Map Locations of contig_1567295 (8123 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_1567295

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_14118 5 4599 bp MLOC_14118.2 Available Available LOC_Os08g06110.5, FRAME:+1, EVALUE:0.0, 13108.m00610 protein MYB family transcription factor, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_14118






Contig Sequence (8123 bp)

>contig_1567295 8123 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCCGTAATTAACCCTGCCCATTGGGCCTCCTCCGTTGGTACGTTGTACCGGTCATAACAG
CGGCCCAGGGTGTCCACAGCAAGCACGAAGAGTTGCAGGGACACGGGGTCACCAAGCGCT
AGTCTGGCTCCTTTTGGCAAAAGTTCACTCCCTTCCAAGCATCCTTCCAGAGTCGTATTG
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TGAGGTTTGCTGTTCTCTTAAGTACCTGCATATTTAAAATGTTGGAGAGGGCGTAATTTT
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CAACTTAGCTCATAGTTACTCGCCAATAAGTTTGTAAAAGCTCAGGGTGGAAACTGTCAG
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GGAGAGATGTCTCTTCCATAATCCAAAAACAATTTTACAGTGCTATTTTCTTACCTTTTA
TGTGGAATAGAGAAGAGCCAGTAGAGTGAAAAAGAAACCACCATCCACTCTTTCAGTCCT
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CTGCCCCAAATTCCCATTGTAGGCGGTTCTGGTTTCTTGCAGAACCTGGCCAGTTAGTCT
GGTTGCCCAAAAATGCCTTATTTTCTGGTGCTCTGAATCTTCATTTTCATTTTGCAGATT
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CACCAGAGAAGTTCCAAAATCAAGTGTTAGCTTGAGCAATAGCAATTCACAAATGGAAAG
CAATGGAACTCTTCAGGTAAATACCGTTGTAGTATTATATGCTTTGATTTTAGTTCTATC
TATTCTATCTATTCTATCCTTGATGTATATATTGATATACTTGTTTTTCTTTAACATGAA
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TTCAAATCATGGTGTCTCTGGGGGAATTGAACCGACTAAAACAGAAATCAAAGATATGGC
AGCCATGGAAAGGAAATCTACTTCCGTTGATGTGGCGAAGGATGTAAAAGATATTAATGA
CCAGGAAATGGAAAGGAACAACAGAGTCCACATCAGTTCTAAATATGACCGTTCTCATGA
AGATTGTTTGGATAGCTCAATGAAACACATGCAGTTGAAGCCAAATACTGTGGAGACAAC
ATACACGGGTCAACATGTTGCAAGTGCTCCACTCTACCAAATGAATAAGACTGGGGCAAC
TGGCACTCCAGACCCTGGAACTGAAGGAAGTCATCCTGATCAAACGAATGATCAAGTGGG
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ATGCCAGTGCAACCAAGATGCCTACAGGTCATCTGTTGATATGTCGTCCACCTTCTCCAA
CATGCTCGTTTCCACATTGTTATCAAACCCCACAGTACATGCAGCTGCAAGGCTTGCAGC
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TACAGTTGCTGCGGCTTCGGCATGGTGGGCAACACAAGGTCTTCTCCCTCTTTTTGCTCC
CCCCATGGCTTTTCCATTTGTCCCAGTTCCTACCGCTTCCTTTCCCACAGCGGATGTCCA
GCGAGCTACAGAGAACTGCCCAGTGGACAACGCACCAAAGGAATGCCAAGTAGCTCAGGG
GCAAGGTCAACCTGAAGCTATGATAGTTGTAGCATCTTCTGGGTCCGGCGAGAGTGGAAA
AGGAGAGGTGTGTCCTCACACTGAGTTAAATATATCTCTGGCTGATAAAGCTGAGACAAC
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CATGAACCATCGCAGGTTTAGGAACATTTCAAGCACGAATGATTCATGGAAGGAAGTTTC
CGAGGAGGTTGTAGTCTACCAGCATTGCCGAATTTCATTTCTATGTTACTCTTGAGCATC
TATCACTGCTTTTCTAATTCACATTTCTGCTGTCAGGGTCGTATGGCTTTCGATAAACTG
TTCAGTAGAGGAAAGCTTCCCCAAAGCTTTTCTCCTCCACAAGCAGAAGGATTGAAGGTG
GTTCCCAGAGGGGAGCAAGATGAAGCTACTACGGTGACGGTCGACCTCAACAAGAGTGCT
GCAGTTATGGACCATGAACTTGACACATTGGTTGGGCCAAGAGCTTCCTTTCCCATTGAA
TTGTCACACCTGAATATGAAATCCCGCCGGACAGGCTTCAAACCTTACAAGAGGTGCTCG
GTGGAAGCAAAGGAGAATAGGGTGCCGGCTGCTGACGAGGTTGGTACCAAAAGGATTCGC
CTTGACAGCGAACCCTCCACGTGATTTACTTCCCACGACATGATTACCAGCCTGCACAAG
TAGTGTATTTTCAAGAAATTGCGGTATTTACATCTAAGCTACTATAGGACTTGCCAGTCC
TTGCAATGCAGTGTTTCACAGAACTCAATTTGTTATGTGTTGTATGTTAATGCTTGCCGA
GCAGCCCTTTTAGACTGTCAATTAAGCATTAAGCACCTATGCATGCTACTTTATTGGTAA
AAAAGTAATTCTGCTTATTTTTCTGTGATGAAGGATAATACTTGTAATTTTGCTTCATTT
TACTGGATCATGTAGATTTAATTCCCGAAGGGAGAGCATGATCGCCTTGTGTTATTTTTA
TTTTCTTGAGAAAAATATTGTGCTATGTATATGCACCCTAGATTTGAAGTTTCTTGGATG
GTCCAGCTTTCTCAAACAGTGTACTTCTTTTAATTTAAAATAAAATATATGGCTTGTATC
TTTAATATCGAAGGTACTCCCTCTATAAAAAGTATAAAAGCATTTATAGATTAGTAATCT
AATCGCTATTATGTTTCTTTACGGATGGAGTAATTGGTATGCTCGTCTCATTTTCCCCTG
CCTTCTCCGCTACCTACTCTCTAGAAAAAAAATGTGTTTTTCTTAATACATATGTTCATA
CATGTACATATCCCTATGAACGAACACACATATATCTATGCGTACTTCTGAAAGAAGTAT
CTCTAAAACACTGAGCCAGACACATCATGAGTCATGATGAAATCGTCACACTCAGGTTTG
GAATAGCAGCGCTTGTTCCTTGTCTTTTGTTCTCGTTACGATGCTCTACTCCGCCTATCC
CAAGCTGAACCAAACAAATCAGGTAATCGTAGATACGGACGTACGGTACATCCTGATTAC
ATAGAGTGAATACGTTATCTATCGTGAACCAAACGCGTACATCGAGTCTATCCATTCCAT
TAGCTACTTTCACGAATTACAGCCATGGGGCTTAAAAGCCTCACACACATGCGCACAGCT
GCCCGACATAGCGGCCTTAGAGCATATCTAGTAGAACCCTCGAACCCTTAAATCTAAAAC
CAGTTTTAAGGGTTGAGAATTGCCTATTTTTAATATTTTTAAGGGTTAAAAAACAGGGAC
AAAGACTGAAACCCTCAAACCCAACCCTTAGGCCGCCTCGTATTACTTTAAACGTCGTAG
ATCCGCCGCCGGTATCATGGGGTTTAGTGCATATCAAAAGATATCAGCGGCAATGCGGGT
ACTCGCTTATGGCATACCCGCGG