Contig Data
morexGenes
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Map Locations of contig_1566323 (6484 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_1566323

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_13712 1 1433 bp MLOC_13712.1 Available Available None
MLOC_13710 1 937 bp MLOC_13710.1 Available Available None
MLOC_13711 1 949 bp MLOC_13711.1 Available Available LOC_Os10g30130.1, FRAME:-1, EVALUE:8e-12, 13110.m02586 protein retrotransposon protein, putative, unclassified





CDS Structure of MLOC_13712






CDS Structure of MLOC_13710






CDS Structure of MLOC_13711






Contig Sequence (6484 bp)

>contig_1566323 6484 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
ACCTGCACTAGCACCACCACCACCACCACCACCACCCACACCAACCACAACAAACCCGAC
GACATACTCCAACCCATCCAAAAGACGGACAGGAAGAGCGATAAAGCTAGCACGAACACC
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GATTATTTCAATATATAAGGCTGGTTTTAGTCAAATACATGGAGCAATATTTATTGGTTT
TCTAAAGATGCTTATTACAATATGTAAATCTATTTTGTAAATGAAATAGATTCTTTTTCT
TTGGGTTTCACTCTAACATGTTTTTTGCAATGTAATTTCTGAAATTTAAATGCCTTTAAT
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CAAATAACTGAAATATGTTTCACGGAAGATTTGAAATCCATTTTTGAGATGATGGAAACT
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CAGCATAGAGTGTAAATGATGCATGTGCGGGGTTCTGCTACACCGGATTAGAAAGTACCA
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TATTGGTGCATATCTCACCGGTAGCTAGCTGGCAGCACCCTATTGGTGCATATCTCACCA
GTAGCTAGCATAATTGCTAGCCAATTCCGAAGAGGACCCTTATAATACTAGAAAATGCCC
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TGGAACCTAAAACAGTTCGACTGAACATATAAACATTCCTTGCAGCATGTAAAGGCACGA
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CCGTTTGGATGACAGTCCAACAGTAACATGATTTTTGAGCCATGTAATGTTATTAGCGGG
TGGTTTTATTCACAGTTTTGCTGTCCATGTATGATATTTCGAATGATGTAACTTCTACAA
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ACTTCCACGGAGCTACGCATCTGAGTGCTTCTAACTACTCGTACCATTTTTTTCCTCATT
TTGCTAGGCGCAGCTCCACCTGTCACGCTCACTTCATTCTGCTCCCTAACTTTCTTTCGG
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GACAGAAGGCACCATTTATGGATGGGGCGAAGATAGTCCTCCTCATCTTCTTCTACGGGG
GAAGCGAACGGAGACCATGAACATGTGAAAACTAGTGAGTACAACGTTGGTGAGGAGAAG
ACACCCCCGCAATGAGAGGGTGCTTGGATCCAAGGAACTAAAACTAGTCTGATTAAAACT
AGTCTTTTTAAGAGGTTAAAGTTTCAAGCATCCCTGACTAAAGAGAGGCTAAAATCGTAT
AACT