Map Locations of contig_1565670 (10230 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_1565670

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_13446 2 1865 bp MLOC_13446.1 Available Available LOC_Os10g17770.1, FRAME:+1, EVALUE:1e-81, 13110.m01457 protein chromo domain-containing protein LHP1, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_13446






Contig Sequence (10230 bp)

>contig_1565670 10230 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCCGCCCCTACCCCTGCATCAACGCCGCCGCCGCCGCCCCCCTGCACCAACGCGCCTCCC
CCTGCATTAACGCCGCCGTCCCCCTCCACCAACGCCGCCGTACCCCTGCAACAACGCCTG
CCCGGGTTCCTGCACCAAGATCTGTTCCCCCGTGTCGCCCCAAATCTGTGAGTCCGCCTC
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GATGACAAGGAGTTGAAGTCTACAAACCCGTTGGTGTTGATAAACTACTACGAACAGCAC
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GATCCAGTCTTGCCTAGCCAGCATTCCTACCTAGATGAGTGTCATTAAGTTTCTTTAATG
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TGTACTCATGTCGTGCTCTCTACTTGCTACAAAATGTATGCTCGCATGATTTCTTAAAAT
GGAACCGGGGTAGAATCCCTTGCCCTAAAAAATAATGGGTTTATGTTCTCTCACTATCTT
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ATTTTAGCGCAGTTTGATGGCAATGGCAAGCCAATGGATGTCAACCTTGGTGTTATGCAG
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TTGGGAGCCAAGCTGGGAGTGGTGGTGGAGGTCTCTCACCACAATGGAGTCATTGCCGAC
GAGCATTTTCGTGTATGTCTTGACCATTTGCTTAACAAGCCTGTATGCGGTTTTGTTTCC
ATTAACCCTAAGGGTAGCATTGAATAGATCAAGTTTGAGGTGAAATATGAGAAGTTGCCT
ATTTTTTGTATTGTGGATTGGTGAGGCATTCATCGGTGAGGTTCTACCATGTGACGAGGG
AGCCGGGAAGGCATGTTTTCTGTTTTGTGAGTCGAGTTCCCTCCTATTGGGAAGAGAGGA
ATTGTGTGCAGAGGTCGCCCAATTCCAAGAATCACCGCTGAGCCTTAAAATAGTGTGAGG
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CTTTCCTGGAAGTATCCTAATTAGTTATCGTCTCAACTAAGAGCAGAGGTGAGTATTTAT
AAGAGCACTTCTGTCACACACAAGTTGCCACGATTCTTATGTGAATTAACTACTTGTGGT
TCTGCAAGCAGTGCTAGTGTCCAAGAGTAAAATAAACCAGAGTGATAAGAATGAAGAGTT
TGTAGCAATGAAGGTGATGATACTTGAAAGTAAAGAACATAAATAAAACTGAAAATAGAG
TTGTGGTTCCTGCATTGGGGAGGTTAGGCATGGACATAATTCAGTCTACGATATACATCA
AGTGTGCCAGTGTGACGGTAATACTAGTTACCTTGTATCACGGTCATAGTATTTTATTTG
TTTCTTCAGTAGCCGGATCACCCTAAGGTCATGGAACTCCTCATCTCAAGATTACATTCC
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ATAGATGTCTCCACGTGTCACACCTGAGGTCAAAAATTTCATAAACAATATGTGTTACCT
GTGTAGGTTTTGAGATCATGTTGCATGGGCCCTTAAATTGGACAACACGTATAGAGTTCA
CCATAGTATAGCAACTTACTAGGCATGTTATTAGACTACAAACACAAATTAGGACATATA
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ATGAATAGAGTTTAAACTTGTTATTACAACTTGAAATTCCTCTTACAATAATGAACGATG
AAATGACGGAGATGAAAGGACCAAAACTAAGAAGATCTCCAACGGTTCTCCAGATTTCTT
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CACCCAGAAGATTCCCCCTTTTATTTCCGT