Map Locations of contig_157419 (10213 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_157419

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_16682 4 1922 bp AK355627 Available Available None





CDS Structure of MLOC_16682






Contig Sequence (10213 bp)

>contig_157419 10213 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
AGGAAATAACTACTGACCATGCGGCGGGAATGCAGGGCGTTAGATTGGCATCCGACGACT
AGCTAGGTGACGGATAATTTTTAAAAATCATCTAGCGAACGTGTACCGTTCCCCATTTTT
TTGCAACAGTTACATAACCTAGTTTAAGTCATAAGTAACAGCCTTTTTTTTGAACTTTCA
TAATTAACAGCCTTATATTTATCTTTTGTAAGAGTAAATTTTCGTGAATGTATTTTTATT
TTATTTGAAAAACTTCGAAATGCAGCTTTCTTAAACAGCTCATTTGACCACGCGAAGCAG
CCGGCGCTGATTAGCTACAGGGAGGCCGGGCGGCATAAACCCTAGGAACCCCGCGGCTCT
TCCCTCCCTCCCTCTCTCTCTCTCCCTCCCGACAGAGCACGGCGCGACCCGCCGACCGTG
GGAATGGCCGCGGAGACCGACGCGACGGCGCCCGGCGGGCTCGCGGGGGAGATGGAGGTC
GAGGCGTACCGCCGCCTCTTCCCCCTCGCGTTCCTCGAGCGCCACCTCCGCGAGTCCGTC
CGGCCCGACGCCCGACGCCTCGCCGAAGCCCGCCCCACCACCGTCGCGCTCGGCGCCGTC
TCCTCCGCGCACGGGTCCGCCCTCGTCCGCCTCGGCGACACCGTAAGCTCCCCCTTTCGA
CCCCACGACCTTTTATCCGGCTCCCATTGCCGTATTGGCTGGCGTTGCGCCCCACCTGTT
TGACGAAATGCCTTCCGTTGCCCCAGGCCATGCTCGCGTCGATCAAGCTCGAGGTGATGT
CGCCCCCCGCCGAGACCCCGGACCAAGGATCAGTTGGTTCGTGTGGCCTTGCTCTTCCTT
TAGCTGCTGCTGCTGCTGCCGGTGCTCTAGTTCTCAACGGTTTGGCTAACTTCACTGTTG
TTTCCACAGCTGTGGAGTTCCACATGCCGCCTATCTGCTCCCCGCTTGTAAGACCAGGAC
GGCCAGCGGAGGCTGCGCCGGTTATCTCCAAGGCCCTGGAGGACGTCCTCATGAGGTTTT
TGTTGTGGCTTGCCATTTCTTGTCTATCTTCGCCTCGCTGACACAAGGGATGGATGTATT
ACTGTATTCTGCTTTCAGCAAATCGTTATGGTGTAGTTTTAGATAGTGGGATATGATTAC
TTCTGTTGGTTCGTTCTTCCACAGCAAATAAGTACTGTATGTCGCACCTACAAGAGCACT
GTTTGAAATCTATTCATTTGATTCTCTTTTCCTTTAGCCTGCTGATCACTTGAAGTCCGA
CATATGATTGTTGATGTAAATGGGTCGTTTCAAATATATTTTCCACAAATTGTTTCTGTG
AATTGAAATCTCAGGGGTGTGATTTTACATTTCTTTCGCCGCATAAAATTCCGGTGATTA
TTTGATTGTTTCAAATGCAAGTTATAGGATAGGCATTAGTGTGCTTGCTGCTCAGGGATG
CAGGTGATTTTTTTTCTGTCCCAGATTGGAGATGTAAGTTCGGTGATTTACATGATTACA
CAAATTTTCTACCTATCGTGCTCTAACACTTCTCTTTTCTCATATATGGCATACACTGAA
ATTACTTTATTGTATCCTCTTTTGTAGCTCTGGGATGCTAAATTTGAAGGAGCTCTGTTT
GATCAGTGGGAAGGCTTCGTGGGTAGCATACTTGGTAATACACCTTCGATTTTGACATTG
TGAGCTCGTCAGTGTTCATTGAACCAAAACATTTCCCTGACCAACCATCTTCAGAAGTCA
CTAGGACAAAATTCATGTGATATTGTTAAGTCGAATAAGATTTGGAAGGCCTCCACCCCT
GAATTTCACTGAGGATCGACACTAACATTAGCGCTCCTCAATGGAGTATGATCAGCTTAG
CGTAGCAACAAACAAGATAAATAAAACACAGCAGAAATTAAAGAAAATAAGAGCGTATGC
ATGATAACTCTGTTGTCTTTTTCTATTTCTTACTATGCTGATGTAGTTAGGATTTAATAT
AGTTCTGATGTTGGTGGTTAATTTGAGCTCCTACCTCTACTTAACAAGAGTTGCTTGTGT
AATGTGGTGTTCATGCCTCGTGTATGGTAGCACCAGATATGTTGTTTCTCTAGATTGCTG
CACTGGGCAAGCATGTGGCGTGCTTGTACATTGTACAAACCCAATGACGAGACATAAGTT
TGAGATACCCGTTCGTAATAAGTATGCCAAATAGATATGTGCTCCGTTTATTTCTTGACA
CCTCAATTTTACAGGATGTCTATTGTTTGAATGCTGATGGATCTCTTTTCGATGCTGCAT
TGATTTCAGTGGTGGCTGCATTTACACATTGTAAGTTCAATTTGTTCTCTCTCTTAGTTA
ATTTGATATCCTTCCACTATTCAGTTGACCTATAATTGGAAACTATACTATTGGTTTTCT
GCTGGTGGTTACTCAATAAAGTATGAACTGTTAGTGATTCAATCTTGTCTTTCTACTTTT
TTTTATATTTCAAGCGCCTCATGGAGTTAACTGAGAAAATTTGTATGCACCTTCACATTT
TAACCAGACCTGACCATAGTATTGTCAATTTTTGTACTTTGTATGGGTTGATTTTTGAGT
TATGAAGTTTATATAACCTTTTGAAATTCCGAACAACGAGAACCATATAAAATACGGTAG
CTTAAACCATATTGTGTGAGTCCCAAGTTTTGTTTCTAACTCGAGTAAGGTACAATGGCA
TGACTCATGATTGACTTGATTTTTTCAACCAAACTGACACTGTAACACGGAATACTTTGA
TGGTTTATGCATGGAACTTTTGGAATGAATCTGAATGATCTCTCAACTTGATTTTCTTTA
CCTTGATAGTTCAGGTTTGAATAGAGAATCTGTGTATATTACTGTAAGTGGTATGTACTG
CATTAAGCTTGTGCCAGGTTCTCAATATGAGAATACATTTCATTTGTTGAGAGCACTGGC
CTAAAGCTGTTCACACACTTATTCTGTGATAAACCTGGCAGAGGAAACGATGCTGTTACT
TGGTTACTTTCTTACAAGGGACTTTTTGTATCCTGCTTGATTCTGCTTGTTTTGTCCTGT
AGTTGAACATTTGTGTGACTTGGCACTAGCAGTATCTCCATGTCTCCTTTTCATGAGCGA
CTCTGAACACTCTAGTTTCCATTATTAATACTATGCTGCTTTCACAGTGGAAATTCCTCT
GGTATCTGTTGGTGACGATGGTAGGGTGTTTACTGTTGGAGGCAATGAAGGCAAAACCAA
ATATGAATTGGTAAACAGAGAAAAAAGGAAGCTTACTCTTGGTGACATTCCATTTCCTCT
CACATGTGCACTCCACAAGGATAGTATTCTAGCGGACCCAACTGCTGAAGAAGAATCGAT
AATAGAGACCTCTGTGACAGTTGTTCTAGATTCTTCCGGCCGCTTAGCGTCAATACAAAA
ACCTGGAGGTGGAGTGACGTCCATGGCAGCTATTAAGGTTAGATTTCCGATCCCTTTCCC
CATATATACATAACAATGGAAATATGGTTTATTTCCAGATGTCTTAGTAATTTAGTATGC
ATCCAAGACAACTATTTTAGCTAATTGATGTTCATTTTATTGTATCACGCTACCTTGATA
TATCCATGGTCGTGGATGGCATATTTTCACCATTGGTTTGTGGTGGATGTAGTGGAAGAG
CCAATGACCTTTTCTTTGTGCAGGCGTGCATTGGCTTGGCGAAAGAAAGAGGACAAAAGT
TGAAGGAAATACTCACGGACTCCATTGAAGCAATGGAAGTCGACCAAGCTGAATAAGTCG
GTGCAAATAGTGCTAATTCAGTGGTTGTACTGCCACTGGTAGTGACATAGAAATTTTGTT
GCTTTTAACTGTGGGATTATTTTTCTAGTGACGAATGCAAGATGTAACAATCCGTACCCT
GCATATGACTCGACGATATTAGCCGCATTATTTTTCCGAGTTTGTTTCCTGATTTTTCTG
GTAGCTATTTTACAGAGTTTAAACTTCATTTCTGGTATTTATTTGTGTGCACCCATTGTT
CAGAGGTGGTTACCTTTGGTTTTGTGTTTTTCATTTTGATTTATTGGTAGTCTAATTTTG
TTATCTTGAGGATTGTCAATCTCCTTCATTTTGGTTGTAGAGCTCCCGATGCTTCAGAAA
TACTCCCTCTGTTTCAAACGCTTGCATTTTGACATGGAGGGAGTATTTATTTTTCATGCG
TCTTTTTTTTTCATTGAATTTTCCCGTGTCATTTGTGAATAACTATATAAATACAATTAT
TCCCTCCATTACCCGTCATGGTTCTACTGCTGCGCAAATTTGACTATTCAGCTTTGAGAC
GTTAGAGAGAACTACACAGAAGCATGATACATGTTGAGCGCCAACTAAATGTAACAATAC
TTGATATTTGACCAATGTTTATTCTTGGAATGTTATACACCTTGCGATCAATAACTACCA
AGAACATGCAAATGCCAGTTAGATCTAATTGAAGACATAAGTGCAATGAGAAATCCTTAG
ATCACAAGTGAAGGCGATTCAATGAAATACGATCATCCACAAAACCTGTCTACTATCCAT
AAGGAAACCAGAAATTCTACTGGAAGAGTGGGGGGTCGCGAAATCCATCAAGCAGCCTTC
TTCTTTTTCTTTGACTTCAGCATGACAAGACCGATGAATATACTTAGGAATGAAAGTAGC
ACGACGCCGGCAAACACAGGGATGAAGATTGCGTATTCTTGAGGTAGAAAGTATTGGTGG
ACAAAATGATCATCGTCAACAAATGGCTGGGTGGGAAAACAGAAACAAAATCACCATCGA
TACATTAATGCAGAAACATATATAGAAATGAAGCATGTAATGCCCATAAGTTACTAACCA
AGATTATGACCCAGAAAGTGTAGTAGGTAAAAATGGATAAACTCGTCATGGTCAACACAA
GACCGACTGCTTTGTCACCCATTTCCATTTCTTCAGAAGTTATAGGAACCTAGTCTTGGT
TTGAGATTAAAAAAAAAACTGGGTTTCCTGTACAGGTAAATGCAAACACGGTGAGTATCC
AAATAACTTCACATGGTAAGGTTCATAAAATGAAGTGCCATGATAGTGACATCAAAATAA
ATAAATACTCCCTCTATAAAGAAATATAAGAGCATTTGGATCACTAAAGTAGTGATCTAA
ACGCTCTTACATTTCTTTACGGAGTAAAGTACTTATATTTCTTTACGGAGGGAATACACA
ATAATACCAAAAGTCCTGATGTACTTGGAGGTGCAACATGGTAACGTAATAAACCTGAGG
AACCACTCCACCGCTAAAGCAACAAACTACAGTAGAGGCAAAATCATCAACTGCATATCT
AGTGTAAGCATTAACTATACTTTTGGCCTAAATTTAGGCGAAATTTTTCTGCATTGCCAT
ATCTTGCTGAACTTTTGATGACTAATGGACGTAATACTAGGTGAATCTCATATTGCAAAT
TAAACAACTGGAGAACTCAGCCTGAATTCAATAAGCAACCAATCAGCAAGTATTGCATTT
CAATGTTGCAACAAGTAAAACTTGCTCACTAGAATTTCTAAGCACCAATAAAATAGAGTT
CAGAGTGTCGCATATCATTTGGGACAACCGAAATACAGAGCTATTATATTCAGGGTGGTG
AAGAAGCAACAAAGTCATGTCAAAAGTATGCAGAAAAAGTATCTCCACCAACCACTGCTA
GTCCTGCAAACTTCTCAGATGAGCCACTCGACGAATACAAAAACCTTGTGCAAGGAAACT
CTTTTGATGATTACATAGATTCAGTATATCAAAAAATAGCTGATAACAGAACACCTTTCA
TCACCTAGATTATGCTTTGTTATGGGCAGTGATGCTACTACAACAAGCAAGATTTTATTG
TCCCTTGTTCACGAATAGAAGAATTTTCTTATGACATGGAGACACATCACAAACGATGCA
TCTAGGAGATACTGCAAAAGGTAATTCATCCTTTGTTAAATTTTAATAATATGTGAGATT
TTACTGTTGATGGTAACACACAAGGTGTCTGCAGCTCTTTCGCTTCATTACAAGAGGTAG
ATCCACTAGTATGGCTTCTTGATTTTGATTAGCACAAATTATATGGAGTTACTACAGTTC
AAATACAGTCCTGACATCAGTTTGTCTTTTGATATAATCATTTTTCAAAGTAGTAACTAC
ACAAGCACCGCTGGGCAAGAACACAGTATACAGAGATCGCCAACAAATTCAAACGCAGGC
AGATGAAATCAACCCATGGCTCCAGAATGAAGCAGTGAACTTAACTCTCTCTTCCATAAA
CGTCAAGCGTTCAGGAGAAATTAGAGCTGTCTAATGGGTAAGAGGGAATAACCTCTTCCA
TCATTTCCTGTTTAGGCCTTCTGTTTCTACCTTCGCATCTTTCAAAATAAGATTAAAGCA
TAGACTGCCAGAGCAGACGACCAAATTGGCAACATAGGTGCTATACATTGTGCTCTACGG
CTGTATGTGTAGATAGATGGTTAGTTTTGCCTGGACGCTTGTATAATAACTGAACAAGAT
CGTCAGCATGAAATAGAGGATATAAACAAAACCACCATTCTCTTTACTTGTTTATCTGAT
TTGTTCTAACAACCCAAGCGTAACCTCAAGCACCTAGTGGTCCTGCTACAGATAACACAC
TGAAACAAGTGATCTCTCAGTGAATGTCGTCAGGGAAGACATGCAAATAATTTTCCTAAA
TTATGCATCACATATTATAGTAGTACAGTTAATCAGATATAAGAATGCTTCAGTCATGTA
TGCGCTACACACTTGGGTTCAGATGTATGTAGCCTCAAACTGCATCGTATCTACCATCCT
GGCTGAGTCTAGCCTGGCCAATCTGATGCAAAACTGAGTTCAGATGTATGTTTGGTTGTG
TGCATGGCGTGGGGTAGATCAATGTGAGATATTGTTTGGTAGGTTGTATGAGAAGTCAGC
CAAGTACTTCCCCAAAGCATGACAGTGACGAAATTCGACGACCAGATCAAGCCGCCACTA
ACGCGAGCGGTCTTGCCGAGCCGGCACAGCCGGGGCCTCCGCCCCTGACACGGACTAAGC
CGGCGAGCGGAGGAGCATGGATGTCCGGCGGCAGGTCGCAGCGAACGACGGAGCTCCGGG
CGGTGCAAAAGGAGTTCAAATGGCAGGATTGAGGTGGACAGGGAAGCTCACCGGCTGCGG
ACAAGGAAGTTTCGACCGGCGGCACAAAAGGGAGCTCCGACCACCGTGACGGCGAATGGT
TTGCCTGTTCGATCTGATCTGATGCGTGAGAGAGAGGTGAGGAAAGAGAGATACACGGTT
GGTTTCGGTGGCAGTATTGATGTAATTCTGGAAAATGACGAGGTCGATCCCATATACCGC
TTCGTTTTAAGTGGAGCCGCGGGCGCAGGTGCGAGGGTGCATCAGAGAAACGCTGGATTC
CTGCGTTCCTCTCAGCTTGGCTGAGAGAGTGAGAGGCCTCTTTCTGCATCTGTCGGGCCA
GGCCGAGGAGGCCACACAGGTAACCAAACGAGCTGGATTCTGCATCCGTGATGCGAGCCA
GGTGCGAGGCACCCTTCCAAACACGCCCTTGGTTCATGGTCCTCATACCAAAAGCTACTA
CTAGTGATCGGAAAAAAGACAGAGGGCCTAACATGGGGAATGGAGAATGGATTCATTCTC
CACCATGCAGTAAACAAATTCACGTCAAACTGAACGCTTTGGAACATGTTATTTTGGCAA
CATAAAGCAATCAAATTTGGTATGGACACAATAATCAAGCCTGTGGCTATGTCGTGTGCA
AGTATGCATTATATCCCAGTCATGCATCCAGAGCAACATCTTACATACATGATGGCATTT
TTTTTTCTTGCATTCAAATACCACGGAGGAAGGAGGCATTTCAATCTTTTTGTGTCTCTT
GAGTTGGAAGTCTGAACACCACAGTATACGCACAAAGTTCAAGACAAGGGAAACAATATG
TGGTAAATAAAGTACCACCTCCGTCCCAAAATAAGTGTCGTTGATTTAGTGCGAGTAGAA
CAGAAATTAATTGGCAACAAGCTGAAGTATATTCTTTCTTTGATAGAGGAGAGTTCGCTA
GCTAAGTTGCTAGTTTCTACATTTTGTAAAAGCAAAGACAATTGGAACTGATTTGTTTCA
ATCAGCGAAGTTGGATGAACAGACTTATGTCAGTTGTCACAGAAATTAACTAAAGAAATG
TTTTATGTTCACTCCTCATCATTGTGGCTAAACAGATCATGTACTCGAGACTTGCTCCCG
ATTGGCCCCTGCTAATCACACGAGAAAGAGAGAGAGATCAGGCCCCAGCAATCAGAGAGG
AGCCTCGTGCTTTGGCCCTAGCCACCGCCGCCGCCAGCGCACACAGCTGACTCGTGCTCA
GGCCCAAGCCACGCACATCAGAGCGCCGCCCGGCCGCGCGCATCGGGACGCCGCCCCGAG
CCTCACCTAGCCCGCGCGAATCGCCCATACGCCGACCCCGTAGCGCCGTTCCAGCGGAGG
TGAGAGAAGTGAGGAGAGGCGGGAAAAAGGACAGAGGGGACACGCACCTACGCCCTGCCG
CAGCCGTCGCCCTTCAACCGCCGTCGCCGGAGCCCGCGATCTAGCCGACGCCGCACGGGC
AGAGAAGAACGAGGGATGGAGAGACCAAAGAGGCAAACTTTGCCTGGAGTCCGATCACGA
ACGTCCGCAGGATATCCAACGGAGCCGGATCCTGCATTTTCATCGCTGTCTAGTATATCC
TTTATAATCCCTGATTTTATTTCTCATTCACTTGTAAACGATATGTCCATTATGTGAGGA
ATAAAATATGTTCTTTAAAAAAACATGTAATTCCTTCTTCTATCATCCCAGTGTAAAAGT
AATAACATCCAGTCAGCTTCATCGTCTTCATCTTCTGGATGCGCAACGAACGAATCTAGT
GCCGATGAAGGGCCTATGAAAGTTTGCGTCGTCAGATTTGTTGACTCTAAATTGGTTGGC
CGAGGGTGCCATGACTTCGACTTCCTCTTTTGTGTTGTTCGATGGCATGGCCATGTTTCT
TCAACTCTGTGAACCGTTGATGATAGATTACAAGTCTGTATTGTGTTAGATGATGCTCCA
GTAGTCGAGTCGATACTTCATTAGCGTTTTTTACAAAGTCTAGTGAAACTACACTTAAAT
TTTAAAAGATTTGGCATTGATTTGGGTCCCCTTTTAAATTCAAATCGGTGATAATTAATA
GAAAACATAAAAGGAAATGGGAAAGGTTTTACCTCGCGGCCCAACACTATAGCAGGCCCA
ACCCACCAGGGGCTAGGTCGTCTTCTTCCTCGTACCTGTCGGACAAGGAGGGAGCTTGCC
ATGCGCCACTGTCCCTAGAACTTGTTGAAAAATGTAGTATAAAATATAAAAAATTGTCTT
ATGAATAAACTCGAGATCACTATGATATGAAGATGCAAATATGTTTGATCTAATCTTTAC
CAATGAACGCGAGGAAGATTGTAGGTTGGTGAAGAAGTTGATGTTGATTTCCAAAGTTAG
GATTAAACCTCCCAACCACTAGAACTTTTCTTCCCCCGATATAGGAACAAAGAGATGATC
CATTTGCCGGTATCCATGCGTACGAGATTACTGGTCCACCAGTGCTTCGACATCTAGAAC
GAAAGCTTACTAGAGTACTAGATGTATGGTGAAGCACTCTTAGGGAGAAGGGGATTTTCT
TCCCAAGACATAGGGATGTGGATGACAACCCGTGGCTAAGGATATCAACGATCGAGCCGT
CCATAAAATGCACCTTACCAGAGATCGAGCGGTCTAGCTCGACGAATGCCTCGGTCGATC
GAGACATGTGGTTCGTTGCGCCCGTGTCAAGGAACAGACTTGCCACTCTTATCGTCGTCA
TGCGTGGGAGTGATCACCGACCTCTCCTTGTTAAGGAAGGTGATCAGGACATCGATACCA
TTGTTAACTTGTTATACCTACTGGACCAGTTACTAGAGCTCGCGCACGTCAATTGAATTA
CCAGGTACTTTCGTTTCTTGGAAATCCTTTTAATGTTCATGAACATATGATGTTGCCTAA
ATTAGATACTTTTGTATTGCCTATGAATGAAGGACCTAGCATGGACAAGGAGGATGGCCA
TTGGNNNNNNNNNNNNNNNGGAGGGGAAGGTGCACACGCGGGAAATAACAAGGGAGATTC
CAGTGGTGATTTT