Contig Data
morexGenes
Links



Map Locations of contig_1565217 (3465 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_1565217

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_13251 3 2209 bp MLOC_13251.3 Available Available LOC_Os12g07450.3, FRAME:+2, EVALUE:9e-74, 13112.m00779 protein WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed





CDS Structure of MLOC_13251






Contig Sequence (3465 bp)

>contig_1565217 3465 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CTAATACTAATACTTCCTAACACATACCAGTAAGCTCACCATATACATTGTACAGTAAAT
ATTGGGATCTGGTCGGTAGTTCCGTTAACCTATGATTTTTGGTATCTTGCAAATGATTCT
CTCATAATATTGGGTACATGAGTTTACATCAGGCCATTGGGCTTGTTTCTCCCTGCAGAA
TCTGTGACAATGAATATTGTTGAATATATTTTAAGGAAAATTAGGTGGTGCCCAGGGGAG
CCTACATCCAGAATAGAGAAAGTGTACAATGTAATGTTCCAAGAAACTCACAAAGTTTAT
GGATGTAGTAGGCAAAACAAATATGTAAATCTGTAGAATTTTATTTTCTTAATTAGTCCC
CAGTGTCGAAACTAAAAGAACTAGCAGTCAATCACGCGCTTCCATGATTTTTAATGTGTT
TGTTTGACCATTTTATTATGTATTTTATGGGTTTATGCTTGTTGGGACGGCAGATCCCTA
TACTAAATTGCTGCTCTTATTTGAAAAACATTACAGAGTAACCCAATTGCCAGGTGGCAT
GTTTGTCATGGTTCAATCAATGCAATTTCCTTTTCTCCAGATGGGGCATACTTGGCGACG
GTTGGGCGAGATGGTACTTCCTTTATCCTAGACCCACACTAGAGAAGTTTTTACTCCTCA
GAAAGTCCACCATTCTACATTTCAGGCTGAACTAATATCAATGAACCATATGTAGGTTAT
TTGAGAGTGTTTGACTTTTCAAAGGAACAGCTAATATTTGGTGGCAAAAGTTATTATGGC
GCTCTCTTGTGTTGCACCTGGAGGTACCTTTATTACAATTTGAGTGATTCGATGTCTTCT
GTATGTGTTTGCCATGTTTTCTCCCGGTTAGTTTTATGGTTGGCTGCCCTGCAAGTAATT
CTTAGCCATACTTATGCAGTTTACTCTATGGATTTTGTATGCTGATGTTTGTGTGGAATG
CTTTTCTATTTATTACTCTTAGTTTAAAGTACTTCAAACTCTAAAACCTGCCTGGGTTTA
CTAGCATCCAAATTGTTGTAGTTTCCTTGATGATATCGAATAAAGGTAGCATATGGAGTA
ATTCGCTTCTGAGCACGGGCTCAGATGCTCCCGCTGACGAAAAAAATAAAAAGAAATACT
AAAAAATTCCAAAAAAATCTTATGGGTTCTATTGTGTATGCAGTGAGCTATGCATTGAAG
CGTCACTCTACCATCTTATGGGTTCTCTGATCTCTGATTCCTATATTCTATTTGTTCTCA
CATTTCTATGGGTTTGTCAATTATGAATATTTATTTCGGTGTATCAGTCGAGAATAATGA
AGAAATGAGTATGGCCTAGTTTCTGACCTAGTTTGACTGGTCTGCTTTTACAGCTCGGAT
GGCAAATATCTATTGACAGGTGGCGAAGATGATCTTGTGCAGGTATGGAGCATGGACGAC
AGGAAGACTGTTGCATGGGGTGAAGGGCATAATTCTTGGGTATTAATTCAATTTCCCTTG
AGGCCTTTTCAATGTCTTAACGTTTGCTTTCAGAAGTTGTAATTTGAAGACATGAGTAAT
TTTTTGGTAAACAGGTTAGTGGAGTTGCTTTTGATCCATATTGGTCCCCACCAAATTCTG
ATGGAACGGGAGAAAATGCGGTGTATCGTTTTGGTTCCGTTGGTCAGGTATCTGAAGTTG
ATTCTGTTGAATTATAGCTTCACCTTTTATGGCATATCCATGAAAAATATGTACTACCAC
CGTACCAAAATATAAGACGTTTTTCTAGTCTAGTTTAGTGTACAAAAAACGGTATTTTGG
TACGGACAGAGTATTAGTCATCTTTAATAAGACTAGGTAATTGTCTGTGCTTTGCAACAG
GGTCAAGCATATTCTAGTTGTTTAACACTAATCGTTCTTATCATATACCTTTAGAGAACA
TCAGGGGAATTGTCTGTGCTTTGCAATGGGGGCTAGCATATTCTAGTTGCTTAACACTAA
TCGTGTCTAACGTATACCTTTAGGAAACATCAGTGAGTATTGTTGATTTTTTTTACATTA
AATCACTTCTGCCACCACCACTGTTTACCTTTTTAATGTTAAATCACTCCTTCCTCCACT
GGTTAAATCACCTCTGTGCCTTCTTGATTGAAGCTCGACACCTCTGTCCAGACTCCCTGT
AGAGATGGGCATGAATCATATGTTCAAACTCCTTTTAGATACATGCACAAATCGTAGGTA
TGGGAAAGTACAATGACATTGTAAGGGCATCTCTAGTAGACCCCTATCCTAGAAGTGTCA
AATCTTCTCCATATCCCATTTCCCTATTTTTTTTATAGGGAAATCACTGTTTCCCAACTA
GCAAATTCCCTATAACTTCTTCCCTTGTATGTGTGTTTGGATCACACAATTCAACAAACA
CATACGCTACACATCCACATAATCTTGTGGCACGGCAAGAACCAACAAATTAATATTGTA
TGTACATGTCAAGCATGCTGCTGCTCACCTTATTTGTAGCTTCGCTTTATTACGGTAGAT
TTAAGTATCAGCTCTGCATTATGTGCGATGGCATTTGTCAACGCCACATGCATGTCAATC
TTTTCCCCAAGTTGCCTCTGCAAATTCCTGTCATGTGGTATTTAACCACATATGAGAATA
GTAGATCCCATTTTTAATGAAGTTACGCGTACATGTATAAATGCAAGCATAAGCAGTCTA
TTCAGAGGAATCGTTCCAAAAACAATTTTCAAACCAAGCACTAGAGCGCAAGTGTCACAA
CTCACAAACCAAATGAAAGCATATTTATTTAAAGTGCGAATAACAGCAGTAGAAACGTCA
AAACCGTAGAGATGATGAAGCAATTAAGAAAGGCACTCATCTCCTGCTATTGAGCAGCGG
TGGAGGGGCCTCCATAATGCTAGGGTTAGGGTTCCGCTTCGATCAAAGATGGGTTTGTGC
TCCTATGCTGTGGGATGTCAGGGGATCAAGAAAACCAGGGACGGGAGAGGGAGTACGGAC
GTAGGAAAAAACATGTTGGAGGGGCAGTGCGGTCGACGTGGGGAGTTGGATGACGTAAGA
TGGGAGACGGAGCCTTGCATCTTTTTAGGTAGTAGAGATAAACCGATGCATGCCTGTCTG
ATCTTTGTAACTTAATACAAATAAGAGTAATCTGGGGGTACCTTAAAATACTTAACTTCT
CAATTTCTTCCCCGCCTACTAAATTACTGAGAGATCTTCAGTTAATGAACTGTTTGAATG
TTCCTTGCTGTTCAGTCTCATGCTTACCGCAGGGCATTGAACTGAATATGCAAATTTCTC
CAGAAATTACACTGCTCATGCTGCTTTTTCCTTTGTGTGATTTCACCAATATTTTCGATG
CATGAACTTAACTATTGAGTCGTTTTACCTCATCATGTTTTTATTTAGAAGATCTGTTAT
GACCGGTACAACGTACCAACGGAGGAGGCCCAATGGGCAGGGTTA