Contig Data
morexGenes
Links



Map Locations of contig_1573193 (4708 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_1573193

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_16374 1 792 bp AK360118 Not available Available None
MLOC_16373 2 887 bp AK360118 Available Available None





CDS Structure of MLOC_16374






CDS Structure of MLOC_16373






Contig Sequence (4708 bp)

>contig_1573193 4708 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TTGAGGTGCAAGGAAAGTAAACATATAGACTAATAAAGACTCCTAGACTAATACTAATAG
ACTAATAAGGACTTCTAGACTAATACTAATACTTCCTAACAGATACATGGTTCCAACTAT
CTGAAGCGAATTGCTTTACCTGTAAACTGTACTTTTGCAACCGAGTTTTGCAAGAATACT
GCTACTAAGATGAGTGTTATTAAATTCACGGACGAAAATCATTCATGCATGATTCTTTGA
AGGTAGCTTGTTCTAATTCTGTACTTCTAATTTTTTTCTTTTGCTATTTCAGGTATTCAA
TGTTGCAGGTGTACCAATAGAATGGGAAGAACATTATGTTGGTACGGAAGTTGATCCCAG
AACAGAGAGCTTTTTGACATGGGAGAGCCTGGAGTCGGTGCGTAGGAACAAAGTTGGCTT
GAAAGGTCCTATGGCTACACCTATTGGAAAAGGCCACCGTTCTTTGAATCTTACATTAAG
GAAAGAACTTGGACTCTACGCCAATGTCAGACCTTGCAACAGCCTCCCAGGCTACAAGAC
TAGATATGATGATGTGAACCTTGTGACAATCCGTGAAAATACTGAAGGAGAGTATAGTGG
CCTTGAGCATCAGGTATGGTGCTCAGAAAGATAATTTTGTTTCCATTGTTCTTGTTAGTC
ATGAGCTGAGCTGGTTTCGAGATCTTATGGCTTTCAGCTCTAGCCTACCCCAACTCGTTT
GGGAAATTAAAGGCTTAGTTGTTGTTGTTGTTAGTCATGGCACAGTTCTTTTTCTTCAGG
TTGTGAGGGGTGTTGTGGAAAGTTTAAAAATTATTACCCGCCAAGCAAGTTTAAGAGTGG
CAGAGTATGCTTTCCATTATGCCAAAACCAATGGCAGGGAGAGGGTCTCTGCTATACATA
AAGCTAATATCATGAGGAAAACAGACGGACTTTTCCTCAAGGTTTGATGGCTACACCCCT
GTTCCTTCTTGTTGATGCTATGTGTTCCCCATTTTCATTTGTCTTGAGAGCTAACTCATG
GTTATATGTGGACAATTTTAGTGTTGCCGTGAAGTAGCTGAAAAATACCCTGAAATCACA
TACGAGGAAGTCATTATTGACAATTGCTGCATGACGGTATGTTGATCTGTCAACACTGAA
ACTTTGCACTTGTTTATTTTACCGTTTGCACACTTGATAATCATGTACTGAAAGTAGGCC
ATTTACTTCTATAATATCACCGAGTATGAACTGCATCCTCTTGCAGCTCGTAAAGAATCC
TGGTACATTTGATGTATTAGTGATGCCAAATCTGTATGGTGACATTATTAGTGATCTATG
TGCTGGTTTGATCGGAGGCTTGGGCTTAACTCCCAGGTAGAGGTTTTTATCTTCACGTGT
CGGTTTACTGCGTCTTTTAGACGATATCAACTCACAATTGTTTATTCCCCAGCTGCAACA
TTGGTGAAGGTGGCATTTGTCTGGCAGAGGCTGTTCATGGTTCTGCACCTGATATCTCTG
GCAAGGTAAAGTGATCCTTCAATATCTACTCCCTCTGTTTCTAAATATAAGCCCTTTTAG
ATATTTCAATGCGAACTACATACATATGTATCTAGACATATTTTAGAGTGTAGATTTACT
CATTTTGATCCATATTGGAATCTCAAAAAAGACTTATATTTAGGAACAGAGGGAGTACTA
TATAGAGGTTTCTCAGTATGTACATGTTCATGATGTTTTAATTTGTGGGTTCCTTGCTTT
GTTCATTATGTGTATACGAAACCCAAGTCGAGCGCGTGATCTCTAGATAGTCTTTATGAT
GTGCCTTAGTCCTTGATTTGACTGAAAGATATTCGATTGCCTGCAGAACCTTGCAAACCC
AACTGCTCTTATGTTGAGTGCTGTTATGATGTTGCGTCACTTGCAATTCAACGACCAAGC
AGACCGGATCCACAATGCCATCCTCCAGACAATCGCCGAGGGGAAGTACAGAACCGCTGA
TCTTGGTGGGAAGTCATCAACATCAGACTACACAAAAGTAGTTTGCGATCATATCTGAGC
ACCAGCAATCCCCACCCCCCACGCCCGCGATAATTTTGTTGCATGGCAGGAGCTTTAGCC
GGAGTAGGTTAAGTGACGGACACCTCAATTTCCTTGGGTGTTGACCCCGTTTAAGACTCC
TGAATAATCCTCACATTCTTGTCCTTGGAAAAGTTTTACCAGCATTGCAGTCAAGCTGAA
GAATCATCTGTAATAATCATTGCCAGCATGAGCTCATATAATTTGTTCGATCTAGTTCTT
AGAGTACTTGATTTGATCTTCTTTCTTTTGCTTTTTGTCATGGTACTAGAAGGATTAAGC
ATGCATTGCTGCGCTGTTAGTGTTTTTATGTTTTTATAAAATAAATTAGTCTTTTTTGTT
TTTAAAATAAGGTTTATTAGATTTTTAAAAAGTCAAAGCTCTTAAGGTTTGACCAAATTT
TAGAGAACTATATTAGTATCTATAATACCATGTTGCGATCATTAAATTCATCATAGAATG
AATTTTTATATTTTGTTTATTTAGTACTCCCTCTGTTTCTATTTTTTTTTAGAGATTTCA
TTACGGACTAAATATGGATGTACATAGATATAATTTAAAGTGTAGATTTATTTATTTTGC
TTTGTATGTAGTCCGTAGTTAAATCTTTAAGAACGAGGAAATATTATAGATGCTGATATT
TTTTACTCCAAAGTTAGGCGAAGTTAAATAAATTTGACTTTTCAAGAAAGAAAAACATCG
TATATCTTCGAGCAAGGGGGAATTTCATTTAGGTAGTGTGAGAGACGGAGTATATTTTTT
ATTTTGTTTATAGTGGAGTGTTTTGACAGGTTTTCTTATGATATGATTTTGTGTTATGCG
CTAATTAATTGATATTTACATCGATTTTTTTTGCATCATTGTTTGTGTGTATTATTTTGA
TGTTACGACAATGTATTTCTAGGTGATGAGGGGTTCACCGAATTGATATATTTTTATAAG
TTGGTTGCTTTTATTGATTTTAAAAATCATTCACCAAGTCAAAATCATGAACCAAATTCT
AAATCAAATACCACAATCGAATAACCCACGTGTTAATTAAAAAGAATTTCCATTATCCCT
AACCCTCATGCATGAGGGACACATCGTTCGCTCGTGTCCCTCCGGACCATCACGTTTGTT
GGATGTATCTCCTCGGGCCTATATATATTTATACTCAATCATCAATAAAGAAAACGGTTC
ATTTTACAACAGTTTGAATTCTTGTCTCTTGTTTTATTCTAACACGTTATCAGCAAGCTC
TATCGACAGCAAAAGATCATAGAGAAATCGAAGGAAGGACGACTCCATGCTCTCCAGGCG
TCGACAACAACGACCAACATGTGATGCAAGGTCGTGGCTGCAACACCCTCCAGCGTCAAA
GACTCAGCGGCCCTCCTTTACTTATTTGCCTGCTCTGAGTGCTTATGAGCGATTAACTGA
ACAGGGACAGATGAAATCGAAAGAACTCAGCAGAGAAGAACGAGGAACAACACCATTAAT
CATGAAATCGAAAGAACTCAACACAGAAGAACGAGGAAGAACTCTCTGCCCGCCGCCGCC
CGCTCTCCCCTTGCCAGGCTCTGCCCCGCCCCAGGTCCGGCCCCGCCCAGAAACTGCCGC
TACATGCGTTTCCTCGCCCGGACCAGCCCGGACTCCGCCACCGCTGGCTGCTTCTCGACC
GACCCTGCATGGATCCACCGTTGTCGGCTTCTCCTTGCTTGGCCTCCTCGCGCTGCTGCT
GGTGCCGCCTCCGGCCAACGCTCTCCTTCGTCCCCGCCGCCACGGCTGCCGCTTCCTGCA
GCCACCGTCGGGCTGCAACTGCTGCATGCAGCTGTCTGGACTGCCCCACGGCTTCCTGCC
CCGTGGGTCGCCTACTGCCGCCTCCTACCTGCCCTGCGGCTTCCTGCCATGTGGGTCGCC
CGCTGCAGCCGTGCTCGGCTCTGATCCAGATCGGGATCAGGTTGACTTCCAAAAAAAATC
AGAGAGAGGGAGCTCATCATGTCCTCTTCGAGCTATGTCGCTGTTCCTCAGTGCTCGGTG
ATCTTCAATGGCACCAACTATGCTGAGTTTGTCGGCTTTATGCGTATCCACATGCGCGGT
CTTCTGCTATGGGGTGTCCTCTCTGGCGAGCTTCCCTGTCTGCCATGCCCTGTTGCTCCC
ATGGCTCCTACCCCACTAGTGCCGTTTGTTTTGGCTGCTGGTGCTTCCCAGGCTGATCGA
GATACATCCAAGGTTCTCGATGATGCTGTGGTCGAGGCTTATGATCATCAGGTATCTACT
CATTCAGATGCCCTTTCTGTCTACCGGGATGATTTGTCTGCTTACACTTAGTGGTGCAAC
GATGATGCTCGGGATGCTCCTGTTCTCACTTCGAGTATCCTTCCACAGTTTGACTCCGAA
TTCATGGGTCTCGGCACCGTTGCAGCAATGAGGTCTTATCTCTATCAGCGCTATCAGCCC
TGTAACAACCCGAGACCGATGCTCGAGAAGATTCCCCTTTTTTGTCCGTTTTCGTCGTGT
GACTTATTCGTTTGTCGCACTCATCATTGTATCATGCGCATCATCTGCGTTGCATCGGCA
CTCCGTTGCCGTCAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAGTTGCCGGTTCTCTCCGTTT
CCGTCATTGACCGTTTCGAGACCGACCA