Contig Data
morexGenes
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Map Locations of contig_1564340 (6233 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_1564340

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_12903 1 510 bp MLOC_12903.1 Available Available None
MLOC_12904 3 1735 bp MLOC_12904.1 Available Available LOC_Os09g29950.3, FRAME:-3, EVALUE:2e-117, 13109.m02980 protein OsPOP19 - Putative Prolyl Oligopeptidase homologue, expressed





CDS Structure of MLOC_12903






CDS Structure of MLOC_12904






Contig Sequence (6233 bp)

>contig_1564340 6233 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CAATCAAACGAGACAACACTTATTAGTACAATAACTAGATATATTGTTAATTTTAGATTG
TGTAAAGGAGANNNNNCCCAAAAGCTGTTGATCACCATCTCGTCCCTCATGTGGCACAAG
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CTCACTTTTGAAACCCACTTAGCAGCTTCCCAGACTCCTACCCTGCCAAACAAAAATGGA
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TGTATATACGGATGAGCTCAAAGATTTACCTTGAGAACTGCAGCAGAGAATAAATTTGGC
AACATATTAACGACCGCCCCAACCAGCAAACCACCAGCACTGCAGCCCATAGCACAAAGA
CGACTTTCATGCACTAAGCCTTCCTTGATAAGATGCATACCACATGCCGCAAAATCTTGA
ATTGAATTTATCTTGTTGGTTTTGGTGCCTGCTAGATGCCATGATGGATCCCCTCCACCC
CTACATGATTAGGCTAGGGAATTACAAACAATCGGGAACGTAAAATTTGTGGTGTCAATC
ATAAAATGTATTTCCTTCTAATCATGAATGGGAAGTCAAAAACAACTATCTTATCATGTT
TTCAAATTTTATTGTGGAGCATGACAGAGAATGGCAGATGGTATATCACATATTCACGCC
ACACTGAAGTTGTCAGCTCAGCCAAACTCTATCTATGTTTTTGCGGGGAAGCCGAACTCC
ATGTTGATAACCTCCAAATGGCGCTGGATGGAGAAAATGATAGAAATTTGCGACTATTAA
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CCTGCTCTACTCCAGAACAGTGAAATCAGGCAGTCCTTTCACAAGATGATGGATCAACGT
CTCAATATGATAGCAGCCTAAGACCTAATGTCTCTTTCAGGTGAAAAAAAAATAACGTTC
TGTATACTATAGTATAAAATTTGGTGAATAAAGGCATCGTGTTGCACACTTGTAGGAAGT
CTAAGTATAGGGTGCAGGTATGCTAGTCTGGTTTTTTAATAATCTAGTTCACCAAATGAA
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TAGCGATTCTATTAAAAAACTACATACGAATGTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNTTATTTTGCTTCGTATGTAGTCACGTAATGAAATTTCTTAAAGACTTATA