| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
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 |
No map location | No map location |
Predicted Genes from contig_1573112
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
|---|
| MLOC_16341 |
1 |
904 bp |
AK248358.1 |
Not available |
Available |
None |
CDS Structure of MLOC_16341
Contig Sequence (10095 bp)
>contig_1573112 10095 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CGCCTATGATGAATAGGTATTCCGAGGTAGCTAAACGGAAGTGATCCTAGTTCACAACCA
AATAGCTGTCTATACGCGTGTTGCTCTTCTTTTGCCTTTCCAAAGCATAAGATTTCGCTT
TTGTTAAAGTTAATTTTGAGCCCTGATAATTGTTCAAATGTCGTCAGGATTACATAACAT
AGTTTGTGCTGACTTCAGTCTTAGAAACATCATTGATTTTACCTGTGAGGTCTGTAGAAA
TGAGTTCGCATGGTAATAACACTATTGTCCCATGTCATTAGAAGCCTTAGTTGGACTTCT
TTTCAGTTTTCACAGATATGTTCCCATGAATGCTAATTTCAGTATTACTCTTTTGCAAAT
GTTCTTTGAGAGGGCTTTACTTGCATACCATGTGTTCCTGGTTTCTGCAGGTCATGGTGA
ATCGACTGAAAAATCAGGAAGAGACGGACTATCTGATTGCCGACTGATGGATCTTAAAAG
CGGGACTGAACTTGTCCTCACTTATGAGGATAAGGATGGTGATTGGATGTTGGTTGGAGA
TGTTCCATGGCGGTGAGTTTTGAGTAATATGGATATACATAAATTATGTACTAGCAATAC
ATAATCCGCAGCAATATTGATGATTTTCGTCTGTATTTGCAATCATCTGATTAGCGATTT
TTTTTGCACTTCCTATATTCTTCATATGCATACACCCTTGTCCATTGTGTCTTAAGTATT
TTTATGAAGTGACAAAGTTTAATACGGTAATACATTTGATTTACTACTTTAAAGTCTCAT
CTGGGGCTATTGATTTAGATGGTTACTGAAAATTCATATCTCCCTCCTAGTGAAGATTTG
CTAATTTCTTTTGCTCAACATATGAAATAATTTTGTAGAAAAAATGGGAATGGTGCACTT
TTTTCAAGATTGGGGAGGGGGGATCATTTTTCACATTCGCACGCGAAAGAGAATGGCAGC
CCCATACAAGGACTCAACCCTAAGCGGTCATTAAAGGGTCGAACAGGAAACAATTTTAGA
CATTCCAGTGGGTTCTTGATTTGTACAAGTTTTGTGAGACTGAAAAAATGTTAAGAGAAT
CAGTTCTTGATTCCATCCAGCCATGTTGTTTTAGCTTATTTTCCATATTAGTCTCCCACG
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ACAGGATGTTCACAGACAGCTGCAGGAGGATGAGGATCATGAAGGGGTCAGATGCAGTGG
GCCTTGGTAAGCACTGAAAAATATGTGGTAGAATACAAAATCGTTGCCTGTGTTCATGAG
TTTTCCCATGGAATGGAAGGCTGGCAGAGAATCTACTGTTTGCAGTGCTTGATTCTATAT
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CCTAAATATCTATGTTTCGTAATGGATCTGGGCATATGGCACGCACGGGGTGCTTGTATA
TGAGGAAACATTGTCTTCTATATTTACCACTGTTAGCATGACTAATTGTTTTTGCTTAAT
TCACCAAACTTGTAACATGAGAAATTATTTGTGTTTTTCAGCTCCGAGGGCCACCGAGAA
GAGCAAGAACGAGAAGTAGCAAAAACGACGAACCCGATCTGTTTCCTGCGGTCGCATCGT
ACAAGGGTGATGGACCTTATGTGTGAGAAAGGGATTTATATATAACCTACGTGTATTCTC
TTTATTATTTCCTTCTATCTATCTGTGTTCGTTCGGAACAAGCATGTTAGATCGTGTAAG
TTGATGTGTGTGTGTATCTACTACACTACTTTACTTTGATTCGGTCGCGTGTGTTGTATG
TAGTTTCCGCTGTAAATCGGTGTGCTATGCTTGTACCTCAAACTCGTGCTTTCTGGAGTT
CGGGCTGTCTGCTTGCATCCATCTGTGTGTTTGGCGAGCCATGAGAACAACGTTGCTTTC
ACCTGTGATCATTTCCGGAGCACTCTTTGGTTGCTGGAATGGTCATTTTGTGCACGCAGA
ACCGTCGAAAAGCCGATGATTCTCGGTTGTCTGGTGGTTGGAAGATCACATCAGGCCGTC
ATAATCTTCTCCTGTTTCTGTTTCTGTTTCTGTTCCACAAGGGAACTGCACTTGCTTGCC
TCGGTTAGTAACTGCCGCTGTACATCGGAATGAAAACCCAGCCGGAGCAAGCAGCAGCAG
TGGTAGCTGGTCCAGATTCCTTTTGGCGTGTGGTCTTCTCTTCCTCTGTAACTGTATGTA
TCTTCATGCGCTGCAAGGTGAATTCAATCAGTGCTTTGGTTAGTAGTGCGGGCCTCCCCT
TCCATGGCCGGCCATGGCCATGGGCGTTGGTGTTGTTGTTGTTGTTATCCTTTTCCTGGC
GCCATCATGTTGTCCACGTAAAGGCGGGAGAGGCTTCCTCGCAATCATTCGTTTTCACCC
ATCATCATGAGGGAAAGAAGACGGAGCGGAAGCTAAAGCGTCGAGATTGCCGCGAATTTA
GGCTTTTTTCCCCAATTTTAATTTTCAGTTGATTATGCTTTGTTATGGTGCCTGGCTCAT
GCTCATCTTAATTAGCAGCTGTGGGGTTTGGTTTATTACTTATTAGCAGCGGGCGTGTGA
CCAATTATGTTGTGGCGCACTGGAATATTGCTCCTTTCCGTTCCATGGGGTGTTGCTTGA
TGATGGATACATGGACGCGTCGTACTGTAGTTGCGTGCCCTTTCACTCCGGGAAACAGGA
GATGCGATGCTTATGCTTGATGTCTGCTTCTTCTCTGTCATGCTTGTTGCATTGCATGCA
CGTTGATGCTGCCATTGGCCTAATTGATCGTGCGGGAACCTTGCGTCGGCATAATTGACC
TTGCCTGGGCTAGGCTGGGCTAGGCCAGGGTAGGGGTAATCTAGGCTGGGAATGATATCT
CCCTCCTCTAGCTAGCTAAGCTAAGCTAAGCCAGCGTTGTGGTGTGGTGTGGTGTGGGTT
ACTGGAGTGGATAGAAGCCGTGGTTTGTTCTGATTCCTCAGCAACTGCGCGGGTGGTTGC
CCAGCTCGGCCCATCGCACTCGCCTTCGCCTTTTGGCTGGCTTGGCTGGTCCTCCATCGG
CCTGCGCTTTGTCTGCTGCCCGCTTTTTATGTTCGTTGCTGCCACTAGAGCGTAGACAGT
AGAGAGTACTAGCTAGCCCATTTCCTCCAGCAGCCTCGCTGAACAATTTGTGCAACGTGT
AACGTGAGCTGCTCGTCCCTGCTCACGCTGATCCGATCTCGTGTGGTCGTGTCAGGAAGC
ACAAGGTGCATGCTCAGATCGCTCCATCGCAATCTCCTGAACAGAAACGAAACCCCCCAA
AAAAATGCACTTCAGACCCGGTTTTCTTCTCCGTCAGCCGCGCCGTACGCGTTCATGACA
TGCCATGTGACTGTGCGAGCATGCAAGCCGCGGTTTTCGTGGGCGGGTTTGAGGTGCTTG
TTGTGGCCAGCTTTGTTCGTAACAGGTGCAATGATCCTCTGCTTTAGCCGCGGCCGATGC
AGTGATGGCGGGGGAGAACATCTGCATCATCATCGGCCGATGCCGCCGTGTGTGTCTCTC
CGCGAACATCTGCGGCGTGTGTGCAATCTGCCTGCCTCCCCCGGCCTCTCTCCGCGCTGC
TTTTGTTGGTGTCCAAGCAACCAAAGCCCATCGGTGGACGACCACAGCTTGCGTGCGTGC
GTGCGTGCAATCAACACACATGCCTTGTACGTTGGTCGTGCGCGCAGCCACAGCATGATG
ACCAGGGGTGGATTAGCGCGTCGTCAACTACTTCTCCTTTCCGAGACATCACTACTTTGA
CAAAATTGTGTTCATGACTGACTCGGCGTCTCCTTACGCCCGTGGCTCCACGGCGACTCC
CTCGACGTCGGCTACCCCGATTCAACATCAACCACGGCGTTCTTCACGTGGCTACCTCGA
TCACGGATACATCATCCTATGCTCTCGGCTACCTCGACGTCGGCACAAAGGGCTAGCGCC
TTGCTTGAGTAACCTCGTTGGTTTTCACTCCATCCACAACTTCCGTGATGCATCGACCGT
TACGACCGTGGAGGATATCTGTCGGCTTACCTTCAGATTCTTTTCCAGTCTCACCGTCTG
CGTCGCTACCGTTGTGACTGGGGGAGGGGGGGGATGTTGAGTATGGAAATATGAGATAGA
TTAGGATTTGTCCTACCTTACCTTGTACTCCTATTTGATCATTGTACTCTTATATATATG
TTCATGAGACGCAATACAACAACTATTTCATCAATCCCTCTATTCCCCTTCAACAGTGTG
CACAGCCACAACATGATGCACGCTAGGGGTGGATTAACGAGTTGCTCGGCTCGTTAAACT
CGTACTCATTAGGCTTGACTCGTTAAGCTCGTTAAGATTAACAAACATAAATCCCTACGT
AGGTTCGTTTGAAGCTCGTTAAGTTCGTAAACACTCGCGAACGCTCGTTAACAGATACTG
ATATGTTACGGTCTACACGATAAGTGTGGAGATGTGGTTTTTAAGAAGGAAGATGGTGAC
TATAAAAGATAATGCATCCATTTGTTGCCTTCTATGTACATTAGATTGAATACATTGATT
GAGGTGTTATGAAAACTTTATCACGTAAGATAAAATTATGTGTAGTTCAATTACTATCAA
GCTTAACGAGCTAATCATGAAATTCGTTAGCTCATTCGTTAAACTCGGTAAGCTTAACGA
GTTGAAATCAACAATTAACTCTGTTTATTAAGAAGCAAGCCATGAACATAACGAATCAAA
CTATTAATCATTCATTAAGCTCGTGAGTTACGAGTTTTTGTCCGAACCTAATAATGACCG
GAAAAATAAAGTAGCATAGGGCGTTCTAAATTCGGCTCATCTGAGGGGGTGTTTCTTTAT
AAGGACTTTTTGCTGTAGGGATTAAAAAAAGTCCCTTTTAGTCCCATGTGAAAGAAATAG
GAGGGACTTTTAGGGACTAAAAGGAGGTATTTGGGACTAAAGAAAGAAGTATCTATGAGA
GAGATTTTTTGGAACTTTTTTAACACTTTTTACAACAGTGCCCCTACTTTTATTATGTCA
TTTAATAACTTTTAATAGTACATTACTAGGATAACATGGTCTTTTTGCATGTCATTTAAT
GATTTCTAGTCCCTCCTTAATCCCTGAAAAGAAACGAATAGGGACTAAAGACTTTTTAGT
TGAGACAAAAAAATCCTAAAACTTCTTAAAGAAACAGGGCGTGAGCTACTCATGACATCG
CGTACCGAAGTACACTCCGTCTCATAGTATAAGTGTTTTTTACCTTTTTTCACTGCAGAT
CAATGGAAGAAGCGAATCTTTCCAATTCAGCTGCTACACGTTAATAAATGTACGTGTGTA
TGTGCAGCAGAGCAGAGCAGATACAGTGTACCGGCAGCGTTCACGCATTGGGTGTGCCGG
GAGCATGCGCATGTGTCATGTGTGCACGTACAAGCAAGGAAGGCAACAACATTTTTGTCC
TTCTTGTCGGGTTTGCAGTTGCAGCTCATGTACAGGCGAACATGAGCTGCTTGCCAATGC
TACCGCGGATCTTTTCTGTTTTGGAGCAATAGTCGCTTTCTATCTCCTGCATGAGCAGAT
TGCAATTTTCCTTACTTCTTCGTACCTAAATAACTATAGTTTAAAAGAACTAGTCTAGTT
CTTTTCAACTACACTTATTTAAGTCACCAACTTATCTAGGCCTTGTTTGGTTTTAATAAG
TCAGGTGACTTATAAGTCAGGTGNNNTAAAACCAGTGACTTATAAGTCACGCATGTTTGG
TTGTCATCTGACTTATAAATCACCTTTCCATGTAAAAGTAGATGCTTATAAGTTTTAAGT
TGGGGTGAAGCAACTTATGCCTTATAAGTTGGGGTGACTTATTTGAAACCAAACAGAGTC
TTATTAGGTATATAAAGCAAGTATGTTTTTAAGAGGTGTATTTTTTTTTCCGTTTCTTTA
CATATACATGTTGAAAATATGATCAAATTACCACGTGTTTTAATTCAAACAAACAGTAAA
TAAATCATGACAACAATAACATAGACTAAACTAACCATGCAAACCAATGTAGTAGATGAA
TAGTTCGAATCTAAGGCACATGCTAGGAACATAAATTCTAGCACTATCTCAAACAAAGAA
TACATGATTGCGTACGACGGAGCAGGAGCAGAACCGCCAGCGTTGGTGATCTTGTCCATG
TCACTGATGAAGAGGTTCCCGAGATCGAAAAATAAGTCGTCGCCCGAGAAATAGTTGCTG
CTAGCAGTCCCGCGAGTGCGCTTCCTAAAAACCTGATCGTCCCTCTCCCGCACATGATCA
CGAGAGACGGGGTTCCGAAGGCCTGTTGTCCCTTGTCATGGTGCACGCGAGAAGGAGGGG
TGGACAAGACTTCTGTGGCGTCACAATGTTCTTGAATAGTGTGAAATAATATGATGTGGT
GGCGGTTAGGATAGAGGTGTGCCTATTCATATAATGCGAATCGGGCAGGTCGTGGGAGTA
AACCCACGTCTAAGTCGATAAGAGCCCCACGATCCAAAATAATCAGAAACTGCAAAGTAA
TCACCACGTTTGTTAATTATTAATTAATGACTCGTTATCTTTTTCCAAGCAACGAAAATA
TAAACAACATGCATAGATTTTTCCTCGGCTCGGCTCATTCCCGAAACCCGCCAACGCGCG
TCGTGACGAGACGTGGCGAGGCGAGCGAGGAGGCGGAGTGCGCGTGTAGGTCTTTTTTTT
TCATATTCATACAAGTGCTAGAAGAGCTCACCTTATAAGATGGTGCAACTCTCTCCTAAC
TATTGGTATGCGTTTAAACATTTATCCCACTTACACCACACACATCCATGCATGAATGGG
CCATGAGAATTTCAAAAGTTTATTGGGCTTTTGACCAAAAGCTTACTAGCAAATTACAAT
AATCCCCCACAAAGTCTCGTTGGCACATCTCATCATTTAGTTTCAAAATATTGTTTATAT
ACCGGTGCTTAATGGAGAATGTTAAGTTGAAATTTTATTTAGAATTTTATTCTACACTAG
ATCATAATTTAAATAGTGGACTATGCCTTGAACTACAAGCTTTCTCTCGGACTAGTTTCA
CACAAATCATTGATCGATACTGGGCTGCCGCAAGGCTTCCCCGCGGGTGGAGCATATACG
TCATACTCCAAGTCCTCTCATGTATTTATTAGAGAACACACAATTCTCACAAACTGTGAC
GTTTAACAAACTCGTATAGGCGTGTTCCTCAGGAGATGCTCTCCATAACAACATCTCTCC
TTACACAAATAAGCCACTTGGAACACACATTAAGATAAGTATCAACTTGCCATGCATATT
ATGAGAGTATTGCATCTTCACAGAGTGGGATAACAAATATAGGGATACTCTCCTTCCAAC
TGCCCAAAAGCTTGTCTCCCACTTCTACTTCTCGGCAACTCCGATCACATAGAGTGGGTT
ACCACTATGGAAAACTCATATGGTGGGTCTCAAACCCTTTGTGAAGGGATCTGTCAAGTT
TTTGGACATTTGGATATAATCCAACGCAATAACTCTAGAGTTCTTCAATTTTCTGATAGA
TTTCAATCTCCTCTTCACATGCCTCGAGAACTTCATATTATCCTTAGAACTATTTATCTT
TATGGTCATAGTTTGATTATCAAAGTTCATCAAGATAGTGGGTATTGGGTTTTCAACCGC
AAGTAGGTCCATCAAGAGCTGACGAAGCCACCCTGCTTCAACAGTGACCGTGTCTAATGT
TGTGAGTTCTGCTTCCATAGTTGACCTCATTAAGATGGTCTGCTTGCAATACTTCCAGGA
AACAACACCACCATCAAGTGTAAAAACATAACCACTTGTGCCCTTAATATCATCAGCATT
AGTTATCCAGTTTGACTCGCTATAACCCTCCAGTACCCTCGAGTATCTGGTGTAGTGAAT
CCCATAGCTCGCAATACCTTTCAAATAGCGCATAATTCTTTCAAGTGCATGCAAATGATC
ATCTCCTAGGTTTGATACAAACCGGTTTAGTTTGCTTAGAGAAAACAAGATGCCAGGCCT
CGTGGCACTCGCCAAATACATAAGCGAGCCAATAATCTAAGAATACCTCACTTGATCTCT
AGCAACCCATCGATTCTTCAGAAGCAACACACTAACATCATATGGAGTTGGAGACGGCTT
GTAGTCACTATAACCAAAACGACTCAAGACATTTTTCAAATAGTGAGATTGAAGCAGTGT
AATCCCACCATTCTCATCTCTCAGCAGCTTGATGTTTAGAATAACATCAGCTACTCCTAG
AACCTTCATCACAAAATAGCGAGATGAGAAATCCTTAACCTCCTTGATTAAATCAAGTTT
GGTTCCAAAGATCAGTATGTCATCGACATACAAATAGAGACTAACTCCTTCACCCCCACC
ATGGCAATAGTACACACACTTGTCAGCTTCGTTTACAACAAAGCCTGCCACAATTAATGT
TCTTTCACACTTCGCATGCCACTGCTTAGGAGCTTGTTTAAGGCCAAGACTTAAATAACT
TGCACACGTTTCCTTCCTGACTAGGTACTACAAAACCATCGGGCTGATCCATGTAAAATT
TCCTCATCCAACTCTCCATTGAGTAAAGTCGTCTTAACATCCATTGGATGAATGAATGGA
CCGTGTGAGGCAACCAGTGATAGTAGCACACGAATAGTGGCCAGTCTAGCCATATGTGAG
TAAGTATCAAAGAAGTATTCACCTTCTTTCTGGGTGTAACCCTCGGCTACAAGTCGTGCC
TTGTACATTTTAATTGTACCATCGGGTCTAACCCTTTTCTTGAACACCCACTTACTGTTG
GAACACGCGGTATGCTACGCTAGCGCCAAATAAACTTTCTACCGTGCACCCAAGAACATG
CTACTGGAAATAGATCACATGATATGGTTTACCACTAGATGTGAAGTCACCGCAGTGAAA
GTACAGTTGGTGACGTGTGTAGTCGATCAGTCGATTCGTCTCCCTCTGTTGTAGCCGATC
TCCCACGAGCAGCGATCTCCCATGAACAGCTCCTCGGGGATCCTTCGAATGGTTTGTCCA
AGCACCGCAGATGCGATGCCTCCAAGGTATCCACACGTATGGGGGAAGCATCGGGTGGCG
CACTGCTAGGTCCGAGCACACGGCATGGCGACGTGGGGAGTGGCGGTGGCTGTCAAGGGA
ATGAAAAGGATCAACCCTAAAAGTGTGCCCATCCCCCTTTATATAGACCTCCAAGGTGGG
CTCAACCAGAATGGGCTACAATTCCTTAAGTGTGCGACCCTATAGGTTCACATACACATG
GACATGAATCGAGTCGATAGTCGGTAGCGGCTCCTAGCAGAACATGCCAACTCCCGTGTG
TGTGAAAAGTCGTTAGACGAACCTCGACAATGTGTCATATACAACATTTATCTTGCCTCA
TGATATTGGTTTTCAATATCAAGGCGAGTACTTGTCATCCTTGTGGTAGCTCGACATCTC
TTCTTGAAACCGTGATGCAGATTTCCGAACTAGGTTAACACTTAACCCATGTCGCATGAC
CATGCTTTCTGAATCTGATCACTCGAGAGGGCCAAGAGACTATCTCTCCTTACACGCGGG
CAAATCCCATCTTGGTCAACCATGTCTCGCAGCATGTCTCATGACTCACCCGAAAGCTAC
CTTTATAACTACCCAGTTACGGAGTAGCGTTTGATAGACCCTAAGTGTGTCGATCCTCAT
TCCGAGAACATGAGAGGACCTTAGGTCAAGGACATGTCATATACATTGTACTTCAGACTA
ACAGATAATAGCTCGCTATGTCTCAAAGTGGGTTTGCCCGACTCGGTGATCTCAATCCTC
GAGTCCATACTATCAGTTTAGCATCTCTATGCACATGAGTTGTGAAACATAGTCATCAAC
TAAATCGTATACTAGTAAAGGATATGTGTCCACATAACCTTAACAACTAGGGACTATTAG
AACAATCATCATACA
