Map Locations of contig_1565657 (10833 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_1565657

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_13441 3 4527 bp MLOC_13441.2 Available Available LOC_Os11g11960.1, FRAME:+1, EVALUE:0.0, 13111.m01266 protein disease resistance protein RPM1, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_13441






Contig Sequence (10833 bp)

>contig_1565657 10833 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
ACTAGAGGCTTAATAGGGACATATTGTGATCTATATATTCACACATGTATTACTATTTAC
GGTTAATACAATTATANNNNNNNNAATAGACAATTATCATGAACAAGGTAATATAATTAT
AACTACTTTATTATTGCCTCTAGGGCATATTTCCAACATGATCGAGGGATTAGAGTTAGC
TACAGATCTCCATGGGTTAGCCATCTTTTGTTTGTTGATGATAGTCTAATCTTTATCAGT
GCAAATGAAGATAGTGCGATTCGCCTTAATACAATTCTTCAAATTTATGGGGCTGCTTCG
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GTCTAGAGGAAAGATCCAAGGGTTGTCTGAGAAGCTCCTTGCTTGTGCTGGAAGAGAAAC
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TGGCCTGGGCTTCAGAGATTTGCATCACTTTAACCTTGCACTCCTTGAGAAACACGGGTG
GCGTTTTATGACAAAACCAGATTCCTTATGTGCAAGAGTGCTGAAAGGTAGGTACTTCCG
TGACATAGATTTCATGCAAGCAACATGTCCACGATCAGCCTCGGCTACTTGACGGGCAAT
TTTTGCAGGAAGGGAGGCACTTGTGTTGGTCTCATAAAAAGTATTGGTAATGGAAATTTC
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CTCTAAGCATGAACGGTGGTGAGGACTCCCTGGCTTGGGTGTTTGAGCGCTCAGGTATCT
ACACTGTTAAATCGGCGTACCGTATTCTTATGACTCAAAAAGAGAGTGTAGCTCTCGAGG
AAGGAACGACTATCGAAACTTCAAATGATGAAAAACAGATGTGGAATGTCGTGTGGAAGC
TCAAAGTCGTTCCCAAAGTGTGTGTCTTCTGGTGGAGGGTTCTTCGTGGAATTCTCCCAG
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TGTGGAACATTTGGCATTCTCGGAACCGTGTGAAGCATGATGGAGATGCTCTAGACCCGG
TGACTACAACAAGGAGGACCAGAGAAGTGATGGCTACCAGGGCATGGCTGGCAACCTCCG
GAGCAAGGTGTCATCAAGATCTCTACAGATGGTGCATTGAACTTTGCAAATGGCCGAGGA
GGAGGTGGGGTGTGGCTCGCTCGGACATTTCTCTACTTACAGCATGGTGCAAACCTCATC
CTGGTATTTCGGATCCTTTCATTATTAAGGCTATTTGTGTCCATGAAGGCGTTAAGTTCG
CCAAGCTGAGAGGTTTTACACATGTGATAATGGAAACTGATTGTCTTGAGGTAGTTACAC
TCTGAAACACTCGCCACAATACCCGTTCGATTGTGGCTCCTATCTTAGATGAAATTGAAG
AGCTAGCTAGGGATTTTATCCTGTTTGATATTCAGCATGTATTTAGGACATCAAACATTC
CAGCTCATCTCTGTGCTAAGCGTGCTTGCACTTTGAATGTGACTGAGTGTTGACTCGATG
AAACTCTAAGCTTCCTAGTGACCAGTCTGCTGGCTGATTGTCCTAGGAGTGTTTTTTGTT
AATAAAGCTCTTTGAATTGCGAGCAAAAAAAAAAGAATACCATAAATATTTTCTCTGAGA
CGACGAATTACGGGATCTGCTAAGATGCTCTTAACCGCTCTCCGTGCTCTTCTTTGACGT
TACTCTGATAACTACCGCATTTCTATAACCCAAAGTCTGTAATCAAATCAACTGGTACCT
GTCAAGCCGTGACCTACTGTAGTACAGTATTTCAATTGCCACTTTAATGCCTATTTTTTT
CCTTTTAATTTTAATGGTGGACATATACATCTCGGTATTATCATATACTAGTATCATGCA
TGATACTACATCCGTAATGCACAGTATCATATATTAGTATCATAAGATAGTTTATTTATT
ATCATTTATGACACATAGTAATATAAAATTTAATATGATACAGTATCATGATATGATACG
CAACCCCTCTTTCTTCATTTAACTGTATGTCAGCTCATTAAAATTGTCTAGTTGACATGT
ATGATACTACTTCCGTTTCTAAATATAAGTCTTTTTAAAGGTTTCACTAGAAGACTAAAT
ACAGATATATATAATCATATTTTAGAGTATAGATTTATTTATTTTGTTCCGTATGTAGTT
CCTCTGTAATTTTTTTAAAAGGATTTATATTTAATAATAAAAGAAATATTATTTATGATA
CTGCCTCCGTCACAGTTTAGAAGGCACAGTTAAACTTGCGTGCGTTTTCAAAATAGACAA
GGTTTAAGGCGCGAAAACAATTACTCCTATTAATTAATACTAGTACTACTCATGCATGTA
CCCTCCCAATTTGCTGCTCACGCATTAGTACTAGTATTTTTTCAGTTAATTAGATGCATT
AGCATTTACACCTGCTACTCTCATAACCAATCAATGATTACCTTGGTTCCAGAGATTTTT
CAAGCGTGCTTTCCAAACCGTGACGGAGGGGTAGTTCTATTACGATCAGCCTTTACGGTG
TTTGGTGGGGGATAGAGACTAGACTGGATGCCATATGCCTATGCCTTTGAAAGAATCAAA
GTCAACTTTGAGTTTTAATTAACAAAACAAAGAGGCAAGTGTCTGAAGTTCAGAAAACAA
AATGAAGTACGTGGTTATATTTCGGATCAATAGCATCTCCCAAGTCCTGTCCTTGGCATC
CAAGTCCTCACTGACCAGGGACCTTCACTGCCGTCAACCAGTCAACCAGGTTTGCAAATT
CTGCCATAATTTCTAGCAGATCTATGAACATCTTATGGCTCTTCTCTGATGAACTAGTTC
GCATCCGACTGCAGTTTTCTCTAGTATTCTGATTCTGTCGGTTGGGAGTTTAGCTATTCT
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TGCTCATCATTTTTCTTGGATTTGCCTAGACGGAGATTCATGCCCTGGTGTTTTATCCAT
GTGCGCCAAGAAATATTGAAGCTTTTCTTTTCGGTTCAGCGAGCATCCGCCTACTTACTT
CTTCAGCCTGCACACGAGTTGACTTGATCTGACGAAGATTCTGGAGGTCTAATTCGGGAT
TAAAAAAAACTACTCTTGTCCTTAGGTTGCCATCATTCATTCAGTACTTTGCAGAATGCA
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AGGGGGAGATCTGTGCATTTTTAAAGTTCTTTTAGGTTGATTTTATGGGGTTGAACACAA
GAGGAAAACAGGCGGTTGGCCGTAGGTTGTTTTTATTCAAACTTATTTTTACCTTTCAAC
TATTTTCTGACCACTTAAAACGCCTTTTATGTTTATTATGCATTTCATATGCGTACTAGC
AACGGTATAATAAGGTTGCTATTATTTGCACTTCAGGATATCGAGGCATATGATTGCAAA
TGGATCGCCATTCAACTCCTACACAAAGCGACCTGGAGCGCATGCTACTTGATGTAGAGG
CGGAACCGAGGGCCCTGCCATTATCCCTCCTCGAAGATATCACTGATCAATTTTCTGATG
AGAGTGAAATTGGCAGAGGTGGATTCGCAGTGGTCTATAAGGTATGATAACTCTCAACAT
TCATAGTTTAAACCACAGTTGATCTCAAGATTTTAGTTGATACCAGGCAAATTATTGCAA
ATGTAGGGAATGCTTGAGAACGGGGTGGCCGTTGCTGTGAAGAAGCTATTCAAACCATAT
ATTTATGAGAAAGAATTCGATCGAGAGGTTGAGTGTCTGATAACGGCGAAGCACAAAAAT
GTGATTCGATTTATTGGATATTGTGCTGACTCACAAAGGAGAGCAGAAAACTACAATGGA
AAATTTGTCATGGCAGATGTACAACACAGATTGCTCTGCTTTGAGTATCTACCTCATGGA
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TATTTCTTCATTTAAGACTATTCGGTTCAAGTATCCCATCGGCACATGACTTGCTGTGTA
GTATACTATCAGCCATTCAACGATTTAAGGTTTTCATGTATGTCAAACGATACTAAAGCC
CCTTCCTCTTCTCATGTACATAGATGAGTCTTGTGGACTTGAATGGGGAGAGCGTTACAA
TATAATTAGTGGTATTTGCAAGGGATTACACCACCTCCATCAAAATCGAATTCTTCACTT
GGATCTTAAACCTTCAAACATTTTGTTGGATAATAATATGTTACCGAAAATTACTGACTT
TGGTCTAGCAAGACGCTTTGATGAAATGCAGAGCCGGGCTATTACTGCAAATATGAGTGG
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GTAATAATCATGGAGATGCTCACCGGAAAAAGAGGGAGCCACGAAGTTGATAATGTAAGA
ACAATTCAGGTCCTCTTCCGGAAAAATAGTTTGACTTTAGAACTAATGCATTACTTTTCA
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AAATGCACCATGGACCACATATTTTGACTGAAAGACTTAAAGAACCTACAAAATTATAAA
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GAGTTACCATGTTGCATCAATATTTAGCACTTCAAAATCACACAAACTAACAGCCAGATT
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AACATGTGATTTGTAAAAAATAAATTGTGCATGGACGATTCAACCTTCTTCTTTTCACGT
TGCCGAATATATTTCCTCAACACATCAAATACGGCTAGTGAAAATTAGATGAACAAGAAT
AAAACAACTTTTGTTCCTGGTTTCTTGACCATCACGGTAACACCGAGATTGACAAGTGGA
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AAATAACGGGCATCAAACTGCCTGTAGTGGAATGAGAAATAATTTTCAGAAAGATACCTT
CTGTACATATTCCTTTTGGTGAATGATAGAAATGCAAATTTACATGGCCCTGTGTCTGAT
AACAAAAAGAAGGTCCAGTTTTATTTTTTGGGAGAGTACTTGTACAATGTACATGATCAT
CCGTGTTCAAGCTATCTCAAACCTTTATTTGGAGGCATATTTATTTCTTTATTGAATTAA
TACCTAGTTTCTTCCGATATGTGAGAAGAAACTAGGGGCGCACACAAATAAAGTTAATGA
TAAATTTTCTTGTTAGTTTGAGTTTGCGATCTTAATTGAAGTGATTTGGTAATAAGCTTG
TAAACATTGTGCATGGGGCTAATTACAGTACTACGTACTTGAATTTCATATACGAAAAGA
TGGTACTTCTTTTGATGACTCACAAATTCAATTTATAGGTAGTTCAAAAATGGAGTGAGA
GGTTAGAGAAATCACAGAGCGACATACAGTTGGAACAAGTCCGAGTATGTGCTGAGATAG
GAATAGAGTGTAGCGACTCCGACCCGGTGAATAGACCTAGTACAGAGCACATAATCAACA
GACTCGCCGAAACAGAAAGTGCGGGGGGTTATACCGAAACTGACGTAATTACAGCAGAGC
AGGTAAGGTCACTCCTGGACCATCCATGGTATCCTCTACAAAACTTAAATCTTGAGAACT
TGTGTATGTCTCATGTCTCCATTTGCACTTTTGAACCTTCGATCCGGCAGATGAGGTGAA
GTGACCATGATTGATTATTTTAACAGGCAGAAAATGCTTTGAGTGAACTGCATCACGATA
TGCCTAAGGATTCAGGAGAGACGAGCTCTGAAGTAAGTTTCCGTCAAAACGTCATGTATA
AGTATTTGTTATCCACCGTTTGCTAACATCTGGTAAAATGTTTTCAATAAATATTTTATG
AGGCAAAAAAAAAAAAAGATTGGTCAGAAGAAATAGCATTGTTAGGTCAGTCATTATTGC
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GTTAGAAACTTCAAAATTATTACGTGCACAAAGTTATACGTATGTTTTCCATGATATTAT
AACTTTGTTGGTACATATACTGTAAGAGAAATTAGAGGTCCAAATTATATTTTAAAGAGT
GTGTTTAATGTAACCTCACTTTATTTGTGTTCCAGTGGAGTAATATAATTTTCAAGAAAA
TAAGATTATACCGTAAAGGGTTTTCTCCTATGTCGTAGATGTGGTACAATTAATTTTGCC
AGAACCTGGTTTATATTGCTAACTTGAGTCATGTGCTGTAGTCCTTCACAATGCATTTTG
AGTCATCTTGTATCGTTTTGACTGAACAGAATTTCTTTTTCTTGCTGACAGAATTTCTCA
TTTCCCTGTTCATCAAACTTATTCTTGGATCAAATGCAGCCAGGTATTCATACTGCATAT
CCAGTTCCAGCCAAACTTTTTAAAAAGTAAGACAGTACTTTATCTGACACTGTGAAAGGT
CAAGTGTCGATGGTGGTTCAGTGCCTGACTGGCTGGCATTGAGCAAAAGGGTCATAATTT
GTTAAAGTCTTGGAATAGTGCCATCTTTTATGGAACTTCCAACATATGGTCAATTTTTTC
AATTCTTCCACATTCATGATTCCATCAAACATATTCCTATCAATTATCTCATGGTAATGT
GTAAACGGCTTGAAGAGTTAGTGTTAAAATTTCAAACGTGCTAAATAGTTAGGATGTCTT
TGATAGATAGATAGATAGGATATAAAGTGGCCATGGGTGAATATTCCTGATTATTATGTC
TGAATGAGCTAACTTGTATGAAATTTGTGCTTCTACCAATTAATATGTTTTTTGTCTTTG
TTTTCCAGCACAAATTTCCGAGGTGCTACTCCCTGCTTTGACAAAGATTGATTCCATTTT
AGGTGATGAAGCCGCCATGGTTATCATAGCTGACCTCTCTAAAAGGGCTACCAATCTCAA
GAAACTGCCAGGGCAGCTCGAGGAAATAGGGAACCAACTGCCAGTGATAGCCATTGTTAT
AAGACAAATGGGCACAGTGCACCTCACTGATGGAATTGCCAAGAGTTGGATTGGGGAGGT
CCGCAAATTGGCTCATCGTGTTGAGGATGTAATGGATAAATGCTCATACCATGTTGCTGA
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ATTCACTGAAATTATGGATGAGATGGTTGAGGTAGAAATGGAGATCCAGAGAGTTATACA
GATGAAAGATCAGCTTCAAAGTGAGTTGTCAACCAATGATCATGTACAGGACATTTTGAA
TCTGAGCTACCATGAGCTATCAGGAGACCTCAGAATCTGCTTGATGTATTGCACTCTGTT
CCCTAGAGACTACCCCATGTCACGTGAAAGCCTTGTGCGGCTGTGGGTCGCAGAAGGGTT
TGCACCGAGTAAAGAAGAGAACACACCAGAGGTAGTGGCTGAGGGAATTCTCATTGAATT
GATCCACCGCAAGATGCTTGAAGTCGTGGAGAATGATGAGCTTGGTAGGGTCAACACCTG
TAAGATGCATGATACTGTGCGTGAACTGGCTAGTTCAGTTGCTAAAGAAGAGGCATTTGC
TTCAGCAGATGACTACTACACTATGATACAGATGGGTAAGGATGTTCGTCGTCTGTCATC
ACGTGGATGGAAAAATGACACTGCACTGGAAGTTAAACTTCCACATCTTCGAACACTACT
GTTCCTTGGAGCAATTTCACCCTCTCCTGGCATGTTATCTTCTATTTTGTCTGAATCCAA
CTACCTTGCTATTCTTGAACTGCAAGACTCTGAAGTCACTGAAGTGCCAACATCGATAGG
GTCTCTGTTAAATCTACGTTACATCGGGTTACGACGCACTAAGGTCAAGTCACTTCCAGA
CTCTATTGAAAATCTGTCTAACCTCCACACTTTGGACATCAAGCAAACCAAAATAGAGAG
GCTACCCCGAGGGGTTGTCAAGATCAAGAAGCTGCGGCACCTTTTAGCCGATAGATATGC
TGATGAGAAGCAGGCGGAGTTTCGGTACTTTATTGGAGTGCAAGCACCTAAAGATCTGTC
CAACTTGGAAGAACTGCAAACTCTCGAGACTGTGGAGTCCAACAGTGACTTGGCTGAGCA
GCTGAAGAAACTGATGCAACTGAGAAGTGTGTGGATTGATAACATTAGTGCTTCTGACTG
TGCAAATCTGTTTGCTACCCTGTCAACATTGCCACTTCTTTCGAGCTTGCTTCTTTCTGC
GAGGGATGAGAATGAGGCACTTTGCTTCAAGGATCTCCAGCCAAGCTCTACACATCTACA
CAGGTTAATTATCAGAGGACAATGGGCCAAGGGGACACTAAATTGCCCTATCTTCCTCAG
GTATGGGGAAAACCTCAAGTATCTAGCTCTAAGCTGGTGTCACCTTGGAGAAGATCCACT
GGGGATGCTGGCACCGCACATGCCGAACCTCACATATCTGAGACTAAACAACATGCACAG
TCCAAAAACTTTGGTTCTTTCTGCAGACTCCTATCCCAACCTGAAGACGCTTGTCTTAAA
GCACATGCATGATGTCAGTGAGCTAAAAATCGTTGATGGCGCTCTTCCCTGCATTGATGG
TTTGTACATTGTGTCGCTGTCGAAGCTCGATAAAGTCCCTCAAGGCATTGAGTCCCTTTG
CTCCCTTAAGAAGCTCTGGTTGCTGAGATTGCACGAAGATTTCAGAACTCAATGGGACAC
TAAAGGAATGAATCAGAAGATACAACATGTTCCAGAGGTTCGTGTTTAGATGTGGCAAGT
TGGTTCCTTTTGCAGTGTCATTCTTGTATGCTGCATCCAGTGCAACTGCAGCAGTACTTT
TAATCATTCCAATAAGTTTGCAGAATCCTGGCAGCATTTGGTCGGTACTTCTATGCCGTA
ACAAATTTATTCCTCAAAGATTGGTTGGTGTCCGTTGCCTTCCACCGGCCTCTGTACCGT
ATGTGTTTTTTGTTGACCGTGCTCTGTACCGTTTGTTATTTTAAGTTACATGCCTTGGCA
GTAATGGTATGCATTGTTAGTATCGAACATCTCCTATGATTAATCCTTTCAAACATTTCA
TTTTATATCTTGATATCTCAAAATCCATGCCACTATATCACCCCGTGATCTGATTCGCGG
AGAGTTGTCTTCATACATGGGTACACTGTCTTTTGATCCCCAAATTTCAGATCAATAATA
TTATCTATCTTGTTTTGCATTTTATTTTATTTTCAGTTGCACTTTTGTGCGTTTGACAGG
TATTTAGGTCTGCCAATTCCAAGTTTCCAACGGGGCAAAACTAGTAGCATCACCTTGGTT
CACCTGACATGCTGTGTGATACACTAGGAAAAAGGAACGCAAATTACATACTCCCTAATA
ATGATCTAAAAGGTCTTATATTTCTTTACTGAGGGAGTTGTCAAACACACATCTGATAAC
GCATGACTTCGTGACATAACAGAGATCTTGTTAGTTCAAACCGTACAGATATATTCTGTT
CGGTTGCAAATTATCTTCTCTTATCTCTTTATTCTTCTTCCTCAAGTTGTAATCTCAACT
ACCTGTATGCGCTATCAGGAACTTTCGCCCCTGCCTATAAACATGGACCACGTCCCCTGT
CCACATCATCTAGCTATCAAAGTTTTTATTAAATTGTGATCCAAATTCTATCTATTGAAC
TAGACGTAGTACAAACGGTGTGGGCCTTTGCGTTGGTACCGACGCGTACGAGTACAACTC
GTTTACTTGTCCTCCAAGGACTCTCATGTATTG