Map Locations of contig_1572998 (7803 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_1572998

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_16300 1 1667 bp MLOC_16300.1 Available Available LOC_Os11g03290.1, FRAME:+3, EVALUE:0.0, 13111.m00267 protein nucleoside-triphosphatase, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_16300






Contig Sequence (7803 bp)

>contig_1572998 7803 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
AGTTGAGAAAGGAATAATGTGATTGGCTTCCTCTACAATTTAATTTCTTCTCCTACCCAA
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AGATATTGCCATATTCCGTATCGTCGTATCTGAATCACCGTATCAATGTCTGTTGTATCG
ATGCTTTGTAGGTCGAGACGAGAGGAGAGAGTGACGAGGCCAGGGCAATGATTTTTGGAG
GCGCATGCATGTGTCCGCGTCGTACGATAAAGTCGGGTAGGGTCCCTCCACAATGATATT
GAAACATGCAGCGTGTTACTCGTGGAGGGGGGGCCAGAGCCAGACCCCGACTGTTTTGGA
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TTTTATTAGGCGTGAAATTTTTATGCGTGTGTTAAAGATGCTCTTAGATACAGTACTATT
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TGTACTGCAACACAGTAGTGCGCAAGGCAGGGACTCGGCTGCACGGCCAACCAAAACCCG
GGGCTGTCCATGAAAGATTCCCGCCTCCTTTTTAACACCCTTTCGGCTCGTCACTCGAGC
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GGCGCCGGGGAAGTACGCGGTGATCTTCGACGCCGGAAGCACGGGCACGCGCGTGCACGT
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CTAGCCCTTTTAATTATTTGGTGGTGAATGATGCATGCGGTGCGGTGTAGGTGGAGCCGG
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TCCGTTCCCGTTCCTAATAACAAATCAACAAAAAATACTATCACCATCTACGTACCAGCA
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TCCCAGTTGGATCAATGTTCTCAAGGGGTCTCAGGAAGGATCTTACCTATGGGTACGTAT
ATATATATATATATACACCACTTAGATAGATGACCTTAATAAATTACTCAGTCCATATAT
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TACGTAGGTTGCTCTGAATTACCTGCTGGGTAAACTGGGAGGAGACTACTCCAAGACGGT
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CGCAGCTGCCGCTCCCACGGTGCCTCAAGGGGAGGACCCATACGTCACCAAAGAGTACCT
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CGACATCTCTGTTGTTTTGCAATGCTACAAAGCCTTGTGCACCGCTAACTACCTCCTCGG
TCTCATAATATAAGAGCGTTTTTTATATTACACTACCGAAAGAGTACTTGGCTTGGCTAA
TCAGTGGCTTGACATCTGGTAATTTTTGGAACCATTTCAGCTACTTGCACTACGGCGCAC
AGGCTTCAAGGGTAGAGATCTTCAAGGCCAAGAACGGACCAGTCAGCTACTGCGTGCTGC
GCGGATACGATGGTACTATACATATATCACTGATTAATTTGGTTTGATATAAGCAGGGCA
CATCTAACATAATCAAGAACATCTGATCGATGTGCATATATATCCTTTGATCGAATGAAT
GAAGGCAAATACACCTACAACGGAGAGCAATACGACGCCATAGCAGCACCGCAAGGAGCG
GCGTACGAAAAGTGCAGAGAGGACGTGACCAGGGCGCTGAGAATCAGCGCGCCATGCGCG
GCCAAGAACTGCACCTTCAACGGCGCGTGGAACGGCGGCGGCGGCCCCGGCCAGGCCGAG
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TCTTGTACGTACAGTATTGGTTGATATGATTGCTAATCCGGCCCTAGCTCGCGCAGTAAG
GGCATCTCCAATGATTGTATGATCATCGTTGATAATATTGCCACATAGATGATTTTGATG
ACA