Contig Data
morexGenes
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Map Locations of contig_1571959 (8819 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_1571959

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_15954 4 2093 bp MLOC_15954.2 Available Available LOC_Os03g24940.2, FRAME:+3, EVALUE:0.0, 13103.m02941 protein proline-rich family protein, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_15954






Contig Sequence (8819 bp)

>contig_1571959 8819 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CGCGCCGGAATCCCGCTCGACCCCCCCTCCCGACCCCCCGCCGCAAACCCCTCCTCCTCC
TACCCCAAACAAGATCCCCCAATCCGCCCTGCTCCGCTCCGGTCGCCGGATCAGCGCCCA
TTGCGCCGCCGAATCCGCTCCGCCGCCCGGCCCGCGCGGAGGAGGAGGGGCTGCGCTCCA
GGGCCCAGGCCGACGCACGCGCGCGCATTGCGGGGTCAGTCATGCGGATTCCATTCATTT
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TTAGATATGACACACGTACATTATATCTGAAATTCTTTTATTCCAAGTTTTCATCGTCTG
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TGTCAGAACGGTACTCCCATGGATTTTTCAAATATTTCAGTCCAATGGTTCAGGATACAC
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ATATTATTTTCCTCTTATAAAGTGTTGCTCAAAAAATTAAAAATTGCTCTTCCATTTTTC
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ATCAATTTTGGGGGTGAAACTGCAATAGCAAAGACAGCTGGGCTAGTAGACCCTGGTTTG
TTTAACTGAACACATCTGTCAGGCATAAGTATATGCATCTCTTGCTTACTACGCGACTAA
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AAAACCTGAAACTGAGTTCAATGTATGACATACTGTCCTTTCCCACTTTACGATATTTAT
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GTGGGGACATGTCCTCTTTCTCGGCTAGACAGTATCTGCAGATAACAATGCTCATTATCG
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GTTCGCCATTGATTGCAATGTACGTGCCTCCGCTTCAGCTGGGAAGTGCATACCCACCAC
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CCTTGCAGGTCCGGGCGACAAGACCCCCTGGTGAAGGGCGGCGCACTGGTGCTGGATGCT
TGTGCCTCCGAGCTGCGGTCCGACCGGTGACCATGATGTTGTACATTTTAGTGTAATTTC
ATGATATGTTGTAGCCTGTGGGTTTTGTTCCCCTGTGGCCTTGTGGTGGTAGCTCTCAGA
GGCGGCACCGTGGGCATCGTTTTAGCCGCCTCGGCGTTGTTCTCCGACTGCGCGTGCTGT
TCTTCTTCACAGGCGTTGCGATATGTCTGTTGCTAGCCGTTTCTCTCTTGTTTTTGATAC
CATGCGACGACAGTAAGCTAAGTTTGACGTGTTACACAGTAAGAGAAATGTTTGATGTGT
TGTTAGTTGTTACATGTCCAATCTTGCTAATTCTTTAGACAGTACTTGTGCTAATTTTTC
TAATGTGTAATGTACTACCTACTGAGTGGTGGATGCATAACTGAATCTAAGGTATGGCGT
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CCGTGGCATATGTATTAGTTGGTACAGACAAGTCGATATATCACCTTCCCCGAAACTTAG
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GAGCATAAATTACGTTTCTAGTGATAACTTTACTCCAAAGTTTCTTAAGGAATATTTTAG
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TAGATGGCAAAATAAAATCAGACATGTATGCTAGTTCTTGAGGGGTTGGGCCAAAAATCA
GAGTGCTGCATATACTTAGTGAAAAAAGAAAGGCTTATTCAACTCATAAACGAGTTAGAG
TTGATGGCTGAAGCAGCGGTTCTTAATCATAGTGATTGGAGTAGGAAGAATGAGGCTAAG
GAGAGGCTTCGTCATTTACTTCGAGAGGAAGAAATTAAGTGGGCACTAAGAGCGAAAGTG
TCTACGGTCGTCCAAGGGGATGGCAACACCCAATTCTTCCACATGATAGCTAATGGCAAA
CGTAGAAAGAAAAAGATAATTCAACTTGAACAAGATGAGGGTACAATTGTAGGATATGAG
AACCTTAAATCGTACATACCTGAATATTACAGAAAACTTTTCGGAGCTCATGAAGCTATC
TCTGTATCGCTTGATGAGAACATAACAGAGGGCATTCCCCAACTCAACGAGGAAGAGAAT
GAGGTACTGTCAGCCCCACTTACCAAGAAAGAGGTGTTTGAAGCAATTATGCAAATGTAG
TTAAACGAGGCCCTGGAATCAGATGGGTTTCCGGCTGAGTTTTATAAGAGGCGTTGGCAT
ATTATTAAAGATGATCTGATGCCTATGTTCCATGAGTTGTTTAAAGGACAGCTATAATTA
TTTCACTTAATTTTTGGAACAATAACATTACTATGAAAGAAGGAGGGTGCCACTCGGATA
GAAAAATTCAGGCCGATTTGCTTGCTGAACGTGAGCTTTAAGATTTTTGCTAAAGTTGCA
ACGAATAGTTTATTGAGGATAGCCCACTCGGTTGTACAACACACATACGACGTTCATGCC
GGGTAGACACATCTTAAAAGGGGTTGTTGTTCTACACAAGACACTTCATGAAATTCATTT
CAAAAAACTAGATGGAGTTATCTTCAAGGTGGATTTCGAAAACACTTCTGCTTCGGTACA
CCCCCCCTTAACACAAGAACGGTCGAGATTAACCGATACCTCTTCATAACAAAGGGCAGG
ATGGTCCAGCAAAATATCGGCGGCGTACAGGCACCGGGGTGACGTGTCGTCAGCGCGGC