Contig Data
morexGenes
Links



Map Locations of contig_157146 (4445 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_157146

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_15752 1 1227 bp AK248418.1 Available Available None
MLOC_15751 1 230 bp None Available Available None





CDS Structure of MLOC_15752






CDS Structure of MLOC_15751






Contig Sequence (4445 bp)

>contig_157146 4445 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TACATCCGTATGTAGTCCTTTAGTGGAATCTCTAAAAAGACTTATATTATGGAACGGAGG
GAGTATGCAGCATGCTTATCATGAAGGAATTTTTTGCTGCTTATTATACGCCTTGGCCCT
GCTAAATTCCCGCTGGTGCAACAAACAATACTGCCATTTTGAAAACTGTTGGGGAGTTGG
TTACCTGCCCAACTAGGGACAGAATCACATTTCTTGCAATTTCCTCAGTAATTTAACTGG
ATTTTCGAATCCAAACAACAAATAACAGGAAGCTGCAAAAGATCACAAAGTAACACTAAT
TGACATATTCTACCCACTACCCAGGAGCAATGCAGCTCCAAGCCGTTATCAGGAAATCCC
TAGTACTGCCTCTGTAAACTAATATAAGAGCGTTTAGATTACTAAAGTAGTGATCTAAAT
GCTCTTNTATTAGTTTACGGAGGGAGTAGTATGAATTTAAGGTGGCATTGAAGAAGGTTA
TATAAATTGATAAAATCATGTTTGAACTGTTATTCAGACAGGATAACCTAGCTGGATATG
AAATTTATTGCGACATAATTGCTAATACACTCTTGAGTTTGCATTTCCAGGTGATTATTC
TTGTACAGCGAAACATATTCTACGCTATCAAAATTAAAAACACTACAAGAAAATTTGTCT
AGAAATCCCAGACGTTAAATTTATAACTCATAGTTATCTCAATTAGCAATTGGACTGTGC
TAAGATTTCTCAGTACAACAGGTTGACTAGTATTTCAATTGTAAAATAACATGCATGTTC
AGTTAGCCTTTTAGTCAAACACATACATGGACTTCCTAAGGAGATTAGGCAATAGATTTT
TGCTCAATGCAACTCCCTGAAGGTTCTGCATTCTTAACAATCCATGGATGCTTCAAAATA
TCGTCCAGAGAAATCCTCTTGCTTGAATCCTTCACTAGCAGCTGCATACAAAATTCATAC
TTTGAACTTCACCACCTTAAAGGATATATAACCCATTCATCTAAAAAATAAATGATATAT
ATAATGTTTTGAGATTTTACCTTGCAAATGAGATCCTTGGCATCTGCAGATATGACACGA
GTTTTAGGAAACAGCAAGTCCACTTTGACTATCCTGCTCAAAATTCATGTTGCAGAGAAT
GTGTATCAAAGGAAGAGTGTGCAAAACACAAACACTGTAGCTACACAAACATTGTACCTC
TTACCTCATCAGGGTATCTTGCTGTTCTTCAGCTTCAAAGGGTGGTGATCCATACAAAAA
CTCGTAGCACAGGATTCCTAAAGTCCAGTTGTCAACAGCGTAATCATGAGCCTTTTTCTC
GACCATCTCTGGTGCCAGGTAATCTATTGTGCCACAAAGTGTGTGACGTTTAGCATTTGA
TCGAACCGCCCATCCAAAATCTGCAATTTTGAGTCGGCCCTGTAAAGTGGAAGTTGAGTG
ACTTCTATAGTTCTATAAAAAAAGGCTCAGCAACTTATGCACAGACAGAGTTAAAAATGT
GGACAGCAATCAGCTCTGACAATGTGGACAGCACAACAAATGATGTTCTTTACTGGTTTC
TTACTCATATGGATATGGACAACACAACTAATAAGGCCTCTGACAGTATTTGATAGTCCC
TATAGTGACAAAAGTGTTGCTTTACGAATCTCGAGAAAGTTATACAGGACATGCATCTAC
AAAGTAACAAGGTGTTCACAGCCATATATAGTACACAAGTGCAAGTCGGCATAATCTGTA
TGACCAGCAGTATTTACCAGCAAAACGTGTACTATTACTCGAAAAGAAATGGGACGCCCA
TGTACATTGCTGAACATTGCATTCAAATCATAAACCTTGGGATGTCAAATTTATACTGCA
CTATTTTACTTACAAATAATTATAGAGTGAGCTACTGCTTATCTACTAGTATTTCGTCCC
TCTATAAAACCGATTTAAACATAAAAGCTATGTGCGGCATAACCTAAAATTTCTGTACAG
TTGGATTGATCACCAACGGTCATAAGTTGAGATGCATAGTGCTTCAATTCACAATGTATA
GCTGCTGAAATTTTCCACATGTATCCTAACAAAAGCTCAGGCTACAAGGATATCTGGATA
GATTATGCTTCAGCAAGACAAAGGCAAATGGGATATATTGTTTGTTTTATTTTATCTCAA
GTATTTTTCACATATCGGCCATATCTATAAAAAGAGGTTGCGTAACCGATCACAACGCAC
AACATGCATTTCCCGGAAACATATATATTGCTTCATTAGAGCACAAAATGCTACTAAAAT
TACCGCAGCAATGCATAGGTCCAGCTATTGTTTAATCCATCTGTGGGCAGGCATAATTTA
CAACAATGATGTATTCGGATTTTATGTTGTTGGCAAACATGGATGGCCAAAAAAAATAAT
GCATTTAACTCACTGACTTATCAAAATATTGCCCCATATAAATTCTTAAAATACGCAGTT
TGGTATGATAACACATAACAGCGACAGAGAGGCAGCAACTGCATGCAGAAGAACCAACCT
CGATATCAAGGAGCAAATTTTCCGGCTTGATGTCCCTGTGAATTACCTGCTTCTTGTGAC
AATATGCCAGTGCACCAGCAAGGCTTGCTACATACTAAAGCCAAATAAAATGAATTAGAT
TAACAGAAAATCGAGCACAGAAATGGTAAGTCGGTAGAAAAGCAATGTAGGTCCACCATG
TTTGACAGCCTGATGTGCTGTACATAAAAAAATGTGTACATGTCATGCTAAGCAGAGTGC
AGTTTGACCCATTATTGTTCAGAAAATATAAATCTGGTTATTGTGTTTGGATCTTTGGGT
TGGATGGTCAAGATCTCAGGCTGAGCTGGAAGTGTCACTCCTGAGATGGGTTTCCCGTAC
TGAAAATGCTAGATTTGTTTTCACTCCCATTCATGAAAGAGGGGTGACGCTTTTCCTTGT
GTTTCTAAAGATGTTCTGGAGTTCTGAAGTTCTTCATCTTGCAGTGTGATACGGAGATCC
ATTAAGCCCAATGGAAATGAATAGCTCCTACCAAAATTCTTAACAATCAGACAGTTCACT
ACTTTCAGCAATGCATGACAAACCAACATGACTAAACACATATTGTTTCAGAAAGCCTAC
TAATAAATATACTAAGATACTAGGATCCAGTAGTCTTTTAACTTATCTTTCTCCCTCTCA
CCACCTCAGTCAGAAGTAATACTTCATTAGTGAAATGCTAGGAAATGCCCCCTATTGAAT
TTTGCGGCCTTTTCTATGGGACAGTCAGAGCTCGGAATGCAGATTTTGAGATTTCAGATA
GTTAATTCCACAAACGATAGTGAATAACAACTGGGTGATCCAATCAATAAACGCCACACG
GCTGGGGAAAAGTAACACGGCAGCAAAGTGACAGGGTGGGGAGGGCTCACGGTGGCGGCG
GTCCGCTCCGAGAAGTGGCCGACGCTGCGGAGGAGCTTGTAGAGCTCTCCACGGGCGGCG
TACTCGAGGACGAGGACGACCCGCTGGTCGTCGTGGAACCAGGCGAAGAGGCGGAGCACG
TTGGGGTGGTCGAGGCCGTGCTGGATCTCGATCTCCCGCCGCAGGTGCGCGTGGAACCGG
TACTTCTGCAGCTTCGTCTTGTATATCACCTTGAGCGCCACCACGTAGCCGCTCTGGATC
GCCGCAGTTTTCCGGCGCGTCAGCCTCATCGGAGTTGAAACATTTGGGGGGCTAGGGTTT
CGGGGACGTACCTGCTTCTCGCGGGCGAGATAGACCTTGCCAAACTTGCCCTCGCCGATG
AACTTGCCGATTTGGAAGTCGGAGAGGCTCCACCCCGGCCGCTCCATCGGAGGACGGAGA
CGCTGGTGGTTGCCGGCGGAGAGACGATAGAATTTCGAAATCGAGCGTGTGGAGACGAGC
TCGTGTGTTCGAAAGTACTCCCTCCGTTCTTTTAAGAGATTTCATTAGAAGTCTACATAC
AAAACAAAATAAGTGAATCTACATTTTAAAATATGTTTATATAAATCCGTATGTAGTCTA
CTAGTGGAATCTCTATAAAGACTTATATTTAGGAACGGAGGGAGTATAATTCTTTTAAGC
GATTTCACTAGGGATTACATACGGAGCAAAATGAATGAATCTACACTTTAAAGTATGTTT
ATATACATCCGTATATAGTGTGGAATCTCTAAAAAGAATTATATTATGAAACGGAGAGAG
TAGCAGTAAGAGGAAGAGCAAATCGAAGGGGTGCGTAGAATGGGCCTCCACTAAACTAGG
CCCGATCCCCACCCTTTCTTTTAAAAAGGCCCAATAGGAGCTATTTAGACCAGCCACACT
GAATACCACCAAATCCGGGCGCGCTTAGAGCATCTCCAACAGACGCGCTACGAAGCCGCG
CGCTAAAAAAAATTACAGCGTCAAAATAGCGTTTTACCGCGCCGGATGACCGAACATCTC
CAACA