Map Locations of contig_1564614 (8080 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_1564614

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_13014 2 1508 bp MLOC_13014.1 Available Available LOC_Os02g38840.2, FRAME:-2, EVALUE:0.0, 13102.m04281 protein glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase, cytoplasmic isoform, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_13014






Contig Sequence (8080 bp)

>contig_1564614 8080 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCTTTTGCAAGACCAAGCTTGATGATGGTACATTTGGAAAGG
AGAAAAGCATCAGCACATACATCTAAAAATATCGCCTGGAGCATCCTTGAACTGCACACG
TATCTCTGCTTTCTTAGAGCTTAGTGCTTTACCAGCCTTAAGGACGAAAGGAACTCCTAC
AGCACAATTATTCAAATGTCAGTACTGAAAGATAAATACGGGGATCTGAAAATTCCATGT
AGTTTATAATGCAGTTTCATTTTTTCACTACAAAACAGAAGGGTATATCAGACGACATCT
TCCAATCGTAACAAGAAACCGTATCGCACATATTTCAGGAACATGATGCAGGACTGATAA
TGTCGTAAGACTCTTTTGTCGCAAAAAGACACACAGTTCAGATGGAAAAAAATGTGGATT
CTGGATTAAGAAATATACTTATGATGTGATTTTTGAGCTTTAAAATAAATAACCAGCCAT
GGAAGAAGTACAATATACCATCCCATCTCTCATTGTGTACCCTCAGCACAACGGATGCAA
AAGTAGGTGTGTTGGATTCATTTGGCACTGTTGGATCATCCTTGTAGCCATCATATTGCC
CAAGGACTACCTCGTCATGCTTTATAGAGCTCACTGATTGCAGAACCTGACAGTGTAAGA
TGAATTTACTTCTAAGCAATAAAAACAAGGAGTTCATACTTAGGTATCACACCAAAAGTC
CAAAGGTCGATTTTCTATTAAGTAGATATAATATGGAGCATAGTATGATTTAAGGAGAAG
CAAGAACCTTGACTTTCTCATCTCGTATGTGCTCAGGACTAAGAGAGACAGGCTTTTCCA
TGGCTACCAAACAAAAGACCTGCAGATAAGATTGATAGGCATTAACCAGAGCTCTAAATT
CCTGAAAAGAGAAACAGTATCCTCTTTCGAGGAATTCTAATGTCCGACAGGTAGCTGCTC
CGCCCTGCTCGAAAGATTTAATATGAAAACTATGACGCTATAGAACGCTAATCATTCTGA
ATGACTGCAAGCAAAATATTAAGAAATTGCCACAGTAAATAATTGCTACTATAGATTCAT
ATGAGGATAATTTACCTGCAGCAAATGGTTCTGAATAATATCCCGAATGATACTGTAGCA
ATAAATTTGAGGTCAGACATTCAATTTGCTACAACAGGAATAACAACACATAATATAAAT
ACCAAACCCAGTAAGGTTTTGTCTTGCATCTGTTAACAAACATGCCAGACTAATGCACAT
GAATGGACTTTGAGTTCCAAAAAATTTTGGTGTTCTGAAAACGAATGCACCTGTTGGCCG
TATGGGCCTTTATTAGTTTAAAGCCAGACTCATGTGAGCCTTCTGTTTTAAGAAAGAAAT
GCGCAACTCGAGCATTATGAATGCACAACTGTACATGAACAAAATATTCATTATGACATT
TCGTACCATTTAAATTTACAATATATAGAAGAGATGTTTTACATCATAGTTTCAGCTTAA
AGCATATGTGCTTGAAATAAAATGCACTGAGCATACAAACTTCCTTGCAAAAGTTAAATT
TACAACATACCCATATTGATCAAAATATCCTCCACGTCCATCAGTTCCAAAGTCCTCCCG
GAATACAATCTGCGAGATAGGTTTATTACATGCAAGCACATACCGTTGTGACCATTATAA
AAATGAAATGCTCCAACTATTCTAACATGAACTTATTTAGTTTTAGACAAACGGCAAAGG
AAGGTGTATAATATTACAGATATAACCAAAATATACAAAGAAGCACAGCAAATGGAAGTG
TGCTAACAACCTAAGATTGCATATTACCTGTACGTTATCAATGTTATCACGATTCCAGAG
GGGCAGAAAGAAGCGATTTGCAAAGCGAAGCACCAGCTGCAAATAGATGACAGCATGAAA
AACTTTTACAAAAGCAGAAAAATATACACAACTAACCAATAACACACAAATTACCAAGTT
TTGGACTAACTCCTTTCCTAAATAGTGGTCAATTCTATATAGTTGTTCTTCATCGAAAAG
CTCTCCAAGTTGGGCACTCAATTCCTCAGCAGAGTCTAAATCCTTTCCGAAGGGCTTTTC
AACAATAACTCTTGTCCAACCAGTATGAGAGGCTGAAAGTAGAGCACAGTGGTTACCACA
AGTAAAGAGCATGGATCTAAAATACTTAATTAACACAGCCAAATGAATCATATACATATA
TTTTCAGTACTTTGAAGGAAGTGCGATAGTCTGCAAAGTTGACATGGAAGGGGACAGCCT
TTTTTCTTTCAAAAGTAACTCACATGGAGTCATGCAATATGATCTTATCATTTTGCATAC
TGAGGGGTAGACTGAAGGAGGTAATGCCAAATAAAATAGTCTACGGGCGTTTCCTGGTTG
GTTGTTCTCTGATGTTTCATTCTCAGAGATTGTCTTGTTTAGCAATTCAAATCCTGTCCC
ATTATCATATGAACCACTAACATATTTAATCTGCAATGAAAATTAAGCACGGTTACATAA
GTGAAATACCACACGAGGTATGCATAATATTAGCAACTCACCAATTGCAAAAATTGTGAA
AGATGTTCATCTGAAGATCCTTTGAGATATCTGTAACAATACAAGGATGACATTAACATG
CATATTTTTTTGGAACCAGCCCTTTCATCATATATAAAAATGGAGGAAACACCATCCTCA
TACAAAGCATACCAATTTATTTGTACACAAAATCATTATATTAATTCCAGAAATGTGGAC
CTTACCCACGAATGTGTTCTCTTAACCCGTCATCAGACATATCTGATCTCGCATACCCAA
ATATATGGACTTCCCCAGATTGTATAAATCCCTGTCTTATCAGAGAGCAATATTCAGCCA
ATGTGTGCCAAGCTGGGAAGACATTATGTACATGACATGCAGTACATTATACAATGATGT
TCAATTGTTTCTTTAATATAGTTATGTACAGTGTACACTTGGGTGCAAGTTATTTAACTC
AAGATAGATGCATCAACTAGTTTATCCCCTTTGAAACGGCAACTATTGCAAAGTTATGAT
AGATTACCTGTTGAAAAAGGTTAAAGAGTGCCGGGAAAGTTTTCTTTTTAGCAAGGTCCC
CAGAAGCACCTAGTACAACAATGGACAAGCAGCCAGACTCTGAAGAAAGCTCCAAGTCCT
GCAAGTCTGACAAAGAACTCGTGCTAATTCGTCCCAATGATGGTGAAGATACACCCGATC
CTCCTGACATGGTAGTCTAGTCTGTATGGTTTCTCCGTCCTTTCAAGATAACCTAAGATT
GGAGAGGTACACTTAATCTCAAGATGTATGAGCTCTTTGGTTTAAAAAAAGAAAGATGTA
TGAGCTCTTAAACAGCTACATAACTTTGATCAATGCTAAGTTACTAATCAAGCAAAATAT
CTCTTCACTGATTGACAGGTCCAAATGAGATTTTGCAACAAGAGAAAAAAAAAAGGATCC
ATCATGAAACAACTTTACTGAACCTTGCTGTTTAACCATTGGCCATCAGCAACTGAGAAT
GCAACTTTTGAAACAAGATCCCAGAGAAGTTTGCTGTAGTAGCATGTTCATGAACTGATA
ACCACAGATGTGCTTCAGGAAAAAAAAAAAACCATGGATGTACTAGGGCTGCTACGAGAT
TCTACTTCTAGTCAAGTTAAAAATACTGTCTGTGCAAGTAATTAACTGCATTGAACATGG
CTCCCCATCCCCATATGTGTCAACATAACAATTGCGACTTCAGATCTGTTGCATACACTA
AACGGCAATGTCACTTGTAGAACCTTGAAAGGGCAGGGTGTTCCTGCGTTTCATAAAGAA
AACAAAATGTAATGGCCCCTGTGTTTATGAGGAAAATCGGCCGGAAAACAGTTAAAAATC
TCTGTGTTGAGAGGAGGAAAAAGGCAAACATGATAGTTATCCTATTTGGAGAAGTTAAAA
ATCCCTGCCCCAACTCCGAATTATAGTTACGTTTTAATGTGTTTGTTCACTCATTTCAGT
CCATATGCAGTTTATACTGAAATATCCAAAACATCTTATAATTTGTGAACGGAGAGAGTA
CTAGTTAACCAGCCTAGCGGCATGTCCAAGAACAAAACATGCAAACAAAAATTGAACTGG
CGACGAGACCCATCCCGAAACGCAACGCGATCCTTCCTTCCTTGGGGCGGGAAGCAGAGC
CGGCCGGTCAATCGACCAAGGACTCAGTCCCATCAAGAGGAATCGTTGTGGTCGGCAGCT
GTGCGATCGAGAGGAGGATGAGAAAACTGACCAGTGAACACTGAAGGGACGATGCGGCTT
GACTTCGGGAGGAGGGGGGTGGTGCCGGTGGGATGGGAATATTTTGCTTTGCTTTGGGTG
GAAATTATATATGGCTTTCCTTTCTCGCCGCCGCTTTTATACTCGCATCGGCTACTCCCA
CTCCCCTTTGACCCGCTGGCTGAACCTTCCACCACATCCACATCTACGCCCTGTTCTGTT
TCTTTTTTCTTTTCCTTTTTCCGGAAAATTGCTGCTTATCCTACCTGGGCATCTTCAACT
CCAAAGCCCTCGAACGGACAACACCGATGTTATCCAAATCTATCAGCATATGTTCGGTTA
CAATTCAAACGAAATCCAATATACTTGATCAAATTTAATGCAAACTCAAACAAATTGAAC
GATATTTATTTATACTTGGATAATTTTTGGAAAAAGGTTACCTTCAGACCACCGATCACG
CTCGCTCTTCCTCCGGCTCAGCTCCGTTGGATTGTGTGTTGATCAGACGGACCACATCGT
CCCCGCTTCCGCGGCATGCGTCCGTTTTCTGAAATGAAGCCATTGTTTGAGGACAACCAT
TTATGCAAGTGAGGAAGAGTCGAGAGTGTTTTCGCAACTCGGTCTACTCGTGTTGCTCGA
AGGACGGCGTTGTTGGATCTGTGAGGACGGCGGGGGCGGCGGGCGACCGGGGCATATCCA
CCGCGGTGGCGACGGCGACATATTCGGCGATGGCCGGCATCGACTCCATCATGTATGCAT
CGGAGATCCGCTCATTCCCTTCCCCCTCATTTTTGCATGATTTGTAGGCGTTCATGGCGG
CCCTCCCCAGGGGCAGCTTCACGCTCGACGTCGACGGGTTTCAGTTATTTATGCAACACG
AGTGTTCATAGCGGTCCTCCCCAGGGCGGCTTCGCGCTCAACGTCCACAGGTTTTCGTTA
TGTGTTGGCGAGTGGTCGCCGGTGTAGGTAGTTCAGCAGCGCACTAGGAAAGTTGTCGCG
TGGTTGTAGGGTGAATGTCGGCGATGCGGTAGGTTAGGGTGTCGTCAGTGTGATAAGAAT
ATGGATTGGATGTTGCTGCAGTTTTTTTACATGTTTTGTTTGGTGATTTATTTGCTTTGC
ATACCTCATGTGAGCAGAGTTTGTGCTGCTGCAATGTTAATTCAAAGATGCAACGAGACT
TTGATGTTTCTGAATTCTGATGTGAAAGCATGTTCACATATGTAAAACTAATTCAGACAT
GTCAGTATGCACATTGACAATGAGTGCCAATGAGTAGGTTTCAATGAGTTTGTTGTTTCA
ATGAGGCTTAGGTTTTGTGTAGTTGTGCTGCTGAATTTTAATGAGTTTCAGGTTTTGATC
CCTTCCTAAATTCAGTGCTGCTGAATTTACTGAGTTGAATGTGATGTAGAGAAACCTAAA
GTTGCATGATCATAGTATTCAGCTTGCGATATTTCTGAATTTCTGGAGCTCATAGTTTTT
GGAGTTCATGGTTTATGGTGTAATGCATTACATGCATAGAAACTGAAAGATGTAGGATCC
CTTTGTGTTACTTCTAAATTTTTCCAGCAAATAGATTATGTAGCTCATTCTATCTTTTTG
TAGCTCATTTTTAGTTAGCTCATGTTCTTGCAGTTGATAGCTTATGCTTTTGTTTTTCTG
AAATTGGCTATAGAGCATTTCATGTAGCTTTTAGCAGAGGAAATTTTAGGTTTTATGTTT
TCAAAAAGGAATGCTGATAATAGCTTACGTTTTTCTGAAATTAGTTGGGCCTGCTTGAAT
TATGTCTCATGTAGCTATTTGTTTCTGAATTCTGAATCATGTTTGCATGGTTCTAGTAGT
TTTAGTACCTTCCATTTTCTTAGACCACTAGTTATGCATGCTCGTAGTTATAAAATCGTA
TTTTTCATTTTTTGTTTTGTTTTTGCAGCATGCCCATTTACCAAACTCGATGGTGGGGCA
AAGAGGTTGCGCGAGATAACGAATGACATCACAGGGAAGAAGAGGGATGTAATAAGCAAG
TCCGACCTCGGGGATTTGCTTTACATTTCTCCTTTGGTTCCTCCTCCAGAAGCGCTTCTC
GATTTCATACTTATGAGGACTGACACCAAGAAGCGTGTGCTCAAGTATGCGATCTATTTT
GTTTTTGTCATTTGTCTCCTTTTCCTATACCTGTTGCATAACATGCTTTTATCTTTTCCG
CAACATATACTAACATTTTAATTTTGTGTATTGCAGGATAAATGACAAGAAGAAGATACA
CTTTACAAGAGACATGGTTAAGAAAATATTCAATGTGCCATCTGGTAGCAGACCGCTAGA
ATTCGGCAAGAGGGTCAAAGTTGATTTCCGTGAAGTTTACTTGGACGACGAAAGGGCTCC
AATATCCACCACGGTTGTCGTTGTATTGAAGGCATATAACGACGATGAGGATGTCGTTGA
GAGGTCATGGGTTTTACTGTGCCTAGCATTGGTCCTAGATCCTGGGAAAGGAAACATGGT
TCCCCTAGAATATCTATTCACTTTTCGAGACATGATTGTGGTCCATGAGTTTGAGTTTGA
TAAGTATATTCTGTCTGATGTGATGAAAGAAGTTCAAAAAATACCAGGACAAGAGGAATG
ATAGTAGAGCGAAATTCCTGATCGGTGGATTTCTACCAATGCTTCCGGTACAACGCTTCC
ATTCCCATAATATTCCCACCTTCTTTTACCGGGACAACAACACTTCTTGTCAGAAGCTGA
TGTTTATTTCTTTTTTCTATGTGCATGTAATTTACATGGACCATCTTGATGTGCCAAGAG
GATGCTTAGTTGATCATACTATCAACTACTCGCTGCCTAGAGCTTGTTTTGTTCATGAAA
TGGACTTTTATGTTGTTGTTGCAGTTGATACTCTCGACGATGTTTTTGGGAAGCGACATG
TAAGTTACTTACACTGAATGCATCACTTTTGATATATTTGTTTTATCTAGAAGATCTTTT
TATTTATTGCAATTCTGAATTCATTTGTTTTTAATGCAGTTCAACACTAGTACACCGTAT
GCAACAACCCAGCTTATGTCATATTTAGGTCAGCTAGAAATGTGCAAGGTGGAGTCGTTG
CGGGTTCTCGAGATCCACCTCATGCTGGTAGCGGTGGGTACCAATGGCAGTGCAAAGCAT
GTGCATGTGCCTACTGCAGCTAACACTAACAGTGATGACAATGTATGCAGCTCTTTGGAG
GATTCACTTCACGCATTGCCTAAATCGATGAGTTAGAGGTGCTTAGCTTTGCAACTCTTT
TTGTTTCTGCAATGTATTCTTTTTGCTCAACTGAGATGCAACAAAGGACCCACCTAGCAA
CTAATGTATTTTCTGTTTCCATGCATTTTGCAGTTTCCCCCACATATGCAAGTCACATAC
CACAACCACAAAGATATCCACAAGTCCACCTTTCTCATTTGGGGATTTTTGCCCACACAA
GATATTGTTGAGTGTGGACATCCCTTCATGACCCTTTTCAAGTCTTTCTTAAAGGAAGTG
ACTTGGGCCTTGAGCTCTTTGATTTCCTCAACATAGTTAGTATCAACACAAGTACTAGAG
GAAGTATAAGCTTCATCGTTAGAGCAACAAGGCAATGGGAGTAATTCATCACAAGAGTAG
CAACATTATGAGTAGATGAANNNNGAGGACTAGCACATGGCAATAAAGCATTTTGACTGG
GTGTAGTGCTAATGTCCACATGAGAGCTTGTGAGCATTACATGACTTTCTTCCAATTTCC
CAAAATTGCTAGATAGCAACTCAAGTTGAGCCCTTAGCTC