Map Locations of contig_1564168 (4458 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_1564168

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_12817 1 815 bp AK375542 Not available Available None





CDS Structure of MLOC_12817






Contig Sequence (4458 bp)

>contig_1564168 4458 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GGGGGGGGGGGGGATGGAATTGGCCCATAATATAATGCCATTCAAGGATCACATACTCTG
GAAGTAACTTTCTAACAGTTGTTGTACGCATTTTAGCAAAAGAAGAACCCCTATGTACAG
AACGAAAATGTGAGATATAGCGATGAAAGTTGAGTCGTTCAGCTTGAATGGTCATCCCTT
CTCTCTGGAAATTTAACAAAGAAATGCATATTATTTCTCAAAGTGGTACGGAAGAAACAT
ATAAACAATGACAACATAAGAATAGAAGCGGCTTGGAAAAGATCGACACCGTCAGCATAG
AGATCTAAATTCCAACAGAAAAATATATCATAATTCATAACCCTTGTCAAGTACTGTCTT
TTTCATGATCGGAAAAAAAGGAATCAATTGCATCAATAAATTCCAGGGAAATGATGTCTT
ATAAGCTAATACTATGATGTGTCCTATAAATGAAGTAGGCGCTGACGTTTCGTTTTAAGC
AAACAAGTAGGCATCACAGGGGACACACCTGTGGAAGATCCAACATTGATTGTGAATTCG
CTCTGCCAACCTTTATCAAGGCCTCAATAGCTCTGCCTACAGATGTTGTATATTTACTAA
GAAATTTCCTAATCTCCAGTGCTGCACAAATCAACACATACGATTAGCGTAAACATAAAA
CATGCCAATGTACTGAAGAAGTAACTCAGAGCTAACAAAATCCAACAACCACATCTCAAC
CTAAAAACTGGTGCAAAAAGGCCATTAAATGGTTAGTAAATATAAATATACTAGAGAAAT
GAACACCCAATTGACCCAAATCTGGAAAATTTAGACTGCTTTATTGAGCTGGTTTTTTGT
TTGCTGGGTGCAATCATGCAACTTCATTATTCGGGATTGTGTATTATCTAACTGGTCAGA
ATAACCAAAACATACAACAGAACTCATCTCCTTTAAGCCCTCGGATCCAAATCCAAAGTA
CATCAGCATGCCAGCACACATACTTAATAATAATTTATAAGCTGGGGCCATTACACAATT
TTTAGCGCATGCATTAGTGATTTATAAATCACGATCTGTCCTAACTAAATATTGCCCGCC
TACACTCACATCCAGATTCTCCGACCTTCTAAAATAGAACTTCTCGATACCACTGAGAAG
GTACATGCTAAAGTTGTCGATTTGGTCTATAAAGCAGCTACCAATTAAATAAAGGGAAGA
TTCTCTTCTCCATACCAATCATAATTCAACAGAAGGGATAAAAGAGTGAAGACAGAATTC
ACATGCTTGTGTTACCCTGAAGTTAACTCCATGGGCATTTTATACTCTTGAGAAATAGTA
CTCCCTCCTTCCTAAACATAAGGTGTATTATTTTTTTCAAAAAGTCAAACTTCCCTAACT
TGGACCAAGCTTATAGACAAAAATATCAATATTTAGAATAGCACTAGATTCGCCATGAAA
TGTATTTTTATATTTTATATATTTAAAATTGTAAATATTTTTATATTTTGCTGTAGAATT
GGTCAAACATAGTCACCGTTTGACATTTTGAAAAACTAATACACCTTATATTTAGGAACC
GAGGGAGTATTAGATTATCTCTCGATAACTTTAAGCTAACTAGAGATCCTCATTACAAAG
TTCAAGCAAGCATCACCGTGAGATCTTGAACTGAATATACTTGGGCCTCCTTTGGTTTGG
AGGAATTCTATAGGATAGGATTCTTATAGGAATTTTTCCTTTAGAGCCCTTTGATTCATA
GGAATGGATTCCTATTCCTACACAGGATTGATTCCTATCCTCGACATTTCAAAGGAAAAT
AAACATTAGCCTAGACTCAATGGAAAAATCCCTATTATGTGAACCAAATGGCATCTCTTT
TCCTATTTCTAGTCATAGGATTTGAGATACATGTCATCTCATTTCCTACAAGTTATCTAT
TCCTGTGATAATCATATCCTTCCTATGAACGAAAAGAGGCCATAAACAATTCAAGGATAT
GCAATACTCCCTCCGTTCCAAAATATAAGGTGTATTAGTTTTTTCAAAAGTCAAACAGGT
GCATGTTTGACCAAGTTTCTAGAAAAATATATCAATATCTACAATGCCAAATTTATATCA
TTTGATCCATCATTAAGAGTATTTTCATATTTTATAAATGAGATATTGCAGATGTTGATA
TTTTATTCTCTAATCTTGGTCAAATGTACGAATGTTTGACTTGCACAAAAGTTGATACAC
CTTATATTCTGGAATGGATGGAGTATTACTTATAGCTGCGAGTGCAAATTCCAGTTGCCA
TCCAGCCCTCTTAAAAGGTTCTTTTCATGGTCCAGTTAAACATTATTCTAGATATTTGTC
AATGAATTGTATGGTTTCACCTCAGAGCACAACTCCAGAGAATTAGGATACTTGCAGCAG
ATCACAATTCACTTTGAGAGCTAGTTGGGTGAATGTGTCAGGCAAGGTGTGCTTGTTATT
GCATGATCATTAATGCGTCAGTGAAAAATTCGTTGTACTCTGGATAAAATCTCTGAAAAA
GAACCGAAAGAAGAATCTTGGAAATGAACCAAACTAAATCAAGTGCACAGAACACATGCT
TCATATTTTAACCAGTAAATACAATATAAATTTGTAATTCCAACAACGCTTCACATATCA
ACCTATATATTATCACGAAAGGATCTTGATATTCCAAGAGCCCAAAATAATTATGGTACA
CTTCTAAACAGATCCAATTGTTATGGAACCATACGATCAGCAATTAGATCCTCATGTGGA
AAAAATCACATGCATGTACGCATAAACTAATGCTTTTTGGTATAAAACTTGAGTAGAATA
AACATACAGCTATTGAGTTCAAAGCTTTTATTCTTCGTAATCTCTTCCATAATTAAACGC
TTAGACTTTTGCAACCAATCTTGAATCCTATCCTGCAAATATAAAAGAAAACTTCAAGAA
ATAAGGGAGATAGAAGAATCAAAAATTGCCCCAAGAAAATACTGGGACTAACATCAACAT
AAGACACCAAAACAACAGCATAAATCATGTGTAACCCTTTTGTGTTGTATAAAAGTGTTA
TGGGCATGTGAGACACAAGTATGGACCTCTAAACTCTGGTAAATATGGTTTTGCTCCTCC
TCTTAATAAAGGATGTGCAAAATATGCTTGTTTGCGCCTTCGGAGAAAAAATTGTCCAGT
CTATTTTCTCAATATTGTATTTATATAGGGAGCGATGTTGAAATAAGTAGTAAATAGGAG
AAATAATTCAACATCACAGTAGACAAGTAAAACACTATTGCGAATGTGGAGTGACGAAGA
AGAATAAAATAGTACTCCCTTTGTAAACTAATATAAGAACTTTTAGATCACTACTTTAGT
GATCTAAAAGTTCTTATGTTAGTTTACAAAGGGAGTACTATTTTATTCTTACTTTAGTGA
GCTAAAATATCTTATATTAGTTCACAGAGGGAGTAATTTAGAAAATCATAATGATATTAC
TGTTATTGTTCAATAGAACCACTTGTCCAACAGAAATAAACAAGGGAAGCTCGGTAACCT
TAAGAAAAACTGTGATCAGGTGCCCAGGCAAGAGTGCTTCTTGGAATTGAAGTGCATCTG
GATTATCAGGTGACGTAGTTTGATCAACAAGAGCATAGAGTTTCTGCAGCATAAATCTAA
TGCAAGAAAAGGAAAGAAACACATATGGTTAAAAGTAGTCAAAAGGACAGAAATTTCATG
ATATGCTAACAAAATTTCAACTTACATTAAAAGATTAAATTTTGCATGGTTATCATTTTG
CAGGTGCACGAGAATATAGTCCTTGATAACTGCCTCAGCAACCTAAACAGTGTGGAATGA
CCAAAGTGAAGAAAGATCCAAATATTAACACATGCAAACAAAAATAAAGAAAACACTCAC
GGTTTCATAATCATCTTTTTCAAATCCTTCCATTGCAGACCGAAAGTACTTGCCTGCATT
TGAGAGATCATTAACAATGTCAACAAATAAGAGGGCTTGAAGATATTATAATGCAAAATA
AATATATCAAAGTACCAATATGCACCAAGCATTGCGTGCGTGTGAAAAGGGACAGAGCTC
TGACTTCGTCAAGAATTATTTGTGTCCTTTCACCAATTAGCTGAGTGCTGACAACTCCCT
TTCCTCTTTCACGTTTATCACTGTAGCAGCATGTCAAGCTTGCAAATATTTCCCGGTCAC
TTGTATCAATAAGGGCCTGCATTGGTAGATCCAAAATCCAGTAAATGCAGTGTACTTGAA
CCAATGTTAAGGATACTTTGAACGTACCCTGGATGTATTATCTATCTTCTATAAGATAAA
AGCATGATCATTTGATAACCCAGTAACAGAGCTAAATACTACTTCCTCCGTCCGGAAATA
CTTGTCCTAGAGATGAATGTATCTAAACTTATTTTAGTTATAGATACATCCATTATATTC
ATTTCTAGGACAAGTATT