Contig Data
morexGenes
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Map Locations of contig_1563686 (6114 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_1563686

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_12602 2 1587 bp MLOC_12602.1 Available Available LOC_Os02g52360.1, FRAME:+1, EVALUE:0.0, 13102.m05966 protein peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CYP40, putative, expressed
MLOC_12603 1 777 bp AK365148 Not available Available None





CDS Structure of MLOC_12602






CDS Structure of MLOC_12603






Contig Sequence (6114 bp)

>contig_1563686 6114 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCAGGGCGCGGGGGCGCCGGCCCGGGCCCCGGCCCCAGCGGCGGCGGCCGCCGCGGAGGT
GAGCAACCCGAGGTGCTACTTGGACGTGAGCATCGGCGGCGAGATGGAGGGCCGGATCGT
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GATCCTCAGGAGGAATCAAACGGGAGCTGGCTGCTGCAAAGAAGAAGGTTAGTTCATCGC
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GCGCCTTTTCATTGTTTCGTCTGTCACACATACTGGGAGCCGCCCGGTGAAAAACTTCAG
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TTTTGGAGGGCCCATGAACCCTACCAAAACTAACTCGTTGAACGGTGCCTGCCTTTAAGA
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TAAAAGTTGAGGTAGGTTGCAGCCAGACAACCAGAGGTGCCACACCGTTCAGGATTCAGC
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GTAAAAACAAGCATTGAGATGCAGCAAGAAGCGTGATCACAGAATGTTGGGAGTAAACAC
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GGGAACTTTTGCATTGTCTGTATGGCCAGAGTGCCGTAGCCTAGGGCGACTGCACGGGCT
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TTTTATTTGTTATCACAATTCCATATAGGCATATACTCCCCCCGTCCCAAAATAACTGTC
TTAACTTTGTATTAATTTTAGTATAAATTTGTACTAAGCTTAAGACACTTTTTT