Map Locations of contig_1574258 (7920 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_1574258

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_16711 3 1631 bp MLOC_16711.1 Available Available LOC_Os12g40510.1, FRAME:+2, EVALUE:1e-146, 13112.m04212 protein calcineurin B, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_16711






Contig Sequence (7920 bp)

>contig_1574258 7920 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
ATAACTACTACTACATTACTAAGGGTAACATGGTTTTTTTGCATGTCATTTAATGACCTC
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GGGAGTATTTTTCCATGTTTTATTTTTTCTTCACATTTTTTGAAATGTTTTGTTCACTTA
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ATAGAGTCTTGGCTTAACATGTCTCAGCATACCAAACAATAACAAATGCATGTACTCAAC
GTGTTTACACTCAACATGTATCACAGGAGAACAACCATGCTAGGTTGGAAATGCTACCAA
ACACACTCGAGGATGTTACTATTTGGCAGAGCTGTTGCCTGGTCTTAGGGAGCTATGGGT
ATGGATATGTTTGGATTGAGACCTGAATGTTGTGCCGATGTTCCCTTAGCCTCAGGGAGG
TCACTGAACTACCATTCTCTCTATGGAAGGTAATCCGAGTGAACAAACGCTTAGATATGA
GAGTGTTCCCTTGAAATACCATACACGTCGAACACTCAGACTCAACATGCTCAAGATGAT
ATATGGCCATGTTACTATATAAAGATTCGTCATCTTGTATTTTTTATAATGCAAGCATAA
AGATTGCCAAGAATTTATAATGTTGCAGCCAAGTAATCATCATGCATCTTTAAGAATTTT
CCATGGTAAAAATGAAATTCCAGCTTGTTCAAGACTTGCCATGCTCAGAGAAGAAAATCA
CCACACTACATTCTTTTTTTTTCGCTTGTGATTATTATCTTGAAAGCCCATGGGATGCCC
GAGGGAGTCCGGGATTAAGGGGTCCTTGGGCCTTGTGCCTATTCTCATGGTCCGGACTCC
CGGGCTTGTTCGACCGTTAGTAGAAGTATCGGACTTAAGATGGACTATTCTGAAGACTTG
GCGTACAATCCAAGGCGATGTAGTAATCGACATATTCCTTCTCTATTGTAACCGGCCTTG
TGTAACCCTAGTACCCCTGTCATCTATATAAGATAGAGGGTTGTAGTTCGTAGGACACAT
TAAGCTCATTATGATTAGGGTCTAGACCACAACATCCGATCTCGCATTAGATCAACCCTA
TACTCTGTACTACTCCATCAATAACAACAAGAGCAGGACATTGGGTTTTACCTCCATCAG
GAGGTGTGACAGCCCGATGCCGACGTTCGAGAAGATCCCCCCCTTTATTCCGTTTTCGTC