Map Locations of contig_1565883 (10690 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_1565883

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_13532 2 2168 bp AK355984 Available Available None
MLOC_13533 1 475 bp MLOC_13533.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_13532






CDS Structure of MLOC_13533






Contig Sequence (10690 bp)

>contig_1565883 10690 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCGCCCCGCCCGCCTCCCCCCCGCCCCCCGCCAGCAGGTGACGACCTGGCAGGCCCGGCC
CGCCGAAATGGCGGGGGATCAGGGATCGGGAATTCGGTCGGCGGTGACTGACCTCGCTCG
GGTTTTCGTTTCCGTGCAGGCGACGGTTGGGCCCTGCAACGTGCCCAAGCCCAGGGCGTG
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TGTAGATATCATGCGGTAACAAATTCTTCTCTGTTGCTGGGCATACAAAAGATCCATCTG
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GTTCTAATGTTGGAATTACAGATGGAATGGTCAAGACCCAAACAGCAGGGTCCAATTCCA
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GGGCATGACTTTATTGTACAGCAATTATAGCGGAGAAGATTATCTCATTTCTTTTGGAGG
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TGAGTTTATATGTCATCGATCTGTGCTGTGTTTCAGAAAAACAGAAATGATGAAGCAAAT
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GAAGGGCTGCAAACTGTACAGCTTAAAGAAGAGATAACTGAAGCGGAGGCCAGAAATGCT
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CCTACGGATTACTTTATCGTGTCCTTTTGTCCTGCATATATAGCTTTGAACCAATCAATA
TATGCATGCAAACGGTGTAGGAACTTCAATCTGTCCGTGGGCAACTTGCTGCTGAGCAGT
CGAGATGTTTCAAACTTGAGGTGGACGTGGCGGAGCTGCGGCAAAAGCTTCAGAGTCTGG
ATGCACTGGAGAGGGAGGTGGAGCTCCTTCGAAGGCAGAAGGCGGCTTCCGAGCAGGAGC
AGGCGGCGCTGGACGCCAAGCAGAAGAAGCAAGCTGGCTCAGGTGGCGTGTGGGGCTGGC
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TACTTTACAATATTGAAAAGCTTATTGCATCACTGCTCTTGTCCATTTAAACAAACAACA
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TGCCCCCCTGTCAAAAAAGGTAACCCGGGTCTCCCTCCCCAGCTCACGCGTCTCTCCTCT
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CACAAAAATGCTGATAGAAAAATGTTGCAACCTTTATCAAAGAACTATTGGTACTGTGAG
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GGAAATTTAAAAACCTCGTAACATAGAAAAACTGCTACGTTGACTTCAATGCAATTACTG
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ATTATGATTATGTATAAGCAACTAATATGATGGTCTCACACAAAAATGCTGATAGAAAAA
TGTTGCAACCTGGTAGTTACAAAAGAATTGTTGGTACTGTGAGTAACTTATGTGACCTAG
TGCAACTTGCCTCACTGAATAAAATACAACAAGGACACAACAGTGAATAATTGTGAAAAG
TTTAAAGAACATTACCTTGGAGAAGTGGCTACCAATGCTTCCTACCAAGTTTACCTCCCT
AGGAAAAATGTTAGATTGCTCCTGCAAAAGAAGGACCCACATAGAACAAACACAAAGAAA
AATGCAGAAAAAATCTATGAAAAATGAGGGGCTCCAATGCGCTAGAAGATAACCATGAAA
AAGGGCTCCAAAACGAACGGTGGTTCTGATGTTACTAGTACCAAAATACGTAAAAAGAGT
ACTAAACATAGTGACCACGTCACCCAAGATTTGTCGCATCATCATCGCATNNNNCGCATC
ATCAGCATTGCATCGGCTCTTGTTGCCGCCAGTTTTCAAAAGGTGCATCCGTTGCAAGTT
GCCAGTTATCGTCGTTGTCCGTTCTGAGNNNNNNNNNNCACGCACGTGCCCGCGGCATCG
TTCGAATATTGTTTTAAAAGTGTGCGTAAAACTTTCTCTGATTCGGGTGAGATTTGACGT
GCGGTGGTAT