Contig Data
morexGenes
Links



Map Locations of contig_1574203 (5075 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location No map location




Predicted Genes from contig_1574203

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_16684 1 1572 bp AK354651 Available Available None





CDS Structure of MLOC_16684






Contig Sequence (5075 bp)

>contig_1574203 5075 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TGGGCTGGGCCATACCGGTTCAACAGGTGCCTTAAGTAAAAAAAGTGATGTAATATTGTT
TACATCGTAGGCAAAGCTAATGTTCTAACTTGAAGGAAAATTTGAGGATTTCGTCACCTA
AATGGCACTCTAACATCTCTTGATCGAGGCCTTTCCCAAAGAAGTCATGTGATGGAGTTA
TCCTATTTGACCACTCTAACCAAGATCTCCCCACTTGGTCAAACAAGCCCAAAGCACTAT
ATGTTTCAAGCAGTATGTGCTCCTTGCTAACTAATTGCTAGATTTAGAACTTGAAAGAAT
GATTTCTTTGTCTTCCCTCTATTGCCAATTGCCGCTTTAAAGTAATTCAGTTCAATAGAT
CCTAATTCTTTGGTGAACCCTGCTGCATTACATTTCTCTTAAATTATTTTTCTTAAACTT
TCATGCCTTCTTTAGGTACAAAGACAACACGGAGTCTCGCAGCTTAACCTTACAAAAGCA
AATTAGTCGTTATGCCCCCATCCATTTGGAACCAGAGGTAAGTGAGTCTATAAGTCAGCA
TGTACCTTTTGGTCATTGATTTGATTAACATTTGTTAATTCATTTTGACAGTTGACTACT
CTATCTGAAGGAGACAGAGAAGCCTTGGGATATATTCTTAAAGCATCAATGGTTATTGAT
GAAATATTTTATGAGCAGGTTAATTCTTGCATAATATACTGTTCAGATATTAGTTCTATT
TCATATTGCTTAGATGTCTCATGTATAGTTATGATAGCTTTTCTTGATAACATGCCCATT
AGTTTTGCACTGTATAGTTCTTACGTAATCATCATTTAATTTAATTCTACAACTTCTTAC
TACTTTTTTTCTCGAGTAGGTATGGAATAGCAACACAATGCTAAGAGACTGGCTAAAAGC
ACATGCTGACTCCTCCTCCCTTGATACCCTGAAGTGGGCATATTACTCTATTAATAAAAG
TCCATGGTAATATGTTATTCTCAAATCGAGCTTTTTTTCATTGATTGGAATTTACTAGCA
TGTTCACTGAAAATTTCACTTTGAGAAGTTGCTATCATCAACTATATGTTTTTGTCTTAT
ACTTTTCTCATTCCTTCCTTGTGGCTGTATACACAATTAAACAATTTCTTGTTATAAGTT
AGGCTCTGAGATAGGTGGATAACTGGAATGGAAGATATGCATTGTGGCCTTGTGGGAATT
AAAGCAGGGGACTTGGGTTTATTTGCCATCAATCATCACTGAGGTGTTGCCAGTGCCACC
ACCTTTTTGAGATGTTACCACAGTGTGCCAGTATTACTGTATTTCACCCATGAGATAATT
ATCCACAAGTTTTTTGCAATGTCAACATGCACCACCACAACTTAAAGTCTTGCAGTGTAG
ATAGCCAATTTCTGCGAACAAAATGATCATAGTTAATGCAGCATACGCCCACATGCTTTT
TGCTCGAGTCGTGATTTTATCAGCTGTGGATATAAATGAGAAAGTACAACCTAAAGCTAA
AATGCACAGAGAGAGCATATATAGTTACTCATGTTGATTTGTTTCGTCTCCTTTTGTTGA
CACCAGGTTCTGCTATTAAACAGTCAGTCTAATTTCATGGATTTGTTATCCTTTGCATAT
TTTTTAACCTATCCTTTTCTAACTAGATTTCTTTATAACTATTTTGTATTTCTTAGCGTG
CTGATATTTGTTACCGCTTTGGTATTTCCCAAATAGGTCCTGCCTTGATGAAAATAAGGC
TTTTCTATCCACTGCCGATTCGGCTGTGAAATTGCTCACAGATGCCACCAAGCCAATTTC
AGGATGGAAGGGGCTTGAGTATCGTGCAGCATTTCCTCTAGATAAGCCTCGTGGCGCGAA
CTTCTATCCTGCTGACATGGACAAAATGGTACCGTCATATTTAGTCACTTCTCAGTGCTT
AAAATATCCAGTAGAGAATCTTTCCAGTGTATACTAAAACTTCAGTGTAATTTCGGCTTA
TGATAGTTGGACCTCCATTGTGTTCTTTCTAACTAATATTGAACCGGTTTCCACATTCAT
TATGTGGCTGTAGGAGTTTGATTTATGGAAAAGTGGACTGACTGATAAGGAACAAAAAGA
TGCAACTGGATTCTTTACTGTCATAAAACGGCCTGACGCTTTATTGACTACATCAGTAGC
ACAGTCAGATGGACCAAATCAAACCAATACTTCAGATGATCTTTTTATTGTTCCATATTC
CAAGGAGTATAAAACATCCCTTGAGAAAGCTGCCGAGCTTCTTCTTAAAGCATCAGATTG
TTCTGATTGTCCAAGGTAAGCTAGTGACCTAACATCTTTCAATTCGTGAAAGGTTTAGTT
CGTTTATGTAAAGCAGTGTTAGCTTTGTCTTGTTGTAGCCTGAAGAATTTGCTCAAAACC
AAGGCAAATGCTTTCCTTTCAAATGATTACTATGAATCTGACATAGCTTGGATGGAGTTG
GTTAGTATCCTCATTCTCAGTTTTATTAGTTCATTTGTTTCTCTTTAAATGCATTATTTG
AGTGAATATAGCTGTTAACTTTGTTAGAGAAAAATGGGATATACTTGTTGTTCTTAGCAG
TAAAAATTCTTTTCTATTTTACTTTATATAATACTGATGCTACCTCTATTTGGCATGCTT
GTCATGTTTCCAGGACTCCAACATAGATATCACCATTGGCCCATATGAAACATATGAAGA
TGGTCTTTTTAGTTATAAGGTATTTTAGGATCCTTGTCCCACCTGTTCTTGCATCTCTTT
GTCTATTGGTGAGTCTAGCAATGAAGGCGCACTAAACAACAGACACAAGTTTCAAGTTTA
AAAAAAACCCATAAGTTTGAAGTTCTGTCATGTGATGTGTCTTTTTTTGGATACACTTCA
AGTTTGTGCAACTGATGCTAGCAGATTAACATTGGCTACAAACACCACATGTTGCCAACT
TTCTCCATACTCAATTTTATTTTCTTACTTAGGCTACCATCTAGGCAAATTTGCTAAAGC
ATGTTCTTCATTAATGTACATAAAGTCAGTAATATTGCTGACTAATGGGCTAATTGTCAT
GTATTCAAATGTAATGTAATTTATGTGTATCTTCTCTGGGTTGTGATTATCTGTTCTTCT
ATTAATTGTGAACTCATGCTGAGACTGCCAATGTTATTTGGCTAACCACTTGGATTTTAG
TATCAAGTAGTATCAACTAGAGGCACCAGCCATCACCACAAGGCAATATTAGCATTTATA
TGGCAAAACTGATGGAAAGGGCTAAGCAATCCACATATACACTTCAATAGTGGTCACGCT
GTCCAGTTAGAGTAGATTGCATTTCTCTATTGTAGGGGATTTCTCTGTATATTTCCCTCC
ATGCAATGTTTGCCCCACTGTGGCCAATACAACGAGTCATTGCATAACAAAAAAATATGC
ACATATAGAGAAGGGGGAAATCTTGAATTAGGTCTGTTCATCTATGTACTATGCGGAGAC
CTAGAGTTCAATAAAGTATCTCATTTGTTTTACTAGTAATAATATTTCTACTATTTCAAA
GGCAACCTTTGAAGCATTTGTTGGGGTGCGGGACGAAGTTGCAACTTCTCAAGTTAAACT
CTTTGGTGATCAACTCGAGGTAATTCTGATTGATTTTTCAAGGAAATATTAAGCTTTGAT
TTACACCAACTTTGATCTGGGTTCAGGATTTGGAGAAAAATCTTCCACTGGACAATATTT
ACAAATCAGACAATGTATCTGCTGCTCCAATTCGCGTGATGAATCTTCTTTACAACTCTG
GGGTATGTTTCTATGTTGATATTTTCACATTCTCTTGCTTCTTGTAGACAAATAAAAGCC
CTAGTTCAGTCAGTGTTTGGTAAAACAAATCTCATGACCGTCCATACCTTTTCCTTGCAA
TTCAGTTGGTGTGAACTCATTATTACCAAAGCATCCGTACATTTGTATACAAGTAAAATT
AAGCTTGTCTTCTCATTCTGCTTCGTGATAGATGAAAAGCTGACAAGAACCTTATGTCCT
TAAATCCTTGAGAGAAGTAAATAATTCTTTTTTGTTCTGTAATACTGTAAGATTTAATGA
GTGAGGAAGCACTAGGATTTCGATTCGTGTAGACTCCATGCTTTCCTGCCTACTGTCTGA
GTGTCATGGTTGTCATCCAAGTGTTTTAACGTGTTAGTGTCAACAACCATTGCACAAGAC
TGTTATAGGGAGATCTTTAGTATTTCCGTCCTTTTTGTGGTAGATTAATAGTTATTTTGT
GTCAAAATTTATTGGAGATCTGGTATTTCTGTCTCTTGTGGTAGAAGTATATTTATTTTC
ATCCAGGCTACAGGCTACTTTAGGCAATTGGTAGGCTGAAAAAGCTCAAGAACTTATCTA
TGTTATTGCAAATGAATTGTTTATCCACATTTTTCATATCCTTGGCCAACAGCGTCATGT
GAACTAAACAAGTGCTTCTGTGGCAGGATGTGAAAGGTCCTCAAACTATAGCTTTCAATT
TGCCAAATGATGAGCGGATTGTGAATGAGCGAGGAACTTCAATGGTTATGCTTAAGAACG
TCTCAGAAGCCAAGTATGCCTTCACTGATTTTTATTTATTCATTTTGGCTGGCGTTATAT
AGTTTAAACTTGTGTCAAGCGAAGTAAGGGAGTTCATGCTGACATTGGCAATTCAAATTT
TATTTATCATTCAGGTTCAAGCATATCTTGAAGCCTATTGCCAATGCCTGCATCAGAGAG
GAGCAGAAAGAATATGTTGATTTTGAGCCTTATTATACACATATTGTTTGCCATGAGTGC
TGCCATGGAATTGGACCTCATTCCATAACCCTTCCTGGTGGTAAAAAGTCCACAGTTAGA
ATGGTACGTATGCAAGTATCAATGTAGATAAAGACTTGCTCAATTAGGTGGTATGACAGA
AAAAGAAGAGTGATACTCCCTCCGTCACGGTTTAGANGGCACGCTTGGAAAATCTCTGGG
ACCAAGGTGGTCATCGATTGGTTGTGAGATGTAGCAGGTGTAAATACTAATGCGCCTAAT
CAACTGAAAAAATACTAGTACTAATGTGTGAGCAG