Map Locations of contig_1565421 (9881 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_1565421

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_13347 5 3227 bp AK252548.1 Available Available None
MLOC_13348 1 799 bp None Available Available None





CDS Structure of MLOC_13347






CDS Structure of MLOC_13348






Contig Sequence (9881 bp)

>contig_1565421 9881 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GGGGGGGGGGGGGGGTTGGCGCGCACAGGGTGAAGAGGCGGTGGCGCGGTGGGTAGTGGA
GGGGGACATCGAGGGCTTGGGGAGGAGATAGGTGTGGGTGGGGAAGGAAAGGGAAAGGGG
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TAGGCTTACTGCTATTTCTTGATGATTGTATTCTTTGGTATTCTCGTCTTGGACTGTTGG
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AGAGAGAGAGAGTAGTATGGTTTCCTCAGGGAGAAATGATGCTAAGCGCATGTACCTAGG
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GGGACTGTGATGACTTTATTGCACGTGGAGGTGGTCCACCTTGTTTGATTGAGCTCCACG
CAGGGGTTTCTGATTGTTGCATAGCCAGGGCCAGGCAACACCCTGGGCCAACCCTTTGAA
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GGGGGCAACTAAGCGCCTGTAGATGCTTATTGAATATTGACAGAGGGAGGCGCCCTTGTC
GGCCTAACCTCTTCTTGAAAGTCGAGTTCTGTTAAATGCAACTGTGCTTATTTGCTTGTG
CTGTAATGGATATTTTTGTTCTTCTGCTAATTTTTGGGAGTTGTTAAGTACTTACAGGTT
TGCGATCCACATAATCTGAACATGCAAAAGTTTTATCTGCTCGAGTAGAGCATATTTTAC
TTGGGCCTTGTACTGGAATGCAGCAATTGCACCTGTTTTTGCCTCGTCTCTGGCAATTAT
TTTTTGTTCCTTTTTACCCTGTAGACCGTTTCAGGTCTCATGATTGAAACTTGACACTAC
TATTTTCCTTATATATATATATACACACACACATATACTTCTAAACTACTTGGTCTGTGC
TTATGGGATATGGAAATTAGGCTGCTTTATTTCTTGTTAATGTTGATCAGTTGGTTGAAG
AAAGTGATACATGAACTAAAATCTGGTGTTTACTTTTGTTTTAACCTTCTGATTTTGTTT
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GGAAGGGCTTTAAGATACTAGATGCAAAAGAACCATCAGCATGTGCCCATGTGTCCATGA
AACCAGAGCTTGCAAAATATATACTCCCTCCGTCCGGAAATACTTGTCCCAAAAATGAAT
ATAATGGATGTATCTATAACTAAAATAAGTCTAGATACATTCATCTCTAAGACAAGTATT
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TCCTGAATGTTGTATTGCAGTTTCCCTTCACAGCGAAATAAATGGTGTTCTTGTAACCTT
AGTATTTATTGATACCCTTCCTTTTTAGTGTCATTGAATTTGTTTTCTCCCAGTTGTTTC
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ATGTGTGTCACTTTTGATGACTAATTTACTAATCCATCGAAGTTGTGTATGGGCAGATCA
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ATGGCAAGCGGGATTACACTGGAACTGGTACTGTTCCATCCTTGCATAAGCAAGACAGCA
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AGCTAGAGCCAACTCAAACCACTAGAGGTGCTGAAGCTAAGGGCCATGAATCACTGCCAC
ATAAGATTGTGCCTGAACTGGTACGATGCACAGCATCTGGTAAGTTATGAAGTCTCATTT
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ATTAATGGATTCATTATGGACCTTTCCAGTCAGAGCTTCATTTCTTATCTTTTGGCAAAT
GTTTGTTACCATCATTTGAATCGATACCATGCTTCCATTGCACTTATTTCTCTATTACAA
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GAGAGCTGCATATCATTTCACTAAGTTGAAGGTAAGGTACAGAGGAGAACTGTGTATTGT
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TCAGGGATCGCCCCATAACGACCGGCTGACCTCAAAGTAGTATTTTAGTGGCCTTCCTAT
TCACGTCATATTAGCAGGTATATATAAACCTGAAAGCCGACCTTTATATTTCAGTTTCTT
GCTGAGCAAAAAAAAAATGTTACACAAATATTTGTGCTGGAATAAAAAGAAATGTGTTAC
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TGTTGTTTGGTGCATATTTCAGTATTTAACGTGTTAATGTTGTGTCTTCTTCTGGAATGA
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ATTATGGGACGGAGGGAGTAGTATACAACAACCAATGCACTTGTAGCACTGCAGAGAGAA
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CTTAGATTTGAAGCACGGAGCCATGGCCGTATTTTGAATTTAGAAGTTATGATGATCGAG
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CCCCCTGTTGGTTATCTAGTTAAGCCTATGTCTAATTAATCCAATTAGTCCACAGGCCCA
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ATGTTCTCCAAAGGGTGGCCTGATTTGGTGGGGCAGGGACCGGTGCGTCCAGCATAACCA
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AGTGGTAACACTTTTAATTCTGTTACCATTTCTGGAGTACGGGAACAGAAAGTTGATTTT
CAGCTGAACAGCACTCGCGACCTGGCTGGAGCGCAGGATTAACGTTTTACGCTCATGTTT
GCTTTAGCGTTGCCGTGTACATATACATGTGATTAATGGTTTTGCTCCGTTTGATGATTC
ATTATGGATAACAAGTTGCTGTACAACGTGCCATTCTCTGCTTTCATACAACATCTGATA
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GGGTTGCTAAAGCAGAAGCGCATTTCTGATGCGAAGAGAATTGACAAGAAGAATGCTAGG
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TGCCAGATCGTGGATGTAGATTTATAAGATAGTTATTATTCTATGACGTTCACATTTTCT
CAGTAAATTGATCCTTTTAATTTTGTTACTTGTTTAGTTCTGAGATCTCTGTTTTGTTTC
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GCAATGCTGCCTAAATGCATCTTTGGCCATCATGGTATTATGAATATCTAAGTATGAGAT
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CTTTGTAGAATGCATCATCAATTTTAGAACAGATGTAGTGCCGGGTTTTGTTATGGCTGT
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TCTTTGTTTTTGTATCGTATTTATCTATTTGGTGACAGTTATTTATTAAATATGTTCCAA
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ATTAGAACACACATGACCACCAGTGACTTTTGCATCATAAGGTCTTCTCAATTTCATCTG
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TTATATTTATGAATAACCTTTAGGATGATTAATATGGTATTGTAATTTTAGGCCTCTTAT
TGTTGATCACGTATTCTTGCATGTCACCTTACAGTGTTTATCTGTTCATTCAGGGGCACA
TGGCCTTAAATCTGATATCCGTGACATCACGAATCACATTGAGAACCTGACATTGAGTGA
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TCGGTACAGCTGAGAGCTCATCGGGCTCACGGAATAGTGACCCAGGTCGCAGCGGAAACC
ATTCTAGCAAGAAAGCGGCAGATAGGAAGAACGATTCTGCGTGCATGAGCAACCCAGGGA
AAGGGCCTATTAGGTGGCCTGTTCCTGTTGAAGATGCCGCATCTCCTGTCAGACCCCCCG
AGAAGGGCCTTATGCTTGATATGAGACAAAACCACGGCAATGCCGCGAGGCATCCGATTC
ATGTATCGTCTCAGGCCCGGCTTGAGAAGGAATACGAAAGCCAGCAGAAACTGAGGAAAG
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GAATTGTACATTATTCATGTTGAAAATCATAGAGGCGATATATTTGTCTGGGGATGGCAT
TGCGTAAACCAGGCAACTGTTTCATAAGAGGTAACAACATAACATTGGGAGATGCGTTCA
TTTAGGTGGCGGATGTATTTATTGGGCATTTGTTGGTGGAATTGGTGTAACAAGTGTAGC
TTGTCTTCTTTTTATTTGCCATCTTATCGCATGTGTCTCACTGTCTTAGTATCTTCTGTT
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AAAAAACACATATTATGGGACGGAGGGTGTAATTTAGATTCAGTTATGTCAGCGGGAGTG
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AGATTCTTACCACCCCTATGCATTTGTACGGGCTGGCTCACCAGAACTGGTGTCGTGACC
CCTCGCTGCAAATAGATACTGACAAAGTCGGTCAACCCATTGGCACTTATGAAGCTGGGA
ATACAAATGAGGGTCAACATTTTCGTTTTTGTTCCGTCGAATTTCTGACACTCAACATGT
TCCTTTCTAGAAAAAGTCATACATGGTCAATTACTTACAAATCAATTATCTTTTTAGCTA
TAATGTAGCGACCCGACTCAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGGAT
CAGTATGCTGGCACCCACAATACATCAATGTATATATCAAA