Map Locations of contig_1564856 (7690 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_1564856

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_13122 3 1717 bp AK252037.1 Available Available None
MLOC_13123 1 231 bp None Available Available None





CDS Structure of MLOC_13122






CDS Structure of MLOC_13123






Contig Sequence (7690 bp)

>contig_1564856 7690 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCCGCCGCAGCGCCAGATCTCGACCGCCGCGTGTTTGGCAACACTAGAGCAAGTTTGCTA
CGGGATTAGGCATGCATGGGAGGTTGATTTCTACTAGTCCTAAACCCATGTCCGGTGCGC
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TCTCCATCGCGACCTGTCCGGAGATTACGGTGTGGAAGGCCCGTCGGGAAGGGGTGCGCA
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GGCCCCAGGGGCGGGTCTCGGCTAGGGCGGTGTATGCCCTGCACCACCTCGGCGGCGTGG
GGACCGAGACTGCCACCTTCCTGTGATCGAACCGGGCACCCTCGTGTGTCAAGTTCTTCG
GGTGGCTGCTGACCTTGTCGCACATTCACACGTGTGATGTACTCCTCCACAAGACCAACC
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GCGCCTCGCTTAGTACCCTTCACCTTTTCAATGTTGCGCGCGCGGTTGGTGGTGCCTCTC
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CGCATGAGTGATCTCTGGGGCCAAGGTGCATCTTAGTTGATTCTATTTTATTTTTTTGCA
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GGGTTTACCCTACTACTATTATATTCGACCAATTGGGGAAGTCCGGCGGCTGCCAGAAAT
ATACAAGCGGAGGAGAGACGATGGCAACGGGGCGGCGCGCGTGCTCGGCCTCCGTCTTTG
CCCAGGAAAAAACCAGTCAGCGGAAGAGGACACGGCTGACGGCCTCCTCCACCATCACCG
CCGCCGCCGCCGCACTTCGTGTAGCTCTTCCTCTTCCTCCTCAGGTACTCCTCTGACCTT
CTCCTCCACCATTCCGCCGCAGCGCCAGATCTCGACCCTGCGCGTGTTTGGCAATATCAG
AGGAAGCGGATTAGGCATGGGATGGGAGGTTGACTTTTAGTCCTGAACCCATGTTCGTGT
TTGCAAGTTCATTACATAGTTTGATGATCTCCTGATCCCACATACAGTACGAAATTGCTC
CGCCGCGCCCGTTAATATGCTTTCGGTCTCGGCAGCTCAGTGCTTCTCTCGGTCCGATGG
GAATCACCGCGTTTAGTCTAGCTAATACTGCTATAACACTGGATCATCAACATTCCTACC
ACGTGAAAATGTTCCATCTCAACGTGCTATTACATATATATACATGTCATTCTGTAAAGC
ATGTCTGATTACATTATCTCTACCCGTCGGTCTAGTTCGCCGATGGATGATTTTTTTAGA
AAAGGAGGCATCGCCCCGACCTCTGCATCGAGCGATGCATGCAGCCTATTTATTAATAAA
TGAGTCCTCAACCAAGTACATCAATCTGAGAAGACAAATAAAAGATACAAAGCGCCATCC
GCGCCCAACCGGTAGCGAAAGTAGACCTAGATGACTATCCACCTATCCTACTAATGTGTC
GTCATCCAAACCGGTTGAAGATATCCTGAGCTACCATCTCCCAACGGGCACACCCAGTAA
CCAAAGGCTCCCTGGTCTTCGCAGGAGTGAGTAATAACCACGTGCGGATCAAGACAGTAG
CCCTGAAGAT