Map Locations of contig_1570753 (6596 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_1570753

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_15459 1 848 bp MLOC_15459.1 Available Available LOC_Os07g47670.2, FRAME:+2, EVALUE:5e-53, 13107.m05089 protein hypoxia-responsive family protein, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_15459






Contig Sequence (6596 bp)

>contig_1570753 6596 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TGCAGGCGTCTCTCTACTACATGTTGATGGCATGGAATTTTATTGCTCTATCTGTGAGGG
TGTCTTAACTCGTAATATCTAATATCTATATTCATTAAATTTTTGTCTGACTAACCATAC
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TGTGCTTGGAACCTAGCATGTTTTGACTGTACACATACTTACTCTTGTTTGATTCTTCTA
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GGAGTACTATGATCACCAGTCAGGTTCAGGGTCAAAAGTTCATGACTATGCAAAGCAGTT
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ATTATTTTCTTACTTCAAAAATATTTGAGAAAATCTAGGGAAACTCAATGGACATATATT
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CTGCTGCCCGAGAGCCCCAATCGGCGAGCTCACATGCACGCCACCCAGAGGCCCTCCGCT
TGTCCTCAACCCCACCGCGACACCCCCTCCCCCTCTGTGACAGCCCGATGCCGGCG