Map Locations of contig_1565588 (8811 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_1565588

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_13417 3 3873 bp MLOC_13417.3 Available Available LOC_Os02g54110.1, FRAME:+2, EVALUE:1e-97, 13102.m06192 protein expressed protein





CDS Structure of MLOC_13417






Contig Sequence (8811 bp)

>contig_1565588 8811 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCCCCCCCCCCCCCGCCCGCCGGCGCGGGCGGGGCCGCCGCGCGGGCCCCGCCCCCCCGG
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GCGGTGCCCGCGCTCCCGGCCGCCGTCGTGCGCGCCCGCGGCCGCGAGGTCGCCGACGAC
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GCTGGTCAAACTCCACATGCGATCAGTGCCGCTGTGACTGGGTTAGCTCGCTTGACCTAT
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AACTCTTATCCTTTTATTTGAGCTTGCTTGTAATTTCACTCTTCTTATTATTAGGTATTT
GAGCCTGCTAATAACTCCACTTGTTTTATTATTAGGTCAAGTCACTTGTTGAAATTCTTG
TGAAAAAATGTGGTTTAGATGCGGTGAAAGCTGTGATGCCGGAAGAACATATGAAATTGC
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GGAGGCTATGTCCATGGCCTCAGGAGCTACAAGGTATTACTGGCATGATAATGCCATAAT
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ATTCACGTCCAGGTCGAACCGAAAGCATCAAGATAAGAACTTGCAGGAAAAGTTCATTGA
TCACTCGACTGGTGAGCCCCTAGATTTACTTGACCAGAAGACAATGCGGTTGGCTCTCAA
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TGCCGTTTCTCTGGGTTTTTTCCTGAAGGAAAATTTTGACTGCTTCTCCGGTTTTGTCCT
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GTATGAGAGTGAAATAAAGTTTGGGGATGACTAGCTCATCGTACCAATTACATGTTGCGA
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GCTTTTGGTTTAGAAATGTGTCCTAACAAGGAATTCAAAAGCCTGAGGCTTTGTTCGGTT
CCACCGAAAATGAGAGGGGTTGACATGGATTGACGAGGATTAAATCCCATCTACTCCATG
TCAATCCCTCTCAATCCACTTGGAGTAGTATAAATTCCAATGTGCTCAGTGTCAATCCAC
TTGGACAGTGGATTAACCGAACAAAGCCTGAGGATGTGGATGCTCTGAAGCAAGCTGTTG
TGATGAAGATTTGTGCAACGACACATGATGCTCAAGTGGTGACTGGGAGCTGTTCTGTGC
AAGCGAAAGGCTTCGACCGATGTGCTCCTAGAGCCGTTCCCTGTCATTTTGAGTCGCTTG
ATATCTCTGGATTGTCTCGGTCCGTAGTCTTTGTGAATTGTCATGGATGTTGTGGATTTA
CTGGTGTAGCATAGCCTTTTCTTAGGTGCTAACAGTAACAGGTTTTCGTTCCATGATGTG
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CCTTCTTTTAACCACTTTGAACTGATGTATTTTCATTATGTGGACAATGCAAATGGGATT
AGCCCAGTTTGAAAAAAAAATTCCACTATCAGCCCTGCATAACCAATTGAATGCAGTAGC
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TGCGGTAGGGTGGCGGCCCCGCCGGTTGCCTGTACGTTTCGGAAAAAAAAAAAAGGTGTT
TTCTGTTTTTTTTTTGCGAGAGGCACGGTTTTACTTTCGCGAAAGGCACGG