Map Locations of contig_1568667 (5233 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_1568667

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_14683 5 1523 bp AK371348 Available Available None





CDS Structure of MLOC_14683






Contig Sequence (5233 bp)

>contig_1568667 5233 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TAACATGCTTCTTTGGTGGCTTCTGTGTTGCTGTGTTTTCTTATGTGAAGTATCTTAATA
TGGATACATTTATTTACGGCACTGCTAACTCCACAGTTCACCTGGAGCAAAGAAAGGGCG
ATCACCTTCACCCCCTCTCAAAAAAGGGTCACCATCAAGGAAAGGCCGCTCAGCATCTCC
CCCACCGAAGAAAGCTTCACCTCCTAGGTACAAGCTTGCAGTTTCATTTAATATTTGCTC
TGCTCGCACTGCTTTGATGCTTATACATATAAGCATGCCATTTGGAGTTTCATTTTGTCT
CCACAGAATAGCTACTCAAGATAAAAATTGGATGACAATACAATGCCTGTCCAGTGCCCA
TTATATATTTGAGCTTTTCCAGTTCCTTTATGTTAGCATGATATAAATACTGGTGGTGTC
ATTACTGACCTTTTTTCCCCATTGCTGGGAGTTAGATATAGTGAGAATTGTCTTGTTATG
CATGTAATATACTTAACCAATTGTTGCTAATTGTTTCAGGAAAGCATCTCCCCCTCCTCA
GTCGGTTGTTCTACACGTTGATCATCTATCCAGAAATGTGAATGAGGCTCATTTGAAGGA
GATATTTGGTGAGTGTATCTTCATGTTTCATGATCTCTTAACTTTGCTTGATGTTTAGCT
TATTTGGTAAAAATTAAAATCTTGAGAAACTTCCGTACTTGCTAGAAGTAATATCATCAT
TAATCAATTTCATTGGAATGGTAGGCTAGGATTTCTCAAGTTTGAAGTTGAAGTTGTATA
AGCATCGTGATGTCCTTGCGCCAGTATTCAGATTGAGATTATTGAACAGAACTATTATTG
CTTTGTTCCATTTCCTGTTCATGACAGCAATTTTGAGGGATTGCAGAAAGCATTGGAACA
ATCATCTGTTCTCTGATTACTATGTTACACAGTTTTGCTAAGCAAAACACATTAGTATAA
TGAGCTAACCGTCCTTAATTTGCAGGAAGTTATGGCGAAGTGGTGAATGTGGAGCTATCA
ATGGACAAATTTGTAAGAAGCGTTGCATTGGCATTATCTAATGAAGCTTCTCTCGTCTCT
TGGCATCTAATTTGAGCTTTTTAATATATATATATAGGTTAATCTCCCTCGTGGGTATGG
ATACATCGAGTTCAAGAAGAGGACTGATGCTGAGAAGGCTCTTCTTTACATGGATGGTGT
ATGCCTTCTGCCCTATGTTTTTTATGTTTATTTTCTTATGCAAATATGACAAAAAAAATC
GCATCTTCTCAGGGGCAAATTGATGGAAATGTTGTCAAGCTGAAGTTCACACTGCCACCA
CGCCAAAAGGCTTCTTCACCTTTAAAGCCACCTCCTCCTCCCCCCAGAAGAGATGCTCCT
CAGAATGATAAAGTTGCTATTGGTGCTGAAAAGGATGCGCAGCAGCGCCCTGGGGGATGT
AAGTGTCTGAAGCTTTATATATAGCTTATAGATTTTTCAGGGCCTACTATAATGGGCATT
TATCTGTGATCTGGTTCTTTAATAAGCATTGCTCCCATCCAGGATAATTTCTAGTTGTAT
ATTTTGCCTTTTTTATTGATGATCCATTCCTGTTTCATTTGCCAGCAGCATCTCCACGAA
AGAAGCCACCTTCTCCTCCGCGAAAGAGGTCTCCTCCAAATAGAAGGGCTGAGTCACCCC
GGCGTCCACCCAATCCATCTCCAAGGCGTCGTGCTGATTCTCCTATTCGTCGTCGACCAG
ATCTTTCCCCTGTTAGGCGTGGTGACAGAAGACCAGGATCTCCAATTAGAAGACGTTCCC
CTTCACCTAGAAGGCATAGGTCACCAATGCGGTGAGTTTTCTAACTGCCATTCTTGTATC
TAGGGTATTGTAATGCTGATAAATTGCTGACAACTGGTCTTGCAACCGTCACCCTAGGAG
GGGTCGTGGCAGCTTATCACCTCGCAGACGCTCCCCGGGGCCTCCTAGGCGCTCACCTGG
GCCTCCCAGACGGCGGTAAGTTACTTTGAGCTTGTGCATCTATCCACTATCCATCTATTC
TATGTTTGTACAATTGTAATTGGCTATACGGTTTTTCTGTACATATTGATGAGCAGTCTT
TATGTGACATTTATTTTAACTCTATGTGCTAAGATAGCTTGGGTTTTCTGTGTTGGTCTA
TTGGGTTCTGTGTTGTGTTGTCAGAAAGTTCTTCTGTATCAGTTTTTTCAACTACATTAA
TTGTGTTGCTTCTTGCGTTTGGAAGCAGGTCACCACCACCAAGGAGATTGAGGAGTCCTC
CAAGAAGGCCACCACCACCACCTCCCCGTCGTCACAGTCGCTCCCCTCCTCCTCGCCGCC
CTCTTCACTCCCGCTCTAGATCGATTTCTCCTCGCAGGTAATGACATTCTGCCTTGTAAA
TCTTCCAACGGAGCTTATCTCCTCGTTCCAAAATGACAATCAATGAGTCTTCCTAATTCT
CCATGGTAGCAGGGGGCGAGGACCACCATTGAGGCGTGGAAGGTCGGATTCATCATATTC
TGCATCACCCAGTCCTCCAAGAAAGGTGAGCACAACATCTGCCAGTGGTTTCTGTTGCCT
CCCGTATAAAACAGTGCTTAAATGTTTTGATATGTTGTTTTGGTCCTTGTGCGCAGTACT
AATAAGGGGTTAAATTCTGAAAACTTTCTTTCAGGGACCAAGAAGGGTGTCAAGGAGCCG
CAGCCCTAGAAGGTATGTGACGGTTTTACATCCTTTGGCCTTTTGCATTTTTCCACATCT
TGAAACGGAATTACTAGGTGTGGATTTTTGGAACCTGGGTGCACATGTACCCGATTTAGC
AAATAAATAAATAAGTAACAGTCAAATATTTTGAAACATTTTTGCAATAAATGCTGTCTA
GCGTATTACTCACGTGTAAAGTTCAGCGACAAACTGACTTCTGTGGTATTGTTGGCAAAA
AAGACGAACTGTAGCTATAAAATATGTGAATAGTAAGGTTAATATATTATTGATTTTGTT
TTTGTTTGGGCAGAATACCCATGATATTCATTTTGTTGTGAAACTTTACAGTAGACAATC
CTTGTTGCAAAACTAGTTTTAAAAATATTTGCCCCTTTTACCTCTTTTTTTGCAATTCGG
GTACATGTGCACCCATGTTGACTATGGTATTTTTATTACCACAAGCTTATGTATGTAAAA
TTAAAAAAAATGGCATGTCTCTCAGGCCTCCCAGAGGAAGGAGCGGATCTAGCGACAGCG
GGAGCAGCAGCTCTTCCCCAACCCCAAGGCGCAGGTAGAAAGAAAGAAACTCGTAACGTG
TGTTGTTCCTGGCAGGTAAAAAACTTTCTCTTCTCTCTCGACTGTCACCATGGATTGCGT
CTGCATGCATGTATCTTGCTGTGAGCTCAAGTCAAGAGGCGATCGATGTGAGGGGCGGGA
CGATGCGATGAGGTGCTCGGCATGCCTCCCTGGCATTTGTACTCACAAGACAGACTGTAT
GATGACGACTTGTGTTGATGATTTGCCTGTACTGGAACTATTTTTTTTATAATTCTGCGG
TTGTTTGTCAACTACAAATCTGGCTAGTATTATTATCCTGTTGCCACTCTTGAGAATTAA
TGAGTTGTTTACTAGTTGATTGATGGATTGGCTCGTGGAGTTGATTTTTCTTTAACTGTA
GGTTTTGATTGTTTTGCATTTTGAACGTGCTTGGATGAATGTGCGTGAACCTGTTGCTCT
GGCATGTCCGTCTCTATGAGCCCTGTTTGGTTTGGTGCTGGCGTATCTGTTTTGTTAGCG
TCGAGGTTGAGCAACAGTCCTTGCCCCTGGCCATAGCAATCCCGGTGTGCTGGGATGCCA
CTGAAATGTTTAGGGATAGACAAAGCTGGTCATGCTGCTGACATGTCTAAGCTGCGGATA
TGCTCTTAGAGCCTGTTCTGCAATCCACAAGAATGACACTTTGACGACAATGATAAGATG
CGCTGCGGGGTGAGCAAAGCTGACTTTTCGGTGGTGCTCTGGCCGCTCCAGGAGAGGAGC
GGAGCATAGAGCTGCCGAACAGGCTCTTAGGCCTTGTTCAGAGTACCTCCGCTTCACAAC
TCCACTCTCGGAGCAGGTGGAGTTACATTAACTCCACTCCCGCAGAAGATGGAGTTACAT
TTGGAAATCCAAGGAGTTACATTAACTCCACTCCCGCAGAAGATCGAGTTACATTTGGAA
ATCCAAACAGGGTCTTAATCCATCTCATACATGAGGCTCGTTGCAAGCCAAGCAATATGT
TCTGGCCCATTTGATTTGAGTTCTCAATCTGTTAAAGTTGTCTTATAGCGGATGAAAGGA
TGTTGTTTTATGAACATAAGAGCATTTTTAGCGGATCTTGTAAAAGGGCCAAAATCGAAA
AATAACTGATTTTTGTGGTTTTGGGTGAAAAAAATTGTCCTTCCAACAAAAGAGGCCATG
GAAACTGCAAAATCAGTCCCCAATTCGCTATATGCCCAATATGAGGGGTCAATTTTTCGG
TATAGCACAAACGAGCCGAGGCTTGGTGGGAGGGAACTTTGAGCATGTTCGCCTCCTCCT
CGCCGCCCGCACGACATCATGGAGTGGCTGGACCCCCTGCCATCCATTCCAAGCTCGCGC
CGGTTGAATCCGCCTCCTGCCCTCGTCGTGTCCGACGGATGTGGCCGAGGAACTCAACAT
CAGATGTGCCCGAAGGAGCCACGGTGGATGGCATCGCCATTGCGTCTTGGAGAGCCGCGC
TGGATGGTAGCCGTCGAGCGCCGTGCATGAAGACGTTGGCGACCATCAAGGGGGGAGCCA
GAACTGGGCCAAGGCCTTAACCCTAGGCCAGCTACAGTGCCCAAATGCTACAGTGCAAAG
TATGTATGTTCTACGCCCCCCGCTTGCGATCATGGTGTTTCGTTCTTTGTGAGTAGCCCG
CATACTTTTGAATTTGATTTTTGATTTTGCTAACCTCATGTATCATGGGGTGAGTAGCCC
GCATACGGCTTGTATTGATTTTCATCTCATTTTTTGTTAATTAATTGGGCATTATATTTT
TCTTAATTTATCGACGAGTCACAGTTTTTTTTCTTCCATTTTAAAAGAAAATAAAAATAA
AAATGACGTTGTAGCTCATGCTCATATGATCCTAAAACAACAACAACAACAACAACAACC
ACCAAGCCTTTCAGTCCCAAACANNNNNNNNNNNNNNNGAGTTGAAACCCATAAGATCTC
GAAGCCAAGTCAT