Map Locations of contig_1573931 (5745 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_1573931

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_16607 2 1622 bp MLOC_16607.1 Available Available LOC_Os11g10990.1, FRAME:-2, EVALUE:3e-93, 13111.m01164 protein heat shock protein DnaJ, putative, expressed
MLOC_16606 5 1952 bp AK252584.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_16607






CDS Structure of MLOC_16606






Contig Sequence (5745 bp)

>contig_1573931 5745 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
AGATTTTGAATAATATATACAGGAAAATAGGAAACATGGCACATGTGTAATTGAATAGCC
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GTCGTGTCCGGGTGGTACTCCTTGGACAACCGCCGGTACGCCGCCTTGATCTCCTCCAAG
TCGGCGCCAGGCGCTACTCCTAGGAACCTGGTTTATACCGGTGAAACCTTGGTGCGGTCA
GTTTCAGGCAGATGGACGAGGGACGTATCAGGGTGAGTGAATTATGTTACACAGCGAGCG
AGCTCAACTGGTAGTGTGACTCGGACGGGTTGTTGATGAGGTCGGCGAAGCTTCGTCCCA
GCGGCTTCTCCTTGCGCCCGTCGCCTTCCTTCTTCGCCTTCCCTCCCACCCACCCTTCGT
CCGGGTCGGACCAGTGTATCCTCGTGTCCACCGTCTTCTTCTTCCCCGGCCCTGCCGCCG
TAGCCTCCGGGGACGGCTCCGCGTCCGCCGTGCTCGCCGCCACGACGAACCTTGCACGGC
GACGGCTGCGTGCGTCGTGCCGACGGAGGAAGGGCGTCAAGGGGCTAGACGACGCTGTGG
ATGCCGCCATGAGGCGGCAGCCGTGCAGTACTTCTGAGGGATGACTACAAGTTGAGGTTA
CGGGGGAGTTTTGAGGTGTGCATGCGAGTTGTGGTGGGGAGCGGATGAGGGCACCACATC
GCTTCTCTGTAACAGTTCGCAGTGGTTCAGATTCGACGACGGGCTTCGTGTGTCCTGCGC
CACATGTTGACACATTTTTTTTTTGGTGTGTGTGCGCGCGCGTGCAGGTAACGAGAACCA
GAGGGAAGAAGAAACCAGAGAAATGAACCTTGGCCTTGTGAAAATGTTAATTTGTTTCAG
TTTGATACGGGCCAGGTGAGGTGATCATTGTGAATTTGTGAGGCGCTCGTTATTCTCTCT
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CTTCCAAGCACCCATGACTAAAGAGAGGCTAAAACTAGTCTTGAG