Map Locations of contig_1566859 (3664 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_1566859

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_13938 1 2839 bp None Available Available None





CDS Structure of MLOC_13938






Contig Sequence (3664 bp)

>contig_1566859 3664 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GCATTACATTATATTTTAAAACTTTAAAAGAAACTCCTTCCGTCCAAAAATAGATGCCTT
ATATTTAACATTATAATTAACATTTATTAAAACTAATGCCGCATGGCAAAACAAGTAGGT
TCTGCACTTTTTTCTAACCCGGTGCAACGCACGGACATTTGTACTAGTCATAATTTTAAA
TAGCGGAATATAGCCACTAGCCGAATTTACTCTTCTAGGAAAAGCACTGATTTTAAGCCT
AAATCTTTTGCAAAAACATTGATCGACTACTTAGCCTGAGTTCTTTGGAGGAGTGGTTGA
GCAATGATGATGGACTGGTGCAACTACCCTAAATTTTTCAATGGTTAGATAAATCCCTGA
CGACATATCATTCCCTGCGTGTTTCACTGTTCTATGCATGCGGTGCTCGTGGTTGAGGTT
CGCGCCCCTCCATGTGCTTTGCCTGCCATTGGGGCTGATGCACGATCACTTATGTTTGGA
ACGCCATATGCATGTGGTTGCGCCACGTGCGGCGCCAGCATGCATGTACGTGTGCCACGA
TGCAGTTACATGTTGCAAAAACTGTCGTGCGGACGTGCCGATATTTCAGGTCGTCCAGCC
CCTATTTGTTCTCGTGGTCACTAACCTTAATATCTTCAACCTTTCGATTGCATCCCACAA
TACAATAGACACACCCACAATGACACATACAATGAGGATATCTATTGGCTCCAACTGCGC
TCCCAGCAGCTGACAACGATGAGCGGCAATTCACCTTGCGTCCCGTAGTGGACACACACT
TAAGGTTGACGGACCTCTAGGTGGTGTACACCAATGACCCGGTCTCGGTTGAGAACTGCA
TCAACGCTATGGAGCAGTCGTATGTTGAGGACAAACACAAAGTGGTCGGCTTCAACCTCC
AATACACCGGCGGTCATGCCAAGTATGATCAAAAGGCTGTCATTGCCCAGTTGTGCGTGT
GCCATAACATCCTTGTCTACCACTAATGTCTGGCCACAAGGGCTTGCGGTTTCGTCAGGT
TTCTCAACAGCACCGACTACAGGTTCGTTGTGATGGACACCACCAACGATGTAAAGATGC
TCAAGACTTTGAGCATGGCCTGCTAGAAACTTCTCGACATCCAGGAACAGTATAGAGTCT
GGGGAGAAATAAGGAGAAGGACTCCCTATTTGACCTCGCCGTTGCCATCATTGACCCCTG
CTATAGAACATGAGGGATGATTGCAACAAGAACAAGGTTGCCTAGGACAGGGCCTATATG
CAAAGTCCATATGAAGGTCACGTCAAGTATGCGTCCAAGGATGGGTACACATGCTACAAG
ATGTACACGCGGATCATTGACATGGAGAAGTGCCTCTGTCCTACAAACAGCGATGGATTG
AGGCACAAGTAGAGCATTGGAGGCAACTGTCATAAGAATTAGGTGACTTGATGATCATTT
CTCCTAGTTTAGTGTGCATATAATTGTTTATTGAGGTGTGCAAATGTTATGTGTAGTCAG
TTATGTAATTGGATGTTTAATTTGATTATGCAATCATGTTCTTATAAGTATATACATTGT
TGTTCGATAAACGGAGCATAGATGTTGCAAGCACAATGCAAATCACATTGGATACAATTA
AACTAAGGAACATGTCGGTGATGATTTGAACAATCATATCAATTATTTACCAACAAGCGT
TTGTCCACAGTGCACACAACTTATTAGTAGGAATGTATGTGTTATTATCGTCTTCCCATA
CAATTCTGATTACTGACATGTTTGTGAGGTACCACACACATCTTGTGATGTCGAATCAAT
TATGTTCTTCTGGATCATCGCAAATAGTTCATCTGAGTGACATGTATATTGTCTATCGCA
CACATCTGGATCGGGGTAACCATTTGTGTTACTTTGGCTCATCGCGGACAGTTTGTATGG
ATCAATTGTATGCCACGTATGCACAAACAACTCTTATTTGAATCATAGTTGATGGATCAA
CCATCACACACTGTTCATTTTATTGAAGACTATTTTATTACCATGTTGTTTGTGATTCAT
GCACCGTACAAAGTTTAGTTGAATAGTCTCTGATACATGTGTCGTCTTAGAACCTTCTAA
CAATAGTGTTTATTAGGATATGATGAATTATCACTTTATAATCAGATTGTTCATTGAAAT
CAATTGAATCTTTTAAAGTTTTTTTGTATAATTAAATAGTTGTATGTGTTCTCCGATTTA
TTTGTCTGCTTTAGCCAAGTTGTGTGGGTAGTTCTTCAAAGGGAATTGCGCAATGTAGTG
GGTTCATATCTTGCGACGGTCTATATCCTAGTGACAGAAAGGGACAATGCATGTATTTTA
TTGTTGTCCCTAAGGACAAAACGATGGTTCTTTATCACACTTGGATGATATTATGGCATC
ATGTTTATTGTAATGCTTTGTTTGTTATGGACTTAATTCTCTACATGTATGTTGCATAGC
GATCTTGGGGTGGTTGTAGATGTAGTTAGATAAGGGTCTACACATCATGGACGGAATGCC
TATATGAGATTATACTATGAATAATCATAGTCATAAATGTAAATATTGCAATTTAATGGA
CGTCCAACTATAAAAAAATCACCACACTACACATATATGCTTGGATAAATGCCACTAGTG
AACCTATGGCCTCGAGGGTCTATCTGCTTATACTGAAAACTTTATAAAAAATTATTTCCT
TGTTGTATTGTTTCTTTTATTTTATCAATGTATCAATTCCTACCATAACGTACAATTTAA
TCTTGTAACTAGCACGACAAGAAGCTTCACAACCTTTTTGACGCATTGGGGACAAGGTTG
TCTTGTGTTTTGTGTGCTTGTACGAGTGACTTTGTTTGATGTAATAACTCCTTCTGGTTC
GATAAACCTTGGTTTTCTACTGATAGAAATAATTATTGCTAGGTTACTTCACCCTTATAC
TTAAGGGTCACCCAACCAATCTTACGAGAGACCAAGCAGACGACATCCTCATCGCCTGGC
CAAACATGACATGACTTGATCATGGAGATGTCGAAACGCAAGAACAAGAAAAGAGAACAA
AATTGATAGCGAGGAGACTGCCATAGTGACAATCCGTTTGACTCACGGGATGCCAACATA
TCTCACCTTGGGTTTTGTAAAGTATTGTGAAGTGGAAGAAATAGCATATGGTAGCTACAG
GTTACTCGATAATCTTATGTGTGAGTATAGGGGTCAATATGGATGTTCACGGTTCCGCTA
TTGATCATTGATCAAAAGGTTTTCGGTCATGTCCATATCTCACCGAACCTGTAGGGTCAC
AACCTTAGAACCTTCGATATGTTGAGTATTAGATGAGTTAGAAGCATAGGAGAATATCAT
TGGAAAGGTTTTGGAGATAACATAAATGTTTCAAGAGAGGACACGAAGTGTTTCAGAGGA
ACGAGAAGCACTTCGGAGAAAATCAAATAGGTGAAAAGTTCTGGAGGATAATAAATAATA
ATATAGAAGTGCTCCAAAATTTACCGAGGGCCCCTTGGGGTTATTCTAGGCACAATGGCC
TGCCCAAATAGGCTAAGACCTATTATGGGGCACTCACATGGGCTTAGAGGCCCATAAAGG
TGGCGCACCCTTTAGCCGGTGTAGCCATGGTTGAATGGAGGGGTGAAAAGACCTCGATGA
CGCC