Map Locations of contig_1563965 (10686 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_1563965

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_12729 5 3198 bp MLOC_12729.2 Available Available LOC_Os01g33420.1, FRAME:-2, EVALUE:0.0, 13101.m03369 protein glycosyl hydrolase family protein 27, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_12729






Contig Sequence (10686 bp)

>contig_1563965 10686 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TGGACTCACGGGTGATCGGTCATGGTTGGTGGGCTGGAGACACTGGTATTAGCGGGCCCA
TGGTGACCGATGTGTGAGGGGGAGATTGTTGGGTTTAATCCCACATCGATTGTGGAAGAA
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AGTAGGTTCCCAAGATTATTCCCACTGTGAGAAGTCTGCAGCAAACCTCAACACATAAGT
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GTTACCCTTGTCATTCAGCTCCCACATCTGCAATTATTCATAAGTAATTATAGCATGAGT
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AGGATTTCACTACAGTAGAATGCTTTCTCTTGACTAAGGCCAAGATAATTCAAAGAAAGT
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GTGAGTAGTTTGGTTACGTACTGTAAAAACCTCTGAAAATCTAAAAGTAATTCCATCAGT
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TATATTAGCTGTGTACCTGCTTTGCATGCCATTTGCACCTGGAGAACATGAGAAGCTTAA
TCTCTGAGGCAGTCCGCCGCCGACTAGCAGATGCATCCAAACAAGAATCATTAACGTCTG
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AACGTATAGTGTGTTCATACAAATTATAACACGAGTACTTCTACATTCATAATTGGGTTG
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TGTCAGGTTTAGCGGATACCGAGAACTCAAGTGACCAGAATGTCCTGTATTCGAAGTCGT
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CACTGGATATTTTCCAGTTTACTCAATTTTGTGATGGTACAAGCTAATTTTCTTTTTCAA
GGAAAACTAGTGCATAAGTTATAAGTTATAATTCAGGAATTAAGACCATGTTAGTTGAGT
TTTTTCAAAATTAAGTATATTGAATGAGACGTGTCATATTCCAGGTCTATTTATGAAGTT
GAAGACATGAATTATCATCGTAGTCTCAATCAATGAAAACTAGCAAGCAGAGATATCCAT
AATCTACAGCAACGATCCATAGAATATTGAGTTGGTGCAAACAAAAGCAGCATGAGTAAT
GTCGCATCGTACAGTTCTTATCTAGCGTACTAAATTATTTACAGCTTCTCTTTTTGCTAA
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TTTTATGGGTCAGGCCAATATCACGAGCTGCCCATTGCCGACCATTCTCTACATAGGGTT
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AAGCATACCGTCTCAATGTCCAAGATGGGTGTGTTCGCATTAACAGCCTGTGTACTTATT
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TACCACAGGTAATCAATAACTGCATACTACCAGTAGGCAAGGGACAGAAATTTAATCAGA
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GTGGCGTGTTTGGTGGCGCAAAATTTATGTTATAACCTTTTGTGCTAATAAAATTCGAAA
GTGATCTTGTTTAATTTTTTTAAATGGCCTGTTATGATCACTCTAACACCCTTGACGATT
GGGTTGCTTGGAAGACGACACGGTTCGTGACGTCTAACCCGTGGTTCGTACGACCGGCTG
GCTCATTGCCCAGCTGACATGACAAACGGCCAGTCGTCAGGCACTCTAGTGTATGGTCCT
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GTACTTGACGTTTGGTCATTTATCACGTGCAAACGTCAGGATCCTTTACGTATGGTCATT
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GGGTTAGTCGGTTGTGCCGAACACGGACCAGATATCAGGGATCATGGCGCCTCCCATATT
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GCCAAATGTTTGGGCCTTGAAAGGTAGCTGGGTTCCCTGAAGAGCTTTATTGGGGAGGCA
GAGTCTGTGATGGAAGACAGTGAGAAGACTCCGGACAAAGCCGTGCAAAAACTCTCCAAT
TGTAAGGTAGAACTGTCACATCTTGAAACGTAGAACACCCAACTAGCGAGTGATTTCGCG
CGACGGGGTGAAGAGATGGACTAGCTCCAGGGTCTACAAAAGATGTAGTGCGACGTCTTC
CAAGATGTTCGCAATCGTGTCGATAACGTATCCAACGTATCGATAATTTATAAACTACTC
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ATTAGAACTAACCCGTATTAACGTTGTTTTCAGCAGAATTACCGTGTTATTGTTTTTTAT
GTAGAAAATAAAAATTCTTGGAATCGCCCGAAACTTTTTAACAATTTTTTCTGGACAATA
TGAGAAATACCGAAGCGAAGAACCATCGGAGGGGGCCACCTGCTGGCCACAAGCAAATAG
GGCGCGTCCACCCCCCTAATTTTACTGAAGCAAAAAACAAAAACTTAACGTCCAGTACAT
AATTTCTCTTATTTTAGTGGAGCGTCAAAAAATTCTAAAAACACAGTTTTACTATGCAAA
TTCTTTGTGTTGTCATATTTCATAACCTTTAGAGTCAGGGAAATATGGTGTTCATTCAGA
TATTTACACATTGTTCTGTTTTTGACAGTTTCTATTTTGCATGCATAGTTTGCTTGTTTT
ATTCTTTCCGTAGATTAAATTCAGCGATATAAATTATGGGAATGATATAGTATAGTAGGT
ATTATGTGAGAACAATTATTAATCTTTTCTTGGCAGTACCTAAGGGAATGATTTGTCTTT
ATTACACTAACCCGTCTCACGAAGTTCCGTTAAGTTCTGTGTGATTAAAGTTTTCATGTT
TTGGGTGAGATACCAATATGATGAGAATAAGGAGCAACATGAACCTAAGATTGGGGATGC
CCAAGG