAGCATCAGAAAGACTGATTTCATACATTCAACTAAAAATGAAACTTCCATGG
TTTTCCCTAACTGATTAACAGTAGAAATGATTAAGACGTTGTTTCTTACCCGTTCTCCTT
TGTGTGCATGATTTTGATTTACTGTTGTAAAACAAATATTTACGATTAACTGCACATAAA
TTAGGTTGCATGTACTACACGAAAATCCTAGTCGACAATGACATGTGCCCCCTAGAGCCA
AAATGGATATCCGATAGACTAGTCCTTTGACTCGTAATCCTGGCCCTAAAGTTGAAACTG
AAAGGAACATTTGTACCTAAATGAAATTTGTCGCCAGTCAATAGTTATAGATTCACACTA
AGAGTTCTAATTGTGCAGCATCAGAAAGACTAATTTCATACATTCAACTAAAAATGAAAC
TTCCATGGTTTCCCTAACTGATTAACAGTAGAAATGATTAATATGTGTTGTTTCTTACCC
GTTCTCCTTTGTGTGCATGATTTTGATTTACTGTTGTAAAACAAATATTTACGATTAACT
GCACATAAATTAGGTTGCATGTACTCCCTTGGTTCCAAGATACAGTGCTTATAGATTTTT
CTCTATAAACTTGGTTGAAGTTAACGAAGTTTGACTTTTGAAAAAAAAATATGTGCACTA
CTTTGGAATGGAGGGAGTATTTGACAAATTGAATGCACATTAATGGTAATTATTTAGTTT
GTTAACTTGCAATCCAGAATTCCAGGTTCTAAATATATTTTATCTAACTTTATGCAGATG
CTGCGGAAGAAATACCCCCAATTTGCTCAACAGCAAAATAATGTTTACATGCAGCAGGTT
CCTTCTGTTTGCCTATGCTTAAGATATACTAGCTTGTCTACTGTTGAATTTACATGCTGA
TATAATATGGCTTACTGCAGGACGCAGAGGAGTGCTGGACACAGCTGGTCTATACGCTTT
CTCAAACCCTTACATCAGAAGCAAGGTAAATTGCGCGATTTTGTCCAAAATCTCGCTCCA
GGTCACTCCTAACACTTGTCTTATTATCATCATTTTTTATAGTTTTGTATTTTGGATAGG
CATGTACAACACAGCTTGTGGACTTATATTCAATTTAATTTAATTTAAACTTGTGGTTTT
TCACGAGTGGGAATTCAATTTAATAACACTTTTTGGCTTCTTTGACAGTGAACCTACTGC
TGGTCAGATGAAGGAACTTTTCGGGATTGATCTTGTGAGCAGGTTCTATCGTCCTCCCTC
TTATATCTGTTTTTATGGCTCTATATGTTTGTTTTGTTTTCTTGAACCTGTATGTTCGTT
TTCTTGTAGGGATTTGTCATCAACTTGATACTGACACTGCTGTATTTTCACTTGCATTGT
ACAGTGCATAGTGATAGTCAGTTGGCTATTGCTGATAACACTAGTTTTATGCATCTATTA
GAAAAACTAGGTCTCCTGCATTTCTAGGACACCAAAGGATATAGAGCATTAGAGCTGCAG
TCCCCTGTAAAAAATGATGATACAACATCTCGGCAAGCAGGCATAGCTTATTTTGATCTT
TCCAGTACTTCATGTACGAAGGATCATGTGTTATTTCAAATAAGGCAGCTAGATTACTCA
TCTAAATAAAAGGCAGGTATTCATGTACTACTATTTGTGTACGATGACTTTTATTTGCAG
GGTACACT