Map Locations of contig_1564930 (8339 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_1564930

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_13146 4 1688 bp MLOC_13146.1 Available Available LOC_Os11g06390.6, FRAME:+3, EVALUE:0.0, 13111.m00643 protein actin, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_13146






Contig Sequence (8339 bp)

>contig_1564930 8339 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TACATATGTAGGGTGAACTTGACTAGTCATAATTCCTAAAACTAGCCGACAACTAAAATT
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GGGCGAGTAGTCTTCCGAGTATGCATATGGCATGGGAGGTGACAGGACCTTGTGTTCCAC
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AGGCGGGCAGGTTCCCCTAGATCCCCGGGTAAGCACGTTCGGCCATCCTCGCAGCAGTTC
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TTCTTGCATGTGCTGTTCTTGCTTTGCCTTTTTTTTTTCCTGCCCCGGAGTGCAACAGTC
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TTTGAGACCTTTAATGTTCCAGCCATGTATGTGGCCATCCAGGCAGTGCTTTCCCTATAT
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TGATGGTGTCAGCCATACTGTGCCAATCTATGAAGGATATGCCCTTCCACATGCCATCCT
TCGTCTTGACCTCGCTGGGCGTGACCTAACTGACTGTTTGATGAAGATTCTTACGGAGAG
AGGTTACTCCTTCACCACGACTGCCGAACGGGAAATTGTAAGGGATATTAAGGAGAAGCT
CGCATATGTGGCTCTTGACTATGAACAAGAGCTGGAAAATGCCAAGAGCAGCTCCTCTGT
GGAGAAGAGCTATGAGCTGCCTGATGGGCAGGTGATCACCATTGGGGCAGAGAGGTTCCG
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GACCACCTACAACTCTATCATGAAGTGTGATGTGGATATCAGGAAGGACCTGTATGGTAA
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GATCACTGCCCTTGCACCAAGCAGCATGAAGATCAAGGTGGTGGCACCGCCTGAGAGGAA
GTACAGTGTCTGGATTGGAGGGTCGATTCTTGCCTCACTTAGTACCTTCCAACAGGTGAA
TCTTGCACCTTTCTTTTCCTTCAATTAAACATCGATCATACATGCTTATATCATCGCAGT
GGTTACAGTAAATATACTCCCTGTTTGCCATACTAACCATGCTTTCTGATTTTTATGTTA
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TGCTTCTAAGTTGCGAGTTGTCTGGGTCTTCTGAATCTATTCTGGCTGTTCTTTTCTCAA
GTCCTTGCCATGTAAGCTACTATGTTTGAGATTGCTGGGATTCTGTTGACTGTATTGCCG
GATTAATTTGTTGGATCAAGATTGCGTACCTTGTAGACTCGTAATATGTTCAGTGGGCTG
CTATATTTGATCGGTGCTGAATCATATGTCGCATGTTCCTGGGTTTTTTTCATGCCAAAA
GGTTTGGTGCTAGCGTGGGGGGAGTGTCAAAATATCTACCAGAGTCTTTGTAAGAGTTTT
TTGTGTGAGCCCCATAATCATTTCCTTGTGTACATTCACTTCTGCGATATGTGATCTTTT
GGGTTGCGAATTTGGTTCATGAATGTCGGCCCCTAGTACTTGCTCAAACGTCCTCCATTA
TTAGCGGATCTGCCCTTCCCGCTGTTTGCTGTCTAATGATCAATGCCAAATCATTCTGCT
GCTTTGGTTGATTATATGGTACAGAAAACATGGCACGTTGGTGCTGCAGTTCACTGAATG
CATGATCAAGTCAGGAACATGATCATGTACAACCATTCATTGTCATGTGCAACCATTCAT
TGCTTCATGTGGTTTGGCCCTTTGTGTTTCACGTGTGCAGAATTGGATCTCAGCTTTGTG
CTCTTCTTTTCTACTTCTTGTGGTTCACATTTACAGTTTTTCTTATGCTGCCTTTTCTTG
TTTTTGTGTGTGGATGGAGAATGAAACAAATTCAGGTGCACTTGGCTGGCTGATGCTGCT
TTTGTGATTTGTGGTGCTGCTGTGCTCTGAATTGCACACCAGTGAATCCAACTATGGATA
TGTGGATCAGTTGAAGCTGGATTGCGAATTGCGATCTGTGGAGGAAAGAATCCTTTTTTC
CTTTTTTTTTTGAGAAACTAATCCTTTTTTCCTAGTCCTAAAAGAAAGAATCCTTACTTG
GTTGGGCAGTTTGTGTGGTGTGGCTGGCTCCTCTTGTTCTTTTGGATCAAATCATCGACG
TGTGGCTTCTACTTATCCCGGCCCATCGAAACAATGGCTGACAGTTGGTTTGAGGTCAAA
TTCAGGTTTGGGCGGTGGGTCAGTAATATAGCGCATGTAAAACATTTCTGTATCTATCCA
CTTGTACTTATACTCCGCCCTTAAAAAAGATATCTACTCTTATAGTTTTTCTTAATAAAA
TGGACATAAGGATTCATCTGGGTCAAAAATAAAAATAAAAAAAATAACCCCACTTCTTTG
TCCATCCTCCCGACCTCCATCGATTTTTGTTGGTTTTAGACCTCCTGCTGCTTTTCATAG
ATCGATCTTGAGAGGAAAATATCATTTCCTAAGCTCTATGTGTGATTGATACTTTTATTT
TGAAAAAAAATACAATTATGCTCTGTAGCATGTACACTTGCAGGACACGAGCACTCTCCC
CACCATGCTTTTGCTTGGAAGCGTCTCTTCCGCGTTGGTCAGCGCGTCTCATAGTTCGGA
TATGAACTACTCACGCATTAAAGGAAGATTCACGCATCAAAGGAGGATCACCAATGAGGA
TGATGAACCCCTGTGTGACCATGTCCCCTTCCGACAAGGTGCCGAAACGGGCTCCAGATT
GGATCTCATGGGTTCTGGAACTTGCGGTGGCTGAGACAATTTTTCGCCAGCTCCTCTATG
ATTTGTGGAATATTGTGGTATTTATAGAGCTCAGAGACGATGGAGGAGGTGCCCGAGGG