Map Locations of contig_1565848 (8218 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_1565848

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_13514 1 3859 bp MLOC_13514.1 Available Available LOC_Os01g47410.2, FRAME:+3, EVALUE:0.0, 13101.m04889 protein aspartic proteinase oryzasin-1 precursor, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_13514






Contig Sequence (8218 bp)

>contig_1565848 8218 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TGCGCTGGCGACAGGGGACCAAAACCATGTTGGTTAGGGTGCCCCCGATCAGGGTGCTTC
TGTTGTGACGAGGGAACGTTCGTTGGATCATGGCCCTCTCTTTTACGTTACTTTGTGTTT
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TAAACCAGCATGAAAATATGCAGGCCATAATTGCTCAGATAAATGAAAAGATTGGTGCGC
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ATTGACACGTGTAACCAAGAGGCGGGGTACATATCACATGAAATATATACTAACATCTGT
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AAGATAACACTTCCGCAAGTAAGAGAGCAATTCATGTGTGAGTAATTATAGAGTACAAGA
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AAAAAGAAATAATTTAGGCAAATTCCATATCAAATGCTTAAATTTTTCTTCAAAAATACC
TTCTATAACTAGGAGCGTGGGATTTGACATCACTACCAGAAACAACAGTATCACACAACC
TGATGACTACAATGCCTTTTTGTGTTAGAAAATTATAGTTTTCAATGGGTATTCAAGTTA
TACCCAACTCCTTTGCTACAATTTCCATACTTTGCAACCTACCAAATTTCATTTGAAATT
CCACCAAAAATGATTTTCCTGTCTAGCATGAAATAAATATAATATCTTATTGGTCGAAAA
GTTCAAGTGCATGAAGTTGGTTTTATGACATGTTTACCTTTCACATTGGTTTACTTATGT
CTTGATGATTGACATTATTACATTGTTTCCTCCTGCAATGTAATGGCAGCTTTGGTATTC
GGAATGTGGTAGATGATGAAGCTGGGAGATCAAATGATGCCATGTGCCATGTTTGTGAGA
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TGGCAAAGTATGCATATTAGATTCTATATTGCTTACAGGAATAATTATAAGTGCTTGAAG
AAAACTGATCTCATGCATTCATATTTTATATGTTTTCTCTCCCTCCCTCCTTCCATTATA
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GAGATGCTACTCAGTGCATTAGTGGATTCATAGCCATGGATATTCCTCCCCCAAATGGTC
CTATCTGGTAAAATTCTCTCATAGCTTTTTCATATGAGATCCATCCTGATCATTCTCAAG
TGTAGTACGTAAATTTCATAATACAAGTGTATTAGTTTTGTTAGATAATGTATTATTACT
ACATCGTTTATTAGAAAGCCGCCAAACAATGATTCCACTAAAATTAGGAGAGACAACATT
CCTAGCCAATATAAGCAGAGTGTAACATGCCATACAAGACTACTCTTAATACTGGGAAGC
CTAACATTGACACTATCCAAATAAAGACATAAACTCGCTGTTGGTACACTCGATGTTCTT
ATACACAAGCTCCCTCGGCCCTGTACTGCACCTTCTCTAACTACATCCATGACCGCAACC
AACTGGTACATGCGCACCGAGAATTTTGCCAATAAAATGTCATTCTCGTCTATCTAAATA
TGAGATACCTCATCTAGGGGAATCTAGATATCAACATGAATGTTCAGAAGGATCTCGGTA
ATAGTATGTAATATAGGTTTCCGCCTCCTCCTCACGTTCAATGGTACACTATCATCCTAC
TCGATCTTGATTGTTTCATTTAATCATTGACCTCATTTTCTTTTGTGATACTTAATTAGT
GTGGAACTAATAAAAATACGTTCACCAATTTCAGTTCTTTAGGAATTTGTGAGATTTATC
TGATTATATATGGTCTTTTGTTTTGTTAAAAACGTTCAAAATACTCAGACTCGTGGAACT
TACTCTTCTCGACTCTGAAAACGATAACTTTTTTGTCATAGGATCTTGGGCGACATATTC
ATGGGAGCCTATCACACTGTCTTCGACTATGGCAACATGAAGGTTGGCTTTGCGAAGGCG
GCATAGGTAACCAGACGAGCCGCAAAGGATTTGTCTTTCATGACATTTTCTTATAGATGT
TTCATAATTCCCGTGTGGTTTAAGATAATAAACATGTATGTGTTTCAAATTGGCCAAGAT
ACAGTCATAATTCAATATGGGAAGGATTAATATTTAGTTGCCCCTGTGAGGTGCAGGCTT
CGGTATTATTGTTCTTATTGAGGTGAATGGTAAAATGAAAACAGGGGCAACAATGAACTA
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GCTCAGACCGTGTCGTCGAGTACTTTCCGACGACACGCGACGACCGACGACGAACGAC