Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
|
|
|
Predicted Genes from contig_1564200
Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
---|
MLOC_12828 |
2 |
971 bp |
AK249530.1 |
Not available |
Available |
None |
CDS Structure of MLOC_12828
Contig Sequence (3522 bp)
>contig_1564200 3522 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
AAGATCGTGGGCAGAAGAGAGTGGAGATCGTGGGTGCGTCACGAGGATGGAGGGGATCGG
GATCTAGTGGGGCGACGGGGGTGGGAGGAGGTATCGAAGGATTAATTGCTGGTTTAATTG
TCGTTGTTTTTTGGAGGGTATTGAAAAAACCAGTGGGCGACGGGGGTGGGAGGAGGTATC
GATAGCGTGGGGATGGTCGAACCATCACGACAGCAGATCCCCTTTAATAGTAGAGATTTG
TTGAAGCACCTATGAAGACTCAAGGGCAACGTCTAGCTTGACGCGTGATGAAGTATGAGT
TTTTGTTTGTTGAACTATTTTGATTTGTATTGATCTACTGAACTATTTTTGATTTGTATT
GATTTCTGTAATAAACCAATTTACATTGAAATGGTCAATTTACACTAAAAATAGATCAAT
TTACGCTGAAAATGGACCAAAATCAATGGCAGCGGACGATCTTGGGAGCGGCTCAAAACC
CAAGCCCCACGCCGATTTTTCTGCGCCCGTCTGCCACCCACCTGCATCGTTTACCACATC
GCACATTCACACGTATCACCATTTCACCACGATCCATCGACCCAGTTCGCGAAAAAAGAA
AACGTGGGAACTGGAATATCCCCACCTCTCCTCCGAACCCCCACCATTTCTCCTCTCTGC
TCCCAAGCTCGCTCACTCGCACCAATGGCCGGTTCCCTGCTCGTCCATCTCTTCCTTCTC
ATCCTGTTCGCCCCCTCCCTCCGCGCCGCCACCAACGCCACCGCCGTGGTCTCCAGGATC
GCATTTGGTTCCTGCGCTAACCAGAGCGCGCCCCAGGTGCTCGACGGAACGCCCAGTGCA
CCGCCTGGTCTCAACTTTCTTGCCCTTGCTTGAGTGGATGGAGGTGACGGGGGTCCGTTT
GCTGTTCTTTCCTTGCAGCCCGTGTGGGAGGCGATCGTGGGGTTCGACCCGCAGGTCTTC
ATCTGGCTCGGGGACAACGTCTACGGGGACAACAAGCGCCCGTTCCGGGTGTTCGGGAGG
GAGCGGACGGTGGGGCCCTGGAGGAACGTGCCGCGGTTCTACCCGGCCACCGAGGAGGAG
CTGCGCGGGAAGTACGAGCTGGCCAAGGCCAACCCGGGGTACGCCAAGCTGAGGGAGAGG
GCTAGGGTGAGCTCCCCGTCCTTTGCTCTGTTGAATTGCTAGCTGTAGTGTAGTCAATTG
CCCGTGTATTCGGTAATCGGTTGTTAGATTTTGTTTCTTTAGGGTCGACCAGGACCAGTT
CCGTTTCTTGATGGCACCCACTGTTGTTGCTAGTGACTTCACTGACTTGTGAAATCTTGC
CTCTTTATCATATGGTTAGATAGTCCACTGTTTTGTCTGGTCTCTGTGTCTGCGAGTCCA
AAGCATGGTTTGTTGGAGCTGGGTGAGGGAGGTTTCTTGTGGTTTTGGGGTTGTGTTTGT
CTTTTATTACGAATTCATTATCATGAAATGCAGATACTATTTTGATGACACTGATTATTC
CACAGCAGCAAAGGAGTCAATTTCATGCTATCTGGAATGTTAATCTATATCTGAGCAGCG
AGCAGTAGGCCACCACAAAATTTTATGTGTTCATTTTAGTGCTCAATGCCATGTTTGCGA
ATTGGGACAGTTTTCGTATGCGTTGAGCACATGAAGATTCGTGCAACTTTGTTATCGTTT
CTTATTTTTTTTCCATTTCTTCTAGTTAATTAAGAACTTGGCATCACTATTATTCGCTAT
AATATGCAGGTCATTGGAACATGGGATGACCATGATTACGGATTGAATGATGCAGGAAAG
GAATATAGTGGAAAAGAGTTCTCCCAAAGGCTTCTATTAGATTTCTTGGATGAAGCTGAA
GACAGTTCACGGTATATATGCATGACCGCTGGAATTAATTATGAGTTATTGATCTTCTTT
TGTATGCGGTCACTGCCTTGTAAATGATGGTACTCCAGGACCCCTTTGTTTTTGCTTTAT
GATGTTTCTTGCAAATCTTTTTTTCGCAGAATATTCAAATCTTCTATGAATATTTCAGGA
TCTTCACACCTACAGTTGCTGGCCATCAGAAATCTCACAGTACTCTCTCTCTTGTTTATT
TAGGAGGAAACAAGCAGGTGTTTATGCCTCATACATGTTTGGTCCCGAAGGAAAACGTGT
AAAGGTAGTCTATATACCATGTGCAACTTTTGCTGTAAAACTTGGAAGTATTATTTTTAT
CAAAATATTTTTTCAAATAGGATGTCTCCATAGGCATACATAAACATGTTTGCGATTCTT
TCAGTCTGCACCATGTTCCCCTTTTATTCTTATGACTTGCAACCAAGTGCCATTTCATAG
GTTTCTAGAATAAATATTTTAGCTCTTCTAGTTATCCCGTCAACATTTTTTGCTTCATTA
TTTATATTCCTTACATGGAAACCCCCATCACAAGTACCATTTTTCTTTTTCAACTTATGA
CGGTGCTTATAAAACCAGTATAAAGTAGCACCCTGGCAGATATTATCAGCACCGTCATAA
GTTTTGAGTTGTTGACAGCTTCTACATGCTCTAAAATTTGTCATTTATCAGTCAAAATCA
CAAAAGTGAACCAGTGTGTTTGCAAATTTCGTTGAAGATTCCTTTTCACTATTAATTTTA
CATGCACTACAGACATTCATACATTATTACAGGTAATAATGTTGGACACCAGATATCACA
GAGAGCCACTCTTAAGTGATGGAACTATACTTGGAGATCCTCAGTGGCAGTGGCTGGAGA
GGGAGCTACATGGTCCCCCCTCAGAGATGACCATCATTGGATCTTCAATTCAGGTAAATT
TATTCTTTCACTAGTCCTAAAGCAGACACAGGGTAAACTCTGGTGGTTGTTTATCTGTTC
TTCCAACAGAAATGGATATGGGATATTGCAAAGTATGCATCTGGCCTAGGATCATGACTG
GTCATGTTGCAAACTTAACATTTTCATAAACACATTGGATTGTGCAGAAACTTAGTGTGG
TATAAGGAATTTGCAAAGTTTGGCTATACACCTTCAGTTCGTCACCACAATTTTGTGGCT
ATGATTGTTTTTAGTGAGAGAATTTGAATAATACGATCTTCCATGTGTTTTAACAGCCGC
TGAGTGAGTGCAGAAGAAGATCCTAGTCACTGACCGCCATCTTTTTGACCTTCCTTTTGG
CACTTCCATTATTAATTTATCATTATCTGTATTTGATTTTTCATTGGAGTAGCATAGAGT
AACACAACATTTTCCAATGTGTTAACGCAGGTGGTATCCAATCTTTCTGCCACCACTGGA
CCTTTGTTCTATGTGGAGTCGTGGGCACGCTTTCCGAGGGAAAGAGAACGGCTGTTTAGA
CTGATCGATAGCAGTAAGGTTGCTTACTATTACTTTACTAAAAGGCAGCCCTTCTTCGGC
ATATTCATTAGTTAAATAACTGTCATATATCACAATTTTACTTTGTTTATGACCCTGGTA
GAGGCTAGAGTTCTACCAGGTCTCGGACGTAGGTTGTAGGGG