Map Locations of contig_1567621 (8415 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_1567621

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_14236 12 1617 bp MLOC_14236.4 Available Available LOC_Os02g15310.1, FRAME:+1, EVALUE:5e-84, 13102.m01708 protein RNA recognition motif containing protein, expressed
MLOC_14237 1 1101 bp MLOC_14237.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_14236






CDS Structure of MLOC_14237






Contig Sequence (8415 bp)

>contig_1567621 8415 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCCCCCCTCTCCCTCCCTCCCGCCCGCCCTCCCTCTCGCCCCCCTTCCCCGTCTCAGCTT
GCTTGCGAGCGTATTCGTGTGTGCATGTTTGCTCGGCCGCTTGCGTGGTCTTTCCTCCGC
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ACAGACGTTCTGCTCCTGCTTGTTGCTGTTGGAACCTTAAGGACTGTAGCATGGCGTGTC
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AGCACTGCAATGTAAACAAAGAAAAAAAATACTCCCATATAGGAGTAAAATCTACTAGCA
AACTCGAGCAAAAATTTCGCTGTGTGCCACTCCAGTTAGCTATAGTACAAGATTCTGTTT
GTTTTGCTTGAGAAGAGCCGCGGCTCTTTTGGCGGATCAGGCGGCCCCGGCCCGCCGGCC
GCGCGGCGACTTTTCCCGCCCGGCGGTTCTGGCCTGCGTGTCGCGGGACGGTGGCCCTTG
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CCAGCCCAGCCCAGCCCAGCCAGTGCGCGATCGATCGAGATTCGAGACGCCGCTACAGTG
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CCTCTTGCTTCCCCTAATTCAGGGTGGCTGCATCTGCTTTGGTCCCCCATGCAACTACCA
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GGCTCCGTAGGCCGTTCCTCCCGTCCACTTTTATATCGGAAATTTTTGTTTTTGTCATTC
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GGTATTCGGAAAATTAGCAAATTTTGGAGTGGCAAAAACAAAATTTTCTCCTTTCATGCC
CGTTCTTACGTTTACTGTGCATGCACGTGAGTAACGCAAGCAAGAGCGTATCCTGCAGGC
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ATCACGACCATACACACATCCATCCATCCAGAGATGATCGAGCAGCCAAGCACACGCCTG
CAGATAACCGAGCAATTCTGCCAGCCTACTTTTTTCCAGGCCACGCGCGCGCCCCTGGTG
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GTCGCGTCGGCGTCGGCATCGGCGTCGTTGTCCGAGAGGTTGAGACGGTAACACCACCGT
ATACGACGCATCTCTATCGACGGATCGGTCGATTCGACGTGTGGTCGAGGAAACCGTGAC
AAGGAAAGAAATCGACTGCGTGTGCGGGAGTCTTTGTATACTCCTGTGTATACGCCGATA
CGCGTCTAGATCCAGGGTACTGCAGATGATCGAGAAAACAAAGATGGAATCGGTTAAAAC
GGTGCTAGTAGTACGTACTACACCTGCAAGTACATCATCCATTTTCTAAATTCTTCCAAC
GAAGTGTTCTCTTTCCCCGTGAAAGCGTGTTTATATAAGAGCATCTCCAACAGCGAACCT
CTTTGCCACGCGCACTTCGGCTGACTTAGCGCGGTCGCCAGCACTGGCTTTAACGGCCGC
GCTATAATGCAGCGCGCGCCGCTCCAGCAGCGTCCAAAAATACAGCGCGCACAGCACGCA
CAAACCACATATACA