Map Locations of contig_1568065 (4477 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_1568065

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_14433 2 1412 bp AK376530 Available Available None





CDS Structure of MLOC_14433






Contig Sequence (4477 bp)

>contig_1568065 4477 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GGAGGGCGAGGCGCGCGCCGCGCTTCCGGAAGCTTCTAGAAGCTCGAGTGGGGGAAGGAG
CCGAGATGGGGACCTCGGATCTGGACCGGCAGATCGAGCAGCTCAAGCGGTGCGAGCCGC
TGGCGGAGGCGGAGGTCAAGGCGCTCTGTCTCAAGGCCATGGAGATCCTCGTCGAGGAGA
GCAACGTCCAGCGCGTCGACGCCCCCGTCACGGTACGTGCTCGCGCGCAGCTCCCTCTCC
CTCTCCTTCTCTATTGGAAGCGGTCTGGGCGCGGTTCGATGGGGGAAATGGCGCGCTCTC
GAAGCGAGTCGGGGTCGCTCCTCGAGGTCCCGGTGAAGATTGCGGGTGCTTAGGAGATGT
ACTGATGTGCGGGAAGGCTTCGGTTCCCTTCGTCTGGGCAACCAAACTTCACTGCGTTCT
GATTGAGATTAGCTAGTGTTTGAATTAGGGCTCTAGGGTTTCGTTGACGAGGTGTTGCCC
GATTTCCTGTGTCATTGTCTTCTGGAGATGGTCTCGTGAAAGCATTCTCATTCCTGTCAG
GTCTTTCAAGGAAAATGATGTAATGTGCATATTCATTGGTTGTGCTTTTGCCTGATTGAT
ATATCCAGTTAACCACACGTGCTCAAATAGTTGCGATTTAAGAAACTAATATCTGCTTCT
TGCACTCAGATATGTGGAGACATTCATGGACAGTTCTATGACATGAAAGAACTTTTCAAA
GTTGGAGGTGACTGCCCAAAGACAAACTACTTGTTCCTTGGGGACTTTGTTGACCGAGGA
TTTTATTCCGTTGAAACATTTTTGCTTCTTTTGGCCTTAAAGGTATGCTGTTGATAAATA
ACACTAAGATGTTTTGTATGCATATGCTGTATCTTTTAATGTTTATCGATGCCTCTGTTC
CACAAAACGGTAATGACAATTTTCTTGGTCAACTGGCCCAGTAGTGACTCTGACTACACT
GCCTTACCAGACTATTTTACTTGTATGGGCAAGACCTTGCTCCTTATATACATGTATAGC
AGACCTGTTTATACGACAATGGTCAAAGGCTGGCACTCAGCTTGCTGCCCTGATCTGCAC
ATGAAAGCTAATATTATGAAGCATGTATGACACTAGACTGCGCAATAACGTGAACTAGTA
GTTCAAATGAATGGTGTCTGTTTACCCCTTTCTTGGTGCTGGAATGGTCACACATGTGTA
CCTATAACTCTTTAGTTTTGCAATAATTCCTACCTAGAATTGGAAACTATTTCTAACTTA
TTTTGACTGGGTCAACTTTGATACCAAAGGTAGCCTATTGTGAATATAGTCTAGGCAGCT
CTGTTAGCACACACATGCTGGGGTAAGATAAAATCAATACTACCTGCTGTCTAGTAAACC
GCTCATAAGAAATTTAGCATCCAAGTTGTAGTCCAGGGAGTAGAAGAATAGGGCGATTGC
AGAGTCAGTAAGGAAATAAAGTGAACTGCTTAGGAGACAATCGAGGAGAATTAGGAAGTT
GATTTTGAAGCTAGTATGGAAGTATTAGAGAAGGAGTCCAGAAAGGACACAAGCATATCC
TCCATTTATGGATGTATTGTATCTATGACCTCCCTCCTTTTTAGCAAAGAAGATTAATGA
TTTATCTTTTTGTTATACAAGTTCTTGCTTAGTTATCCCCCTCCTCAAGATCTCCTTCAG
TCCATGCCTTCTGGCCACCCTCTAGGTTCACATCATAGCCGTTAACGTTGCAGTCATTTT
TTTTGTCATTATAGTGACGGAAATGATTGAATGGACTAGAACTATATCAAGTCTTGTAGA
AGGAGCTGCTTTCTTCCCACGCCTCTCATGAAAAGGTGCAATGTGGGAAGTGTGGCAAGA
AATTGGGTTCTGCATGTCGACAGAATTGTAATCTGCTCTGGTATGCTCACACTTAAAAAA
AGAGCTAGACGTTAATTGTGCATTTTGGCACTGCCTTGCTCTTTCCTTACGAAAGCGCAT
GCTTAAGCGCAATTATGCACACACTAAGTGCTAGGCGTTTTGCTACCACCTAGAGCCTAG
CCGTGCCTTTTCTATCTATGGGTGTGCTAAATTTCTAAGTTATCAGCCAAATGACCCTGG
AGATTGTTAGATATATACACGTACTCTTGTCATTTAATGATGATGTATAGCTTCAGAGAG
TAAGGATGTGTTTGGGTTGAGGCCAATGTTGCCCTACCAAAAAATTGGCAAGCCAAAATT
TTGGTCAAGGTTTTCCTTGCCCCTGAGTTTAGCAAACATTGGCTAGAAAATGAACTAGAG
TTGGTAAAGGCATTAGCTTGCCAAAAAATTGGCAACTGTCCCAACAAAGACCAAGCTTTT
GGTCATAGCCAAAAAATTGGTAATGTATGTTACCAAACATAATTTAAATTCTGGTGCCTA
ACTTACTTCAGAGAGTAACTATTGCTAGGCTGCTAAGTGCCTGGCCTGTTTTGTAACTGA
GGATGCCATATACGATATATTGTATCACATTTTGCTGTAAAAAGGTCACCTAAAGTCAGC
ATAACTCTACACCTTACTGAATGGCTGAAAGGGTTATCTTATGGTTGTTGTAAAATACAA
GAATTCCTAATGCTTGTTTTTAACTTTGTGGAGAGGCCTTGTGCTCATTCATGATTTGTC
CTGCCGTTTATCTTGGTTCCTCACATTCAAATTCCCTAATCCAACTTCAGTAGTAAAAAC
ACTTAGTTGTTCTCCTTCAACTTACATTCTGTGCCATTTAATTTCCTGTCCTAACTGTTA
CGATCAAATTGTCTCCAGGTTAGGTACCCAGATCGTATAACTTTAATACGAGGAAATCAC
GAGAGCAGGCAGATCACACAAGTGAGGGACCTTTTTCAAGTTGGATATTCTAGTGTTACG
ATAGTTGTCATTTATTCTTTGAACCCATGCATTGCTGCAGGTTTATGGCTTCTATGATGA
GTGTCTTCGTAAATACGGCTCGGTGAATGTCTGGAGATATTGCACAGAAATATTTGACTA
TTTAAGGTAATATTTCTATGTTGCTTTTATATTGCATGCGGTAATGCTATGAGGATGCTA
CTGTGTTTCTTTGAATTAAAACCATAATCTACAAGAGCTGATGTATTTGTTATTATCAGT
TTGTCTGCACTTATTGAGAACAAAATCTTCAGCGTCCATGGAGGCCTTTCCCCTGCTATT
ACGACATTGGATCAGGTAGATTATTCTCCAGTGTCATATTTCATAGTTCATGCATTCAAT
TTCTATTATTTTATTATCATGTGCCCCCAACAGATCAGAGTAATAGATCGCAAGCAAGAA
GTGCCTCATGATGGTGCCATGTGTGACCTTCTTTGGTCTGATCCAGAGGATGCTGTAGAC
GGCTGGGGATTAAGTCCTCGAGGTGCAGGGTTCCTCTTTGGTGGAAATGTTGTTTCTTCA
TTTAACCACTCAAACAACATAGATTATATTTGCCGTGCTCATCAACTAGTCATGGAAGGA
TTCAAGTGGATGTTCAATAACAAGATTGTTACTGTATGGTCTGCTCCTAACTATTGCTAC
AGGTACTTGAAAATTCAGCTTCTATCTTAATGTTCCTTTTGAAGTATAATGATGAATCCT
GTAGATTTTAGCTGTTGACAGTATTGAATAAGATTGTGTGTGGAAATTAAGAGAATGGAA
GTGGGTGTGGGGTTTATTTCAAAGCCATAAAAGATTGCTGAGATAAAATGTTCTATATTT
TCCCACCTGTTCAAAGCTTTTGATTGTCTGCTACCGTGATGCTGTTTTGTATGCAATTAT
GTTCAGGCTACTGTGTAATCTACATTTTGAGTAGATGTGATGAAACTTAGAATTTGATAT
TTTTGCAACTCATACCACCTGCAGAGGTTTCGCAATTGTACTGCAATTCTTCTAGTTACT
ATAAAAAAAACTTGCTGCAATTGTTTGGATTTTGAGAGTTATGTAAGAGGAATATGTTAC
TCAGTGTGATTTTTTTTCTGACGGCCTTTTTTATCAGCGTGATGTGATCTCCGATAGCTA
TGCTCTGCTGTATTTGTTATAGTACACCCTCTGTCCAGTAATGTAATGCGTTTTAACAGT
TCAGTTAAACTGCCAAAATGTCTTAGGCCCTGTTTGGAACCACNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNTAATCTATTATGTCTCCAAACAGGACTGATTATGGTGTAGATTATAAAAACTA
GATAGACAGATTATTAAAAACTCATAATCTACTCTACACCAGCTAAAATCAGATTATGGA
NNNNNNNNGACCCATTACCCTTGTAAAGTTGGATATAATTACATTCCTACCACCGTCATC
CTCCTCTTTTTAAAAATAAAACAGAGGGTGGACAGGTCATTATGCAATGTAAAACATGGA
TTACAGTTTATATAATCTGGCCTCCAAACATGTCCACCTAGATTATTTTTATAAACCAGA
ATATATAATCTATCTTCATAATCCAGAATATCATAAT