Map Locations of contig_1565208 (6204 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map locationNo map location




Predicted Genes from contig_1565208

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_13246 3 1582 bp MLOC_13246.1 Available Available LOC_Os06g04820.1, FRAME:+2, EVALUE:1e-178, 13106.m00446 protein leucine carboxyl methyltransferase 1, putative, expressed
MLOC_13247 1 187 bp MLOC_13247.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_13246






CDS Structure of MLOC_13247






Contig Sequence (6204 bp)

>contig_1565208 6204 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCCCGCCGCATCTCCCCGCCTCATTTTCCACTGCTTCCCAGCTCGTGTGTGTGTGTGTCC
TCCGTTGTTGTAGCAGCGGGCGGCTGTGATTCATGGAAATCGTTTCAGCCAGGGTTCCAT
ATGAAATCTGCTCTTAGCTTATCTGTCCCCCAATTCCCATTTTGTCCGCCCCCGTTCTGC
AAGGGATTAAACAGAGCGACAGAAATGCCATTATGCAAGTAAAACTCTGTTTGTGCTGTA
GATCACTATTGGTTGAGTTAACTGATGACCTGAACTGGGGTTCGCGCATAGTGGACAACA
TTGTAGGCTGCAGACTTGGGGTTAAACTTATGTTTGCTGTGTGACATAATCATCCTCATT
CGCAGGTCCTGCGTTACCAAAGGATACATGAAGGATGACTACGTGCACCACTTTGTTAGG
AGGACGACAAAGAGAGCGCCCATAATCAATCGTGGTAAGTAGTTTATTACGATTTTTAAT
ACAGTTCTCTGAAAACTGTGTGAAAATCCTTAATTTTCTTTTGTTCAAAATGACTTTGCA
AAGGCTACTATGCCCGCTGGTCTGTTCTCAGGAAGCTTATGCTCCAGTTCCTAAGTGCTG
GGAATGGCAGTAATGATCAGAAGAAGAAACAGATATTATCTCTTGGCGCTGGCTTTGACA
CGACATTTTTCCAGTTGCAGGTTAGTTTTCAACTCCATCCTTCATGTACATTACAAGTTC
ATGCTTACCGCCCATTTCCTGACCCATTTAATATGCCTCGACAAAACATTTAAGTTAAAC
CTAAACCCGATGTGCTTCATTTTCATTAACTAGCTGACAACGTTCCGGTATTCCCATGGA
TGAACTGTTTTGTGTTTTGGTTGGAGGAAGTGGTGAAGGTCAAACTACATGAATTGTGTT
GATGCTTTTATAATATTGATTTACCCATTTCTTTTTCTGCTCTGTATTTGTATAGGATGA
AGGGCTTGCTCCATACCTTTATGTAGAGCTGGATTTTCAGGAGGTATGGAAAATGTTTTG
CTTTATGCATTCAAGTGTATCTTACTACTTCACACAGTATCATTTCTGGGTTAAGATTCA
CTATGCTGGTCAATATATCGTGTCTTCCTTCCAAATACCAGCTACTTATCTTTGTACAAG
CAAGTAATATCTGGCAACTTCCGACGTTTGGCAGGTAACCAGCAAAAAGGCTGCCATCAT
CAACCACTATAATGACATGAAGGAAAAATTAGGACCTGATGCTTCAATTTCAATTGGTAG
TCCACTCATTACTCTAAATTTTAATGTCTGCTGCCTGCCTGGCCCTATTTGCATCTAAGA
ACATTCCTAATTGTGCCACAATTTCCGCATCATGTGTTTGGTTCTGGTCATAGTTGTAGC
TTGCTACTCTTAATTTCTATATGGCTCATATGTCACTGACACAATCATTTACCAACCTTT
CCATACTTGTGGCTTCAATTTTGTTGGTCACATTCTCTACACACTGCCTGGGCTTAGCCG
TGGCATATTAATCTTGAACCAAACATGTTCTAAACTTGTCCACTCATGCCACTACAATTC
CTTTTTATGTATATCTTGTGTGCATGTTATCTTGGGTGATGTATCTTTTGCAGAAATATA
ATGTTGTTAACAACAAGCAAGAATGATTTTTGTTTTGTTTTGTACTCCCTCCGTTCCTAA
GTTTTGGCAGTTCAATTTGAACTACCAAAACGTCATATATTTGAACTACCAAAACGTCAT
ATATTTAGGAATGGAGGGAGTAGTCAATACCAGATTTGATAGTTTTGAATTTTTTGGTTT
ATTTATCCAGGTTTCTTTCAAATTCGGCAGTACCGTTGGTTATAACATGATATGTGTTGG
CTTATAGTGAGTTAGTTTTATGGTAGGAAGCATGGCCTGTTGGTTATTGTAGTAGAAAGT
TTCTGTTATACTTCCATCTTCCATTCTGTCTGGAAGAAAAATTTCCTTTGTTAGAACTTC
AACGGAAAATGTATCAGTCTTAGTTCTAACAATTGTAAGTTCAACTGTTGAAGTGGTCAT
TCCTTGTCGCTGAATTTGGCATTTATCCATTCTCCATGTGCCTGCACAATAATTGACAGT
GGCCGAATATATTTCAGAAAAAGGCGAAGTGACGAGTACAAATTACAAGCTATTTTCTGC
TGATATTCGTGATATACCGAAGCTAGATGCAGTTATTCGCATGGCTGAAATGGACCCTAG
GTATGTTATATGCATCCTATGTTTTCTTCCTTTTTTATTCCCTTTATGCTGTTCGAAGTG
GCCACGTTCTGTTAGCTCAATCAAATTTTCTACCCTGCATGATGCTCACATGTTATAACT
AAATTTATGTCATGTTTATATTAATGTACAGTCGTAATGTCACATCAGCTGAAAAAGTGG
GTTTCCTATTGTTGTTTATTGAACATGTCTTGGTTCACTTTTGGATTAGCTTGGATGAGA
ATCTATTTTATCTTCTAATGAAATTTTGATTGGCTTGAGGTTATGCTGCAGAGTTATTTC
CATTCTTGACTTGAATCATAAGCCAGCTTTTCAAGCTTTTGATAAATCTTTCTGTTGTCA
TCAGCTTGCCGACCTTTATAATTGCAGAGTGTGTTCTGATTTACTTAGATCCAACTTCAA
CCGATGCTATTGTTAGTTGGGCATCCGAAAAGTTCTCCAGTGCAATTTTTTTCTTATATG
AGCAGGTTGAACAATTCTCTCATTGATGTACTCTTTTGCACGCTTATATTTTATAGCTTT
TGGCACTGTTGACTCGTATGTTGATGCAGATCCATCCAGATGATGCATTTGGGGAGCAAA
TGATTAGGAATCTTGAGGTACCTTTTTTACCTGTGCTTCACACTTCCATTGTGGTGCATG
AACCATCCGTCTTGAGGAATGATTGAAAATTTTGGTATATTGTTTTATGTAGGAAATATA
TGCTTGAATACCATTTCTATTTCTATGATAAAGTTCAGCTAATTTGATGACACCAAAGAA
ATAGCTTGACTACAGTTATGTGCTTCCAGTGATCAAGAGACCTCCTTTTTGTTAATAAGA
GGAACATATATCTTATAATAAGAAATATCATATCGGTTAGTTAGTATCTAGACACTGAAC
GAGGTCTGCAACTGAGTGTGGAAGTAGTCAGGTACATTATTTAGGGTTCTCACTTGAACA
AATGTAAGTTGTGGCCTTTGTTTATCATGGACTATTTCTGTGATTCATTCACCATAACCT
ATGTAATGGCTTTTTAAAACTATGGAAAGACTGGCCGGTAGCTGTATGGCAATTAAAGGA
GAGAGCATATGGTGTTATTGTATCCATAACTGAAGAATGAGAAGGCAAACTAAAATTGCA
ACATGATGGGAACTGTTCGTTTAAAGTCAATTGCCATGTTGGTGTGTACGGTCAAATATA
TGAATCTATTTGCTATAGTATCTCGATTGACGGAGCACATCTTACTCGTATAAATGAAAA
TAGATGGTACTCTTGCTGTTGGGTAGCACCTGTTATTTTCTCTGCTGTGCATATATATAT
TGATCACTGGGGTATCTGCCACTTCATCTGTAGCATTGATGCATAATTTAACTCTTTTTG
TTGTTCTACTAATGCAGAGTAGAGGATGCCCTCTCCTTGGCATAAATGCTACACCAACAT
TAAGTCATAAGGAGAAACTTTTTCTTAATCATGGATGGAAGGTGTACATTTGATTAACAC
TAAAACTTTAATATTGCTAGTCTTTATGGGGATCTTACGATTGATTTTTCAGAGAGCTGT
TGCATGGGATATGCTGAAAATATATAATGATTTCATTGATGGTGGAGAAAGGCGTAGGTA
ATGTTTCTGGTAGTCTCTGAAAAATAAATTTATTGCTCCATAGCGTTTCACATATGATAC
TGACAGAGGGGTTAAGTTCCGGTTTATGTGACTTTGCACTTGCTTTGTTTTGTTGCCGCC
ATAACTGATGGAACTGAATGGTTGTAGGATTGAGCGGCTAGAATTGTTTGATGAGTTTGA
AGAGTGGCATATGATGCAGGTAATGTACTATCAGTCTTTGAGGAATCCCGTTTCCCATAC
AAATATCATTGCTAATGTATGTGCTCTTCTGATCTCTTGTGGGTAACATTTTCTGTTTCC
AGGAACACTATTGTGTTGCGTATGGGATAAATGACACCGAGGTTAGCATTTCACCCTTTC
AGCAACCAACCGCTGTACCTAAACTGGAAAATGCCCACAGGCATACTTGTCGATCTTGGA
ATATACGTTTTATAGATCCGGTTCAAGGAGTAGCACTCCTCCGCTTTAGCAGCAAGGCTC
GAACTGCATTCGAGAGGACTAACAGCTCAGTCTTCAACTTTTAGGGGATATTCGATGATT
TTGGGTTCAAGGAGTAGCACTCCTCCGCTTTAGCAGCAGGCGGGCAGGCATCAGAAGCAT
GCGAATGCAAGGCGATTCGAACTGGAGAAGCCCCACAGGAACTTGTACTTGGACTGCGAT
ACCTTTTTCGGTTTACAAGGAATGATGGCTGTAACATAACATTGTACTCCCTCTGTAAAG
AGTACATATTATCTGCAAACCCATCAACTTTTTCTGGTAACTTAGTGGCACGCCTCGCTT
CATAATCTGTTCAATGACCGTTGTCAGTAGCTGGATGCTGTTGTTAGTCTGATTATTATG
TGAGAAAAATGATGACACATGATGTGTGGCATACTGGCATGTGTTTGGTGCTGTGGAGCC
TGGCTAGGCCTCGAATATCCCGAATAGAGGACGGGTTACATGAAGCCCGTTTAGCGTGTT
TCTTTTGCACACACCTGTAAAAAAATACACACCTCTGGCCGTTGGTTTCGTTTCTGACTG
AAAATCACTTATGACCGGTATAATACACCTGTAAATTTGACACCTTTGTATTACAATACA
CCGCATCCAAGCACGGCCTAAAACAACATATTTCCACAGCCCAAAAAAAGTTAAAAAAAA
TATACATATAGAAATACATGTATAACACGTTCTAGAAAAGTTGGCATAGACAAAAAAAGA
TAAATATGTTCATGGTAATAGGCCAGTTTTTTTTATTCTTGGGCGGGATTTTGTTCCTTT
TGCACAGCTTGCAAATCATAATATTTTCGAATGGAATTTTACAGATCCGTCATGAATATA
TATAAGTTTTCACACGATTTGTTTTGATTTTTTTTAAACTTAAAAATATCAATTTTGATT
TTTTTTTTGGAAAACAGGCTCCAAGAAGCCCGTCCTCCAAAAAGTCCCTTGCCTGGATGA
TGGGAACCAAGTGGGGAAGAGGCAGAGATAATATTGTGCCAAAGGCAGCTATAGGGTCCT
AAGTTTGTTAGAACATCTCCAAGAAATGATGTAGATGTAAAATAACTAAACTTTACATCA
CGAATGCACTAAAACAGTGTGTTCAAAAGATGATGTAACAAAAATTACATGAAATATTTG
TAGTAGATGCATTTGGTGATGCAATTTTGCATCACCTGATGCATCAGTAAAAATGTAGCC
GGCCACATGAACACCCCTACCGATTGAAACTTCATTCTCCCCATTCCGTGTGACAGCAGC
GCGACCTCTTGTCGTCGCCGTCGCCGTCGTTACCAAAACCCACCTGTTGCACTGTCCATC
CCATCCCCTTTGCCGTCGGATTCGTCACTTCCTCATCGCCAAATCAGACGAATCGGCCGC
CGCAAAGCCACTCCGTCGCCGCTGCAGCGTCCGAATTTGCTGTCATCCCGTCTTAGCTGA
AATGATATATTATACTCATTTCGTTCCTAAATATAAATTTTCTTTTAATTTTTAACTATA
AATTACATATGAATATATATAAACATATTTTTAAATATAAATTTATTATTTTATTTCGTA
TGTATGTAGTTTATAATGATTAGGGGCCGTATGCATTGTGTTGATGCAGAGGCCGGAGAT
AACCCTCCTTCTTTAAAAAAAAAATGTACGTAGTTTATAATGAAATGTGTGGAAAGACTT
GTATTTAGCGATCGAGGGAGAAGAGGAAAACGCTGAAGAGAGGTTGGTTGTCCTTTCCTT
TGTAGCCGGACTGGAACATAACGCCTACCCGCTGAGCCGCACCGCGACCTGACTCCGACC
CCCCGACGCGTCTCGCATCCTCTCCCCTTTCTTTCTTGAGGCCAAAGCCGCAGACACACA
CGCCGTCGCCGCTCCCCATCCCGT