Contig Data
morexGenes
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Map Locations of contig_1568110 (6013 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_1568110

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_14452 2 963 bp AK251447.1 Available Available None
MLOC_14453 1 120 bp None Available Available None
MLOC_14451 3 1330 bp MLOC_14451.1 Available Available LOC_Os01g57210.1, FRAME:+3, EVALUE:1e-67, 13101.m06066 protein katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1 homolog 1, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_14452






CDS Structure of MLOC_14453






CDS Structure of MLOC_14451






Contig Sequence (6013 bp)

>contig_1568110 6013 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TCTTGTCTTAGATTTGTTTAGATATGCATGTATCTAGTCAAGTTTTAGTATTTAGATACA
TCTATTACTAAACAAACTTGAGACAAGAATTTTGGGACGGAGGGAGTACTTGTCAACAAG
TTCTCCGTTATTCTTCCATGAACTTTAGCTTGATTCACTTGAGACTTAAGGAATGACCCA
TATGGAAGCAACAGATATGAAACATGGGTTGACATATCAGTGCAGGTTACTAGAAATCAA
ATACTCCCTCTGTCCGGAAATATTTGTCATAAGAATGGATGTATCTAGATGTATTTTAGT
TTTAGATACATCCTTTTTTATCCATTTATGCGACAAGTAATTCCGGACGGAGGGAGTATA
TGCCATGCACCCTAGAGGAATTCACACCCATCAGGCGGAAACCATGTACTGGAGATGTGG
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ATGATCAAATGACATGTGACAAATGTAGGCTGTTATCCTTCCCTTCTTGTAGGCCTATTA
TGGAATGTACATGTTCTTGTAAAGTGATGTTGATTAGTCACCTAAAAATGAGCGCTAATG
CGTTCTTGTGAAGTGTTACCAAGATACTAGTTTTAACCCTAATGTGTTCAGATGATGCGG
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ATCGCTGTAAGTTTTTCCTCAGATGTATGATGGTTGCACATGATGTTCTGCACATTGTTT
TTAGCTAATAATTGTTGAATTCGAACAGGTTCAAGCCGATGTTGTTAGTACTCTCAAGGG
AAAACTTGGTCTTTTCAACCTAGATATTTTCTCAAGCCTTCTGCCTGTTCTTGCCGGGTT
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CATCTTATGTTTTTCAGACCCATATAATTATCCTGCAATATGTGAATGAATGCTTATACT
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TGCCTCAAATTTGCAGGCACACTATTGTTGCTTTGGAGATGTTATTGGATCTTATAAAGA
TTTTTGGACCGGTCATTCATTCAACATTGTCAGCTAGTTCACCAGTTGGAGTAGATCTTC
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AGAGATGGTGCAAAAACTTGCGTTGCTACAAGCCTGCCAATGAACTCGGTGCGAGGTGGG
AAGTTGACCCCGAACATATGTTTTACCGAAACTGTTGCCCTAAATCAATGAACTGCAGCC
ACCAGTAGCATATTACCCTAGATGGGGCCTTTATATTCTTTATAGATATATAACCAGGAC
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TGCAGAAGATTGTGCGAGCTCTACAACCGTTGATGATGTAATAATCCCTTTCTCCCCCTC
CATCACTATGCTAGTTGTTTTCATGCATGTTCTTCTACTCCTTTTACGTACCACCGCAAC
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TCTGTTGTTCTTGTTGGCTGGCGCAGGCGGAGCGGCCAGTCGGCGCAACTTGCTCAAGAG
CTGAACATGTCCTTGCAAGACCTGGTGGTCTTCTGAAGCCCAAGTTGACGCCGTCAGAGT
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TGTTCGTCGTGGTGGTGTGTAATTCTTGTCCCGTGTTTGTACATTTGAGCGAGCGAGAGA
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CGGCCGTGTGGTGTGGTTCAAGTTTTGAAGACAACCATCTCTCCTCCAGAGGTTGGTACG
GTACGGCCGTTTGACCATTCCTTTGTTTAGCATGTCCCCACCAGCTGGTTGCCTAGGACT
GCTCGTTTGAACATTGTCCTAGAAAATGTGAACTCATACTTGGCTGCTAAGGAAACAATC
TCGTGCAGTCTATGACCAGCTGGCTGCTATTTCCCCCCTCCTTCCTTCAACTCAGCTGTA
AAAAATGGGATTTTGTGTAATTAGTATTCCCCCCTAAAAAGTGCAATAAGTTGTTGAATA
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CTTAAAACAATCTTCCACTGTTGCATAACATTTTTGTCCTTTGTTGATGGCGTTTCCAGG
TTAGGCTGCAGTAGCAATGTTGGGTTAGACCCCATCTAATGCTCCCTTTTGTCCCTGAAT
GCGCCATGTCAGAACAAATCCGTCTTCCTCTTCCATTTCCTTCTACCAGTCCTGCCTGCC
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TTGCACGGCGGCAGCAGGGCGGAAGTATAAAATTAAACCCGACTCAACAAATCCACATTC
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GTCGCTCGCTCGCTCGCTCGCCACCGCCGCGTTGGACTTTTCCCTCGCCGGAGAAACCGC
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CCCGCGCCGCGGTTCGCCCTGTCTACTGCTCCCTGGCTCGCGTAGGTGTCGAATTTGGTC
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ATGGACCCGTTTATACGCGTGCCCTGCTTTGTTGGCCGATCGCGAGCGAGAGGGGCGGCG
GGTGCTGCTTTCTTCTGTATTTGTTTTGGGGTTTTTTTCAAGGCAGAAATGGTGCTTAGA
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GATGTGTAGAGCTTTGGAGGCGGGCGATTTGCTCTTCCAAATTATATGCGGGCATACGAC
AGAATGGAAAAAATACCTCGTACCTTTTTACTGGCTGAAGATTGTTTTAGTACTGGCGTT
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TGTTCCATACAATACAAGAGTCGTTATCTATACCAGCAGTTCGGATTGCTGTGCCAACTA
TCGTTGACAAGGATATCTGATTGTGCATAAGCTTCTATATAAACTGGTTGTTTTTTCTTT
TAACTGTTGTTTGGTTAATGATTTTCCGAATGTATGATGTTCTGCAGGGAGGAGGTGTAC
CCCCTGCTTCTAATTCTCGGATGCCACCTCTTCCTCACGAGCCTGCTGGATTCTATAATG
ACCGTGCTGCTACCGTGGACATACCTCTTGGTTCATCGAAGGTGCCTGTGCTTCAATTGA
GCTTGTCAATTCTGTACTTACTTAGCAAGATGTGCTTTGCCCAATGAATTGAAATGCTAG
GCAGAATGCAGAATGCAATTCACCATTGGCCAATGATGAATGGTCACAGTATTCTTTATT
AAGATACTGTTGATTTCAAATTTTATTATGGAATTCTTTCACAGCGTGTTGTTGGTTGCT
TATGCGGTGCGTATGTTATTTTCAAATGTAGGACTTAAAGCAAAAGGAGAAGGAACTGCA
GTCGAAGGAGGCTGACCTTAACAAACGGGAAAGAGTATGCGTCTTTTGCTTGAAACTTGA
AATTCCAGCTTTACACTCACATCACATGTTATCCTATATGTCATTTGAGTTATTGATTTG
TTCAAACCATTGTTTTGTGAATTCAAAAGTTGTTTCGTAATCATTCAGTGATCAAACCCC
CCTATGCGGAAGTAAAATCTTAAGTTCTCCTGGATGAAATTTTGCGAAGCTTCCCAGATA
CTGACAGCCCATTGTGCTTAGATATGTAGACGGATATAGCCAACAAAACTTTATATGGCC
TTGTCTAGAGTTATTGAAGTAGTAACCATGATGCAGTATGGAAACTGGTGAGCTATGGTT
GACATGGATTTACCTCAGGCTCTCCTATAACTATTGATCATATCATGGACAGTACTTGCC
TCATGCCTAGTGAGCTAAAACCATGGGATCTTTACGCCGACAGCTGGAAACTTATAGCCC
TATTAAGGTGAAGGGTGCTTGTGCTTCTGGAAACTGGCTATTGTTATAGCCATCTCTTCA
TTAACCCAGACAATCAGATAATAAAATTCTTAACATGAATGTACAATATGCTGAATCAAG
AATTAGCAGTGGTTTTACGTAATCAGTAAAACCTTTCTAGACAGTGTTCCACACGATTGA
AACAGCTCAGATGTGCTCATGAGCATTCACTTGTAATTCTTTCTTTAACTGTTATATCTG
ATTTTTATATTTTCCTGAAACCAGGAACTTAAAAGAAGGGAAGAAGCTGCAGCTAGAGGT
ATAGTTCCCCCTATAGCTAATGCAGTTAACTTTTGTACCCCCTCCTTTCCTAAATATAAG
TCTTTCTAGAGATTCCAATATTGACTACATACGTAGCAAAATGAGTGAATCTACACCCTA
AAATATGTCTATAACTCTATATACATCCATATGTAGTTCGTATTGAAATCTCTAAAAGGT
TTTATATTTAGAAATGGAGGGAGCATATTTCTAGCCATGATATTGATGGGAAAGAGGTAG
ATAAGATGTCGGAGTTGATTAATGAGGATATTTATCTGGAAACTTGTTCCGGTCAACTTC
AGTTAAGACCTTGAATGATTCAGTGAAAGGCTATTTCATCTAATTTTGTCATTATGCTCT
GCTGTTACAGTCCAAAATTTCACTGCCCCTGCCTCTCACTGTTATACTATCTTCCTTTTC
ATTTGCAGCTGGTATTGTCATTGAAACGAAAAACTGGCCACCATTTATGCCCATCATTCA
TCATGACATTTCAAATGAGATACCAATCCACCTACAAAGGATGCAGTACCTTGCATTTTG
TTCATTGTTGGGTGAGTGTTTGTTCTTGTTTTACCTCTCCTCAAAATATCTTCTAAACCA
TCACCTTGTAGATCTTTACTTTTGTTCAAATATTGCAAACACTATTCTTACTAGAGATCT
CACATTCACATTCACATTCACACTGTCATTCACACTGTCCAAATAATGCACATACTTCCT
CTGGATCGTTGCGATTGGCATATCATCTCCTATGGCGTGAGTGAATCTGCCATTGTCTTC
TGAGAAGTGGCATCATAAAACAGAATGGTATTTCAAAACGTCAACACACTTCCCGTATGT
TGACAATCTGTACTTTGTAACTATGCTTTGTTACAAAAGTATAATTCTTCGAATCTACTG
TAAATCTTATTACTAAATCATACTACCTCCGTCCGGAAATACNNNNNNTAGAGATGAATG
TATCTAGACTTATTTTAATTGTAGATACATCCATTATATGTATTTTTAGGACAAGTATTT
CGGGACGGAGGGA