Map Locations of contig_1570853 (3045 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_1570853

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_15500 2 1709 bp AK251055.1 Not available Available None





CDS Structure of MLOC_15500






Contig Sequence (3045 bp)

>contig_1570853 3045 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TTACAGTTTCTGAACCAAACACCTCCATAACGTGAAACAACACATGAATTTTACAGGATT
GAGGAGAGAGGGCAGGATTCTGAAAATGTGGGAATAGGAAAAGTATAGGGTTGGAGTGGC
ATGGCCACAGGAAAAACAAAGGAATTGTAAAAGGAGGTTGGAGTTGATGTTAGATTTCCT
ATGAAATGTAGTATCCAAATCAATTGATGCGTCAGTTAATTTGGATCAGAGGGAGTACAA
AAGATTCCATAGCAAAAATTCCTATAGGATTGAATCCTTATGAATCAAAGGACCAGCGTA
GGAAAAATTCCTATGTATTTCAATCCTCCAAAATTCCTATAGAAATCCTTTGAATCAAAG
GAGGTTAAAGTGCATAGGACTTCTTAAAGGAAAAATAAAATGAGGTCTGATCTCTTGTTG
AGATTCCTATGGAATGAGGAGCATAGGAATGGATTCCATAGGAATTTCGTGACGTCAATC
CTATGAAATTTCTTCAATCCAAAGAAGCACTCAATCTATGTGTACTTGAGGTCCTACACC
TGGCAATCATAAGTGTAAAGTATAAATGCTATGTTTCCGTGTGCGTAGATAGTCCCCTGG
AAGCTTAAATGCAAACCTAGAACAAATACATGCCTGATACCTGACACAATTTGTGCATCT
CATATGACGATAAATAGCCAAAAAATTGGCATCATCACATGCTATTGTTTTGTATAGATT
ATTTATAATATACCCATGTGTTGAAAGTGGATTTACCTTTGTCAACTCATGAATTGGCCT
TTTAGGAGTTTCATTCCACCTGACCTCCTCATTCCCTTAATTGGTCTTGTTTTGCTCAAT
AAACCATGTCATGCTTGGGCAAAGGCCTTAGGATTTGCGGAACTTCTGTCACTCTATGCC
TTTTACTCTTGAGGAACTTCTGTCACTTTGTGCCTTGTAAGCATTGAGTTATATTTTCTT
CGAACGCCTTATCTAGCATAGCAAAGAATGATAAAAAACAGTAAATATCGTTGTCTGTCA
GATTGTCTTTTATTTACATAAAACGGTAAATGTTATCAAATGCCTATCTGTTTATGAGAT
TTTTAAATTATCATGTTGGTAGACAGGGATTGTATTTCCTTTTCATATCTGTAAGTGCAA
ATTAATCCATGTAGCTGTCTGTTTCTAATAAAGTAATAATGTCATTGATTTTGAGCATGC
CTACTTTTTGTGTGACTGTCAGGTGACGATTGTGGACGCAGAGGCATACACATATGACGA
TGAGGTGATCAAGAAAGCAGAGGCCATGGGGAAGCCAGGATTGGTAGAGATCAACGCCAA
GGAGGACAGCTTTGTGTTCACTGTGGAAACAACAGGCGCCATCACAGCCTACGAGCTGAT
TATGAATGCTATCACGGTCCTGAGGCAGAAGCTGGACGCCGTTCGCCTGCAAGATGATGA
CGGTGATCTTTTGGACCTCGGTGCCCACCTTACCGGAGGCTAACCGCTTTGTCTGGGAAA
GAAATGGGCAGCCGTATCTTTCTTTCTTCCGTGTCTAGGCCCGTCTCGTCTAACTAGCGT
GTTTGTGGCAAGAGGTGATGGATGCTTCCTTTGATATCCAGTACCAAAACTCTACGGTAA
TCGTCTTTGTATCCCTCTGTTTATGTCCTGACCTCTGCCGGAACTCTGTATGTGCAACCC
CCAAAAAAAAGAAAAATGGGCACTGAAGCTTAGCCGCACTGTGGAGCAAGAGGATAGCTG
GTAGTCCATGATTGGCCGGGCCTTGCGGTGGTGATACGGCGTGATGACTTGAATTCAGAG
TTATTTGCAGGTCTCCCAGATTCATAAGCTGTGATGGCATTGCATTGTGGGGATTAATGT
AGTGGGGTCGACGGATGCAGTTGCAGAGTGGTACCTGGTACCAGGTTGCGGGTTGAATGA
TGGGCCGCAGTACAACGGTATTCTGTGATGGATCGCTGGCTCGTTTGCTTAGATGTGCTG
CCGATTACGGCGCCATGTGGGTCGGGGTCGGTACGGCTTTGGAGTGATGGGATGTAGCGC
GAGATTTGGTGATTAATCCTGTTTGAATGCTCGTGTCGCTTCTCCTGTCTGTTTGCTCCA
GGCGTTTTGACATCGTGGTAAATTCCGTTTGCTGCAACTAGGCTGTGCGTGTTATGTCCG
ATGCCACGTACGTGATGGCGCAAGCCGTGGTGCGTATTGTACATGCCATACGTACGTACG
TGTGTCCATCTACGGCCGGCTTGAATGGAAGGAAGTGTCCCACGGCCACGGACGTTTGTT
TCGCCGCGTTCAATACGACGTGAAAACAAGGCGGCGGCTGTTTGCTCGTGATTTTGGCGG
GGTGAAGTTGATTGGGCGTCGTGGAGCCTCGTTTTGCTCTCCATTTTGCCGCCTTCCACC
CCCACGGCATGCTAAGGTTTAAGGTAGGTAGGTAGGTTTCCTACTGTCATGCAATGTTTG
TACGGGCGCCATTGTTGTGCGAGTCTTGCCAGCCATGCCACGGCCTCACGAGCGGCGTTT
TTTCCATCAAAAAGGTCTGGGCGTCTCATTTTTGGGGGCCAGATGGCTATGCTATGCTGG
ATGATTTCCGCTGCCTTTTGCAGACAGGTCCCAGTCGTTTCAGTAGCACAACTGTAGGCC
TGATGGGACGACGGCTCACTGTTCCCTGAGCTGGTACGGTTGTTACCTTGGCTAATGAGT
AGGAGGGGTAGCAGCGATGGCGGATTAGCGAGCCCTTGTAATTGGGAAACAAGCCGTTTC
AGGAGCGATGGATCGCCTTTTTACTTCTACGGTTCTACCACTGCTGCTACTACTACGGAC
GGACCGCCTTTTACTTCTACCACTACTACTACCTTGTACTTCCTCCGTTTTAAAATATAA
GAACTTTTAGAGATTTTACTAGAAGACTACATACCGAGTAAAATGAATGAATTTATACTT
CAAAATATGTCTATGTACATCCGTATGTAGTTTATAATACAATCTCTAAAATGTCTTATA
TTTAGAAACGGAGGGAGTAATGTAAGAGCAAGTACAATAGTATAG