Map Locations of contig_1571122 (9407 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_1571122

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_15602 2 2154 bp AK371337 Not available Available None
MLOC_15603 1 2458 bp MLOC_15603.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_15602






CDS Structure of MLOC_15603






Contig Sequence (9407 bp)

>contig_1571122 9407 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GGAGGGAGTATGTATGGATATTCTCTCTGTGTCATGTTTAACTGCCATTCTATATTTTGT
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GTTTGGTTGTTTTTATTTTTTATTTGTTTTCAATAATAGTACTTTGATATCTTGAAAATA
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TGCGGTTCGATATTCGGTCAGTCCATGGTAAGGCGCGCTCATCAGCGCTCGGATGCATCA
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GGGGGCGGTTGAAGGGGGGAGAGAAGAAAAAGGAACGATGGTGTCCTTGATGGGCGGGTG
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GCTTCCGTGCGTTTTAGAAACTCGTGGCACGATGCGAAAGAGGCCACACGGGCGCGCTGC
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CGTTCAATTCACCGTAAGAGCATATGCACCCATGGCTCGGCTGATCGCTCGTTCAGTTCA
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CGGTAAACAAATTAAAATAAAAACAGCTTCATCTTCGTCTTCTTTCTCATTCCTCTTTGA
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TAGAGGGGGCTGAATAGACACTAACAATGCAAAAGGTGCAATTCCCTTGAAACTTAGGCC
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GCAGCGCAAAGTAAATAACATGCACATGCTAGGAAGTAAGGAGTAGAGTTTAAAGTTTTA
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TGGTTTGTATCCTGGAGAAAAAAAGGGCTAGCCTGGCGTGAGTTACCGAGAGGGGAGCAT
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GTGGGACTATACTTGGCCATGGGTCGGGCCTGGGCCGGGCCTAAAAAGCCCATAGCAGAA
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GACCCATCTATTGAAAAGCTCGTCGGGCCTAGCGCCACGGGTCGGGCCTCTTCCTTAAAA
TCTCAGTATGCTAAGCCCAAGCCTAGCCCGACCCTGTCGGTGGGCTCAAAACTCAGGCCC
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GCGGCCGGGCCAAAGATGGACATGTATACGTGGGATGAGTAACCACAGCTGCGTGGTCCA
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TTCACACTTTGGTGTCACCGATTGAAATAGATCGAAAATTTTGAGTCAATTTCAATTTGT
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TGACAGGGTTTAGGCAGTGGTTATGTCAAGTGTATATCTGTTAGGATGGCAACGAGTAAT
CATTACCCACGTACCTTGTGGGTACCCCTATTAGGGTAAGGGTATGGGATAAAAGTCATC
CATGGGTATATAAATAGGGAAATTTGAAATCCATCAGGTACAATAGGTACGAGTATGGGA
TCGTATAACCCATACCCACATACCCATGTACCCATATAAAATTAATGTGAGCTCAAAGTT
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TGTTTATTAGAACGTGATGTTATTATGATGTGTTATTGTTTACGAGAAAGTGATGTTTAT
TAAATGTGTTGTTCTTTATGATGTGTCATAGTTTATAAGTATATGTGTTGCTGTAATCTA
CTATTGTAAATTATGATTATATGTTGTTGTTTATGACTATGAGTTGCTTAAAACAATCAA
CCAATTATAAGAAGAGAAAAACGTCATACCAAGTGCTTATTCCCCTCACAGTTTGGCCTG
TTTAGCATGTGCAAGAGTGGCACACAATGTCCGTGTGGCTTGTGATGACCCACAAGTATA
GGGTATCAATCATAGTCCTTTTGATAAGTATGAGTGTCGAANNNNNCGAGGAGCAGAAGG
AAATGACAAACAATTTTCAGCAAGGTATTCTGTGCAAGTGCTAAAGCGACAATGATAGAT
AGTTTTGTAACAAGGTAATTTGTAACAAGTGATAAGTAACAATAGTAGCAAGTGTGCAAC
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